OGM, Amflora pomme de terre

Salut à tous,
Je cherche des infos sur la patate OMG amflora, celle autorisée au commerce par Bruxelle il y a peu.
Plus précisément; des infos sur la méthode génétique et la modification précise (séquence) faites sur cette pauvre patate :-). Je connais les conséquences (baisse du niveau d'amylose par rapport à celui d'amylopectine) mais par quel processus exacte?

Il est très difficile de trouver des infos sur ce genre de points. Elles sont souvent gardée secrète par les industriels responsables du produit... J'en ai conscience mais je demande à tout hasard.

Merci d'avance.

Très bonne journée à tous.

Ben.

Si la modification fait l'objet d'un brevet (et je suis prêt à le parier) tu vas avoir du mal à trouver ces infos.
[url]http://report.basf.com/2009/q2/en/servicepages/downloads/files/other_topics_basf_ir209.pdf[/url]
Tu as une info, ils auraient rajouté un gène

D'après les informations que tu me donnes (sans aucunes certitudes) je te dirai que la méthode de modification génétique est certainement via une infection par [I]Agrobacterium Tumefascience[/I], qui est très facile d'utilisation pour permettre l'insertion de gène étrangers. Quant à la séquence utilisée je ne la connais pas.

Etant donné que la différence principale entre l'amylose et l'amylopectine est la présence ou non de ramifications en beta-1-6 on peut imaginer qu'une amyloglucosidase serait concernée. (éventuellement un simple knock-out)

Je ne suis pas callé du tout en biologie végétale, mais on peut faire un KO via [I]agrobactérium[/I]?
J'imagine que oui, en pariant sur l'insertition d'un transgène dans le gène codant pour la cible, mais ca me semble quand même très aléatoire comme stratégie. Le crible doit être chiant à souhait et on est pas certain que ca sera propre au final.

Cordialement,
piwi

On pourrait utilise la même méthode que pour une souris non:conf: Je remplace X par Y+ gène de résistance à antibiotique?

Balancer un gène de résistance à un antibiotique dans la nature ? Hautement improbable que ça soit mis sur le marché. Ta souris reste dans un milieu controlé donc ce n'est pas grave. Assurer que le gène ne sera pas diffusé dans la nature et rende des bactéries résistantes est impossible ou presque

Muter une souris en infectant un cal avec [I]Agrobacterium[/I]? :S:

Plus sérieusement, c'est une des techniques qui était utilisée au début dans la mutagénèse dirigée par recombinaison homologue. On introduisait un gène de résistance à la néomycine dans la séquence codante pour casser la phase de lecture et permettre un moyen de sélection des clones. Ca ne se fait plus trop je crois, simplement parce que l'on ne souhaite pas conserver le transgène neomycine.
D'ailleurs je trouve curieux qu'ils aient trouvé judicieux de conserver le transgène dans la patate Amflora. D'un point de vu expérimental, retirer les marqueurs de sélection est plus propre (encore faut il avoir prévu le coup dans la construction au départ). En plus c'est préter le flanc à toutes les critiques qui disent que l'on disseminer un gène de résistance à un antibio dans l'environnement.

Cordialement,
piwi

Bonjour,

Wikipedia est souvent un bon point de départ : [url]http://fr.wikipedia.org/wiki/Amflora[/url]

je cite :

"Il y a eu des débats publics, car Amflora contient un gène marqueur de résistance (nptII), qui est connu comme un gène de résistance à un antibiotique médical, la kanamycine. En vertu de la règlementation européenne, la commercialisation de plantes génétiquement modifiées ne peut être autorisée que si elles ne comportent pas de gènes de résistance à des antibiotiques ayant une importance médicale. La Commission européenne a donc décidé en mars 2007 de demander à l'Agence européenne des médicaments (EMEA) un avis consultatif sur les risques de résistance à la kanamycine .

