transcription

[biscotte91]

Bonjour tout le monde, je voudrais comprendre pourquoi lors de la transcription les nucléotides ( ou le 1er seulement ) incorporé est tri phosphaté ?
merci de votre réponse

[Znomjo]

C'est la forme réactive des nucléotides, l'énergie libérée par le départ du groupement pyrophosphate PP permet de former le pont phosphodiester. En plus, d'un point de vue chimique, lorsque tu fais une laison sur l'oxygène d'un phosphate, les autres liaisons sont destabilisées puisque tu as moins d'oxygènes disponibles pour délocaliser les électrons.

[biscotte91]

ben dis donc tu m'as l'air trop fort en bio toi, merci beaucoup !

[biscotte91]

Euh.... j'ai encore une pitite question, est ce que tu sais si le surenroulement de l'ADN pendant la transcription est bien négatif en amont du site de transcription et positif en aval ?? merci

[Znomjo]

Alors les histoires d'enroulement d'ADN sont gérés par des enzymes appelées Topoisomérases. Il y en a de 2 sortes: les 1 et les 2. Les 1 surenroulent la double hélice (positif) et les 2 déroulent le brin d'ADN (négatif) comme la gyrase par exemple.

Je ne connais pas vraiment les histoires d'enroulement lors de la transcription, mais logiquement il faut dérouler les brins d'ADN pour que la polymérase puisse avancer, il y a donc plutôt enroulement négatif en aval je dirais. Après son passage, les brins se réenroulent dans le sens positif cette fois.

Je ne suis pas expert dans le domaine mais tu as du te tromper de sens car ta polymérase ne peut pas avancer si le brin se surenroule avant.

Cordialement

[orthank]

Après avoir replongé le nez dans mes cours de biologie moléculaire, il s'avère qu'en amont de la bulle de transcription le superenroulement est négatif et par conséquent positif en aval.

[Znomjo]

Ah...

Mais il y a des choses qu'il faudrait détailler pour tout éclaircir.

Etes-vous en train de dire que l'ADN se surenroule avant d'être séparé pas la polymérase?? Je ne conteste pas vos connaissances puisque les miennes sont très légères sur le sujet, mais d'un point de vue logique, ça me semble byzarre.

[biscotte91]

ben je sais pas trop non plus, je vais garder le négatif en amont et le positif en aval comme a dit orthank, et je verrai avec ma prof....

Et sur le "wobble" (appariemment flottant), vous savez si l'appariemment flottant se fait sur le 3e nucléotide du codon et le 1er de l'anticodon où bien l'inverse ?
Que d'imprécisions dans mon cours... vive la prof !!

[Yoyo]

Ah...

Mais il y a des choses qu'il faudrait détailler pour tout éclaircir.

Etes-vous en train de dire que l'ADN se surenroule avant d'être séparé pas la polymérase?? Je ne conteste pas vos connaissances puisque les miennes sont très légères sur le sujet, mais d'un point de vue logique, ça me semble byzarre.

Un superenroulement negatif reviens en fait au niveau energetique a une ouverture de la double helice...

Sinon pour le wobble c'est sur la 3eme base du codon et la premiere de l'anticodon.

YOyo

[Znomjo]

C"est justement ça qui m'étonne, ça voudrait dire que la double hélice s'ouvre après le passage de la polymérase et qu'elle se surenroule positivement avant son passage... En gros c'est le contraire de ce qui semble logique...
sur ce bonne soirée

[Jean-Luc P]

A la lecture de ce fil j'ai l'impression qu'on s'empêtre dans le vocabulaire : l'amont c'est avant le passage de la polymérase il y a surenroulement négatif (relâchement) l'aval c'est après le apssage de l'enzyme et il y a surenroulement positif.

[Znomjo]

Ok lol dans ce cas tout va bien. Désolé mais pour moi l'amont est ce qui est en haut et donc là où la polymérase est déjà passée... En fait c'est le contraire, bon bah ok je le saurai...