[biologie moleculaire] Logiciel équivalent à DNA strider sur PC
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[biologie moleculaire] Logiciel équivalent à DNA strider sur PC



  1. #1
    invite94612525

    [biologie moleculaire] Logiciel équivalent à DNA strider sur PC


    ------

    Bonjour,
    Est-ce que quelqu'un connait un bon logiciel d'analyse de sequences (ADN et proteines) equivalent a DNA strider (alignements, sites de restrictions, identification dORFs, etc...) mais qui marche avec un PC (DNa strioder ne marche que sur MAc) ?
    Merci
    Noun

    -----

  2. #2
    gorben

    Re : logiciel equivalent a DNA strider sur PC

    salut

    Au labo on utilise vecteur NTI (informax, invitrogene) c'est l'equivalent de DNA strider. Il peut s'installer sur pc ou mac, et il est gratuit pour les instituts publics à condition d'en faire la demande sinon je crois que la licence est à peu prés de 3 ou 4K€.

    Sinon y'a pleins de trucs sur le net gratos et trés performant.

    A+

  3. #3
    Bertrand

    Re : logiciel equivalent a DNA strider sur PC

    J'utilise personnellement le logiciel ApE (A plasmid Editor) qui est très performant et multiplateforme. Bien entendu il est gratuit. Je n'ai pas l'adresse en tête mais vous la trouverez facilement avec les mot clé "a plasmid editor" sous google.

  4. #4
    Jean-Luc P

    Re : logiciel equivalent a DNA strider sur PC

    Pour les alignements :

    clustalw
    genedoc
    bioedit

    pour les cartes de plasmides :
    Ape
    pDRAW32 (beerware)
    Jean-Luc
    La violence est le dernier refuge de l'incompétence.
    Salvor Hardin

  5. A voir en vidéo sur Futura
  6. #5
    invite9e6bc039

    Re : logiciel équivalent à DNA strider sur PC

    Vector NTI est gratuit depuis qq annees, tres utile pour designer ses clonages...

  7. #6
    inviteecb0ae88

    Re : logiciel équivalent à DNA strider sur PC

    Bonjour,

    Es-ce qu'il est possible d'utiliser gratuitement Vector NTI en tant qu'étudiant réalisant un stage dans un laboratoire ne disposant pas de compte online chez Invitrogen ? Après avoir créer un compte personel (car j'ai vu que normalement c'est gratuit pour les instituts de recherche public mais le labo dans lequel je suis n'a pas de compte online) invitrogen me facture la licence a 44 € ?

    Ici tout le monde utilise des Mac avec DNA strider, et j'ai un PC

    Merci d'avance,

    Jérôme

  8. #7
    gorben

    Re : logiciel équivalent à DNA strider sur PC

    Salut,

    Je comprend pas bien la difference entre un compte online et un compte perso dans ton cas. Pour avoir la licence, il suffit de t'enregistrer sur leur site, de remplir les 3 ou 4 pages d'infos puis de commander VNTI. La si tu ne rajoute pas le manuel ou autre chose du style, la facture est de 0 euro et ils te donnent une clefs directement. Je ne sais pas ou tu es en stage, mais le systeme de reconnaissance des mails d'invitrogen attribue la licence gratuite automatiquement aux adresses *.gov ou *.edu.

    Pour une adresse bien francaise en *.fr, faut les appeler pour leur dire que tu es bien dans un institut gouvernemental a but non lucratif...

    A+

    PS : Ne demande pas la licence a titre perso, mais au nom du labo...

  9. #8
    inviteecb0ae88

    Re : logiciel équivalent à DNA strider sur PC

    Effectivement je pense que le problème vient du fait que mon adresse mail se termine en .fr, je vais essayer de les contacter demain pour régler cette affaire.

    Merci encore pour ta réponse,
    A bientôt,

    Jerome

  10. #9
    invitedb7ba594

    Re : [biologie moleculaire] logiciel équivalent à DNA strider sur PC

    Vector NTI est désormais payant
    Je propose vivement un boycotte (quoi que vu le prix, y en auras certainement pas besoin...)

  11. #10
    invite8e2a3fe6

    Smile Re : [biologie moleculaire] Logiciel équivalent à DNA strider sur PC

    Vector NTI n'est plus gratuit en effet. Un excellent equivalent de DNA strider 1.4f14 (OSX) est serial cloner vrs 2 qui tourne aussi bien sous windows que sous OS-X
    http://serialbasics.free.fr/Serial_Cloner.html

    bon clonages

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