Sur la base de cet avis, concluant entre autres que le transfert de la résistance des plantes transgéniques à des bactéries était hautement improbable, que le gène nptII était déjà largement répandu dans la nature et présent chez la plupart des bactéries intestinales et la résistance à la kanamycine omniprésente dans l'environnement, l'Agence européenne de sécurité alimentaire (EFSA) a confirmé en avril 2007[2] qu' 'Amflora est sûr pour l'alimentation humaine, animale et pour l'environnement[3]."

Salut

Je sais pas comment ils ont fait, mais je signale juste que l'insertion du transgène avec Agrobacterium est aléatoire. Donc difficile de faire un KO avec.

Les banques de mutants faites avec Agrobacterium, c'est uniquement l'insertion aléatoire du T-DNA, et après faut rechercher où ça s'est passé.

Donc non, avec cette technique de transgenèse on ne remplace pas un gène par un autre. D'ailleurs, c'est le genre de chose qui nous fait rêver.

Il y a pas longtemps il y a un papier qui montrait qu'ils avaient réussi à faire de l'insertion plutôt dirigée si je me rappelle bien, mais à mon avis c'est encore expérimental.

En y réfléchissant, c'est vrai que c'est assez limite quand même non? Les épandages massifs d'antibiotiques sur les cultures et leur utilisation en agriculture ont déjà posé d'énormes problèmes et maintenant ils utilisent directement les gènes de résistance...
Après, c'est probablement moins grave, puisque qu'on introduit pas de pression de sélection sur les bactéries. Mais y a rien à faire, ça me chiffonne un peu, pas vous?

Bonjour à tous,

Est-ce qu'on ne peut pas imaginer une introduction de la séquence mutée à la place du gène d'origine par recombinaison homologue, comme on le fait chez les souris? Toujours avec le marqueur de résistance pour sélectionner.

[QUOTE=jgiovan;2873690]Bonjour,

Wikipedia est souvent un bon point de départ : [url]http://fr.wikipedia.org/wiki/Amflora[/url]

je cite :

"Il y a eu des débats publics, car Amflora contient un gène marqueur de résistance (nptII), qui est connu comme un gène de résistance à un antibiotique médical, la kanamycine. En vertu de la règlementation européenne, la commercialisation de plantes génétiquement modifiées ne peut être autorisée que si elles ne comportent pas de gènes de résistance à des antibiotiques ayant une importance médicale. La Commission européenne a donc décidé en mars 2007 de demander à l'Agence européenne des médicaments (EMEA) un avis consultatif sur les risques de résistance à la kanamycine .

Sur la base de cet avis, concluant entre autres que le transfert de la résistance des plantes transgéniques à des bactéries était hautement improbable, que le gène nptII était déjà largement répandu dans la nature et présent chez la plupart des bactéries intestinales et la résistance à la kanamycine omniprésente dans l'environnement, l'Agence européenne de sécurité alimentaire (EFSA) a confirmé en avril 2007[2] qu' 'Amflora est sûr pour l'alimentation humaine, animale et pour l'environnement[3]."[/QUOTE]
Voilà qui répond à ma question, je n'avais pas vu ce message;)

[QUOTE]Est-ce qu'on ne peut pas imaginer une introduction de la séquence mutée à la place du gène d'origine par recombinaison homologue, comme on le fait chez les souris?[/QUOTE]
J'avais posé cette question il y a quelques années à une prof et la réponse qui m'avait été donné et que ça ne marchait pas. La raison invoquée était que la membrane cellulosique posait problème. Je ne sais pas si cette limite a été levée depuis. Je pense que non, puisque l'on ne fait toujours pas de recombinaison homologue chez la plante.

Cordialement,
piwi

Bonjour,
Si mes souvenirs de génie génétique sont bons, quand la plante est cultivable à partir de cultures cellulaires, on peut prendre des cellules, les débarrasser de leurs parois cellulosique (protoplastes) et utiliser l'électroporation ou le bombardement avec des microbilles chargées d'ADN pour intégrer de l'ADN, ou encore la microinjection... Cette méthode n'est pas super propre: aucune maîtrise du nombre de copies insérées ni de l'endroit d'insertion, taux de succès faible...

Cordialement,
K.

Oui. Ces méthodes sont connues. Le problème est dans la recombinaison homologue.