Bonjour,
dans mes manips d'extraction et purification d'ARNm, j'ai un problème de contamination d'ADN génomique dans ma solution purifiée...
voici mon protocole général :

Microdissection laser (veritas, arcturus) après coloration avec le LCM staining kit arcturus.
Extraction avec le kit de purification Picopure Arcturus, avec un extraction buffer, puis sur colonne Picopure. Ils proposent de faire un traitement de DNAse Qiagen directement sur la colonne (10µl de DNase + 30 µl de tampon RDD (tampon de l'enzyme).
Une fois ma colonne rincée, et éluée, et l'ARN récupérée, je contrôle mon ARN sur une puce Pico pour Bioanalyzer Agilent.
Et la, mon RIN n'est pas fantastique, et on remarque de l'ADN génomique (bosse à droite du 28S, et bruit de fond élevé).
j'ai essayé de faire un 2eme traitement à la DNase Ambion, mais il me reste toujours de l'ADNg.

Quelqu'un aurait-il de l'expérience avec les traitements à la DNAse qui foirent ?
Merci pour tous vos retours d'expérience. A bientot.