Question calcul du pHi d'un peptide
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Question calcul du pHi d'un peptide



  1. #1
    pitchou1308

    Question calcul du pHi d'un peptide


    ------

    Bonjour,

    J'ai calculé le pHi des acides aminés contenus dans des peptides.
    Pour connaître le pHi du peptide, suffit-il de faire la moyenne des pHi des acides aminés qu'il contient ?

    -----

  2. #2
    Resartus

    Re : Question calcul du pHi d'un peptide

    Pour ceux composés d'acides sans acidité latérale, il me semble plus logique de prendre la moyenne des deux pka "libres", c'est à dire ceux des extrémités. Cela va donner un résultat différent selon l'ordre des acides à l'intérieur du peptide
    Idem s'il n'y a qu'une acidité latérale, où on doit pouvoir calculer le pKi à partir des 3 pka selon la méthode applicable aux acides

    Il doit quand même y avoir quelques effets de bord qui modifient les pka, selon la conformation du peptide.

    A partir de deux acidités latérales, cela va faire des équations compliquées, qu'on peut sans doute résoudre numériquement, mais les effets de bord doivent être encore plus importants
    Dernière modification par Resartus ; 02/03/2016 à 12h36.

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