vérifier pureté d'un produit de qPCR : agarose ou acrylamide ?

[tombio]

Bonjour à tous,
après une qPCR, peut-on indifféremment utiliser un gel d'agarose ou un gel d'acrylamide pour vérifier qu'on n'obtient qu'un seul produit d'amplification ?
je sais qu'habituellement, on utilise des gels d'agarose, mais pour diverses raisons un gel d'acrylamide m'arrangerait bien... Rationnellement, je ne vois pas de raison de préférer l'agarose (sauf que c'est un peu plus rapide), mais bon, je ne sais pas tout

Merci de votre aide !

[Flyingbike]

ben l'acrylamide est beaucoup plus pénible à mettre en place. Un gel d'agarose ça se coule en 10 min et c'est suffisant pour vérifier ta PCR.
Pourquoi vouloir faire de l'acryl ?

[tombio]

Plusieurs raisons (dans mon cas) de préférer l'acrylamide :
- facilité "logistique" (la salle à gels d'agarose se trouve 2 étages + bas...)
- meilleure résolution : mon produit d'ampli est censé faire 121 nt, et j'ai un doute sur du non-spé à +/- 5-10 bases d'écart
- et je l'avoue, + grande habitude de l'acrylamide : pas si pénible que ça je trouve ! Juste la migration qui est un peu plus longue mais ça ne me dérange pas, il suffit de faire autre chose en attendant (c'est pas ça qui manque !...)

Voilà, en tout cas merci de ta réponse.

[Flyingbike]

Alors dans ce cas...