euh, je pense que tu fais une petite erreur Annaick sur la stringence de la PCR par l'augmentation du MgCl2. Si tu augmentes sa concentration, la PCR deviendra plus permissive aux réactions non spécifiques. Si tu veux augmenter la stringence de ta PCR pour diminuer les Dimères, il faut tester la diminution de la concentration en MgCl2, augementer la température d'hybridation de ta PCR, ajouter une sonde TaqMan et lui donner la concentration la plus faible possible pour ton système.
En effet, les dimères peuvent être embetant pour une réaction, mais encore faut il savoir quelle est la quantité de dimère produit, sa taille approximative (estimation grossière par courbe de fusion) et voir si ta cible est en faible quantité ou pas. Si tout ceci n'est pas dommageable pour ta PCR, et si derrière tu colles une sonde TaqMan, il n'est pas utile forcément de trouver le couple d'amorces idéal... et tu pourrais garder celui ci.
Bon courage en tout cas.


