ADN brin codant????

[tite rose]

Bonjour,

Je souhaiterai comprendre l'ambiguité "brin codant" ; "brin non transcrit" ; "brin transcrit"...
Comment déterminer qui est quoi...?

L'ARNm fait la transcription sur lequel..?

Si on me présente les deux brins complémentaires de l'ADN en me demandant de transcrire l'ARNm correspondant, comment savoir lequel des deux prendre...? Celui qui va de 3' à 5'...? (tout simplement??!)

Merci BEAUCOUP à ceux qui pourront m'éclairer sur ces quelques questions... ^^

tite rose.

[Effie]

Le brin qui subit la transcription est le brin transcrit = brin non codant (le brin codant est celui qui a la même séquence que l'ARNm, en remplaçant T par U).
la transcription consiste à synthétiser un brin d'ARNm: l'ARN polymérase ne peut travailler que dans le sens 5'-3', le brin d'ADN qui sert de matrice (le brin transcrit) est antiparallèle donc doit être lu dans le sens 3'-5'.
Si la séquence d'ADN présentée contient la séquence codant pour le début de la protéine, il faut rechercher quel codon, lu dans le sens 3'-5', donnera le codon AUG sur l'ARNm (codon initiateur de la traduction, qui correspond à la méthionine).
J'espère que ces réponses t'aideront!

[tite rose]

Olala... non j'y comprends décidemment rien.....
J'ai beau relire mes cours, et tout ce que je peux trouver a ce sujet, je m'embrouilles.....

Le probleme est que si on me donne les 2 brins ADN me demandant d'ARNm correspondant, je dois prendre lequel?? On me proposera automatiquement un brin présentant le codon méthionine...??

Car si c'est le cas, il suffit alors que j'apprenne par coeur les codont methionine, et peu importe de reconnaitre et comprendre "brin codant", "brin transcrit".. etc...
Dès que j'ai le brin avec la methionine, je ne regarde plus que ce brin là et que fais la complémentarité des bases, avec T-->U....?

Merci d'avance !!

[zimzum18]

En cas de devoir en cours c'est obliger qu'il y aura des indications pour savoir ou est le brin matrice

[pommier]

Bonsoir
Le plus simple serait d'éviter le terme brin codant et de n'utiliser que brin transcrit.
Dans un devoir, je pense que l'indication doit être sans ambiguité.

[bipbip44]

Je trouve l'annalogie avec photo\négatif pas mal pour comprendre:
Tu veux une reproduction d'une photo, donc la photo est le brin codant (identique à ce que tu veux obtenir) mais tu ne peux pas obtenir la reproduction directement à paritr de cette photo, c'est le brin non transcrit. Pour reproduire la photo, il faut transcrire le négatif (brin transcrit = brin non codant).
J'espère que c'est un peu plus clair...

[Effie]

Le probleme est que si on me donne les 2 brins ADN me demandant d'ARNm correspondant, je dois prendre lequel?? On me proposera automatiquement un brin présentant le codon méthionine...??

Car si c'est le cas, il suffit alors que j'apprenne par coeur les codont methionine, et peu importe de reconnaitre et comprendre "brin codant", "brin transcrit".. etc...
Dès que j'ai le brin avec la methionine, je ne regarde plus que ce brin là et que fais la complémentarité des bases, avec T-->U....?

Merci d'avance !!

Ne panique pas, il n'y a qu'un codon codant pour la méthionine, c'est AUG. De plus, tu as généralement dans ces exercices le tableau du code génétique!

Je ne vois pas trop ce que tu ne comprends pas dans l'appelation "transcrit" et "codant": le brin transcrit est celui qui subit la transcription, et on peut l'appeler aussi non codant, c'est tout!

Maintenant, pour être plus à l'aise dans la manipulation de ces concepts et dans leurs applications, tu peux nous soumettre un exercice et ta solution (ou tes démarches pour tenter de le résoudre), on te fera une correction. je pense qu'à partir d'un exemple concret il sera plus simple de trouver ce qui te bloque.

[tite rose]

Ouf !! Merci pour vos nombreuses réponses !!!
L'histoire de la photo m'éclaire pas mal en effet !!
Et il y a quelques phrases "choc" dans vos différentes réponses qui me font beaucoup mieux comprendre la chose...!

exple :
"le brin transcrit est celui qui subit la transcription, et on peut l'appeler aussi non codant, c'est tout!"
Ou encore le fait qu'il y a obligatoirement le codon méthionine dans un exo.

Pour la petite info, je n'ai pas de DS concernant ce theme... Mais je passe mes concours paramedicaux a la fin de semaine et ce chapitre me hante un peu...! (et je ne venais pas de S mais ES).

Donc en gros, dans les concours, soit j'aurai un exo "type bac", et a ce moment là en général les questions "tiroirs" permettent d'avancer...
Mais dans le cas des QCM, c'est souvent réduit au plus simple énoncé.

Je vous cite l'exemple qui m'a perturbé :

Dans un énoncé de QCM il n'y avait qu'UN SEUL brin d'ADN, puis on demandé la transcription ARN.
Tout betement, j'ai transcrit.
En fait, a la correction j'ai appris qu'il fallait dabord rédiger le brin complémentaire, et faire la transcription sur ce dernier...
Et c'est là que j'ai beuggé.... Comment savoir...?!

