Alors, tout dépend de l'IUT.

En général, oui, il faut deux dossier différents pour chacune des fillières et donc logiquement, deux lettres de motivations différentes!

Mais attention, même si ce ne sont pas les mêmes personnes qui regardent les dossiers selon les sections, il arrive qu'ils établissent des relations entre les différentes sections et trouvent ainsi ta "double candidature", ce qui ne jou pas forcément en ta faveur (même si la pratique est très courante)

L'astuce que l'on ma souvent conseillée et celle de dire "cash" dans les deux lettres de motivations que tu as postulé pour les deux spécialités car elles t'intéresses tout autant et sont en continuité avec ton projet professionnelle etc.
En revanche, il faudra bien que tu tranches pour une des deux en spécifiant "celle-ci est mon premier souhait etc..."

Bref, tu vois ce que je veux dire, le but est de leur montrer que ces deux sections t'intéresse tout autant et que tu as la chance que cet établissement les proposes. Néanmoins tu préfère celle-ci a celle-là car etc...

Mais fais bien attention à faire des lettres de motivations différentes en fonction des sections, mais jou la franchise.

Une autre tactique consistes a faire "comme si de rien n'était" ... fais des lettres complètement différentes, comme si tu postulait pour une seule des spécialités.
Ne t'inquiète pas, cela ne te pénalisera pas, ils ont l'habitude de faire face a des doubles candidatures dans des fillières assz proche!!

Et puis, tu as de la chance car ca ne posera aucun problème pour toi : entre génie bio et chimie ils comprendront ce que tu veux faire et te donneront ce que tu préfère.

En revanche, quelqu'un qui demande chimie et informatique...je penses qu'ils commencent a se poser des questions =)

Pas d'inquiétude a avoir donc !