En biologie moléculaire, il est très courant d'utiliser le sperme de saumon dans les techniques d'hybridation des acides nucléiques pour saturer les membranes. Je me demande comment et quel est le principe de cette saturation? Est-ce de l'ADN pur qui est dans le sperme qui sert à s'hybrider aux sites vides de la membrane ?
Puis, est-ce que le "sperme de l'homme" par exemple ou n'importe quel autre animal peut servir ?)
Comment le sperme de saumon est extrait est à quel stade, coût...?
Cependant, et je peux facilement me tromper, je ne suis vraiment pas sur, je ne suis pas sur que ce soit de l'ADN qui s'hybride, imagine, si ta sonde se fixe sur l'adn du saumon .... mais c'est à verifié
concernant la récolte, je pense que c'est tout simplement pendant la fraie, au moment de la fécondation, ou alors lors de l'abattage, mais le coté industriel de la chose me fait douter sur la dernière supposition....
Allo, Stérique ?! Oui ... Ici Nétique !!!!
20/08/2008 - 21h59
Mybio
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Re : Sperme de saumon
Envoyé par t0yt0y
Oui, j'ai entendu parlé de ce sperme.
Cependant, et je peux facilement me tromper, je ne suis vraiment pas sur, je ne suis pas sur que ce soit de l'ADN qui s'hybride, imagine, si ta sonde se fixe sur l'adn du saumon .... mais c'est à verifié
concernant la récolte, je pense que c'est tout simplement pendant la fraie, au moment de la fécondation, ou alors lors de l'abattage, mais le coté industriel de la chose me fait douter sur la dernière supposition....
En principe la sonde ne se fixe pas sur l'ADN de saumon car pas de complémentarité de séquence !
Coté industriel et fabrication, ça m'intrigue un peu ! Pourquoi utiliser des spermes pour la chimie du moment où on peut s'en passer par d'autres moyens ?! Pourquoi ne pas utiliser ces spermes pour multiplier cette espèce ?
20/08/2008 - 22h22
t0yt0y
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Re : Sperme de saumon
Ca dépend de ta séquence et de ta sonde, si il n'y a pas une extreme complémentarité ... mais bon, je pense qu'il y a sur le forum des personnes plus aptes à répondre.
Pour les saumons, ne t'en fait pas pour leur reproduction, mais il me semble me souvenir que on utilise leur sperme car ce n'est pas cher et en très grande quantité !!
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21/08/2008 - 09h27
IngDr
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Re : Sperme de saumon
Effectivement le sperme de saumon est utilisé pour saturer les sites "libres" de la membrane : plus précisément, les acides nucléiques intéragissent fortement entre eux via les bases complémentaires, mais peuvent aussi intéragir via des liaisons électrostatiques (dûe aux charges de la liaison phosphate, ou au cycle des bases) avec les groupements chargés des membranes. C'est bien la raison pour laquelle les acides nucléiques cibles se fixent sur la membrane (northern ou southern), on peut donc consevoir que de la même manière la sonde peut aussi se fixer sur la membrane, et pas uniquement sur les acides nucléiques complémentaires. Saturer les sites libres de la membrane empechent donc la fixation aspécifique de la sonde, et donc un bruit de fond trop important.
Une autre explication peut aussi être la saturation des séquences répétées au niveau des séquences d'acides nucléiques cibles, la encore pour éviter les fixations aspécifiques.
Effectivement, il est tres facile d'obtenir du sperme de saumon en grande quantité. Cela coute beaucoup moins cher que s'il fallait synthétiser des milligrammes.
Mais étant de l'adn, n'y a-t-il pas des fixations aspécifiques des sondes ou faut-il travailler avec une sonde à priori très spécifique de notre échantillon ?