Donc j'imagine maintenant que la solution se trouve dans la découverte ou non de ce fameux codon AUG lors de la transciption... Si ce n'est pas le cas, je fais la complémentarité et alors je devrais le trouver sur mon 2eme brin..
C'est bien celà???

^^

merci !

[Effie]

Dans les concours paramédicaux:
-soit on te donne une indication sur le brin (exemple: on te dit que c'est le brin non transcrit)
-soit on te donne une indication sur la place de la séquence; par exemple, que cette séquence code pour le début de la protéine (dans ce cas tu auras un codon AUG à trouver dans l'ARNm), ou alors que cette séquence code pour la fin de la protéine (dans ce cas, ton ARNm devra comporter un codon stop).

Voici un exemple (tiré d'un concours kiné):
on a isolé un fragment d'ADN contenant le début de la phase codant du gène correspondant à une protéine humaine composée de 106 acides aminés
Brin A:ggtatgatccagcaaacctac
Brin b:ccatactaggtcgtttggatg
1) identifiez précisément le début de la phase codante du gène en justifiant votre réponse
2) écrivez la séquence nucléotidique de l'ARNm codan pour le début de la protéine
3) déduisez grâce au code génétique les 3 premiers acides aminés de la séquence de la protéine fonctionnelle

Allez, bon courage!!!

[tite rose]

Brin A: GGT ATG ATC CAG CAA ACC TAC
Brin b: CCA TAC TAG GTC GTT AGG ATG

1) Je cherche donc le codon AUG.
Donc ARN du brin a :
CCA UAC UAG GUC GUU UGG AUG
--> codon AUG à la fin...bizarre..

ARN du brin b :
GGU AUG AUC CAG CAA UCC UAC.
--> codon AUG au début..

Bon, admettons alors que le "bon" ARN est celui du brin b.

2) Alors l'ARNm codant pour le début de la protéine est :
AUG AUC CAG CAA UCC UAC

3) Les protéines seront :
Methionine - Isoleucine - Glutamine - Glutamine - Sérine - Tyrosine.


Bon, je rame un peu quand meme pour choisir le bon brin d'ADN.........
Car là, autant tout est faux...!


Merci d'avance !!

[Yoyo]

Brin A: GGT ATG ATC CAG CAA ACC TAC
Brin b: CCA TAC TAG GTC GTT AGG ATG

1) Je cherche donc le codon AUG.
Donc ARN du brin a :
CCA UAC UAG GUC GUU UGG AUG
--> codon AUG à la fin...bizarre..

Il est pas a la fin mais au debut! le brin complementaire se lit de droite a gauche (on lit un brin toujours de 5' -> 3' et les brin sont anti-paralleles). donc ca n'est pas un codon AUG mais un codon GUA!

3) Les protéines seront :

Non ce sont les acides aminés que tu cites pas les proteines.

Yoyo

[tite rose]

Olala......
Pour les protéines, en effet, me suis trompée par mégarde.

Par contre..... pour la transcription.... arf...
Donc c'est effectivement le brin B qui donne l'ARN... pour ca je me suis pas trompée...?

Dans le cas présent, concernant le brin A, vu qu'on ne m'indique pas les 3' et 5', comment je fais pour déterminer lequel va dans quel sens alors....? Car si par malchance, au lieu que le "faux" AUG se trouve a la fin mais au début, et qu'il y en a un autre un peu plus loin sur le deuscieme brin, je ne saurai lequel choisir... (sans les 3' et 5').


J'en déduis pour le cas présent que :

Brin A: 3' GGT ATG ATC CAG CAA ACC TAC 5'
Brin b: 5' CCA TAC TAG GTC GTT AGG ATG 3'

pom pom pom....!

[Yoyo]

salut

et non c'est l'inverse par convention le brin superieur est toujours orienté de 5'->3' de gauche a droite.

yoyo

[Effie]

Résumons:

- par convention, lorsqu'on te présente un ADN double brin, le brin du haut est orienté 5'-3' (donc l'autre brin qui est antiparallèle sera dans le sens 3'-5'.)
L'ARN polymérase synthétise un brin antiparallèle à partir de la matrice d'ADN, elle synthétise dans le sens 5'-3': tu dois donc lire le brin matrice (le brin transcrit) dans le sens 3'-5'. (Si au concours on te présente un brin que l'on te dit être le brin transcrit, il est orienté dans le bon sens pour être lu de gauche à droite par l'ARN polymérase).

- par complémentarité des bases, tu cherches à retrouver ce qui donnera le codon initiateur AUG sur l'ARN (tu cherches donc le codon TAC sur le brin transcrit, lu dans le sens 3'-5'). C'est donc le second codon du brin b, le brin b est le brin transcrit.

- les 3 premiers acides aminés de la protéine fonctionnelle ne contiennent pas la méthionine: la traduction commence au codon AUG, donc le premier acide aminé du polypeptide synthétisé est la méthionine. Les protéines subissent ensuite une maturation avant de devenir fonctionnelles, au cours de laquelle cette méthionine est supprimée.

Comprends-tu un peu mieux ce qu'on peut te demander au concours, et comment résoudre ce genre d'exercice?

[hussein]

Salut
je vois que tout est mélangé là c pour eclaircir
http://fr.wikipedia.org/wiki/Image:Prot%C3%A9ines.png
et Dans l 'exercice je trouve qu il est mal fait