Vidéos sur la réplication!

[invite5351d78c]

J'ai trouvé ces supers videos sur la réplication. En fait ces quatre videos sont le même évènement mais pris sous différents angles. C'est ce qui se rapproche le plus de la réalité. Les connaisseurs reconnaitront les différentes sous unités et protéines, mais faut s'y prendre à plusieurs fois!

Les commentaires sont les bienvenus!

A+.

[invitec9f0f895]

salut

merci pour ces films, mais juste une question ils sont libre de droits? il est possible de les afficher sur le forum?

YOyo

[invite5351d78c]

Oui tout à fait car je les ait trouvé grace à google,c'est une université australienne qui les diffuse. Mais j'ai décidé de montrer la réplication arbitrairement car en voyant le mécanisme réel, on s'imagine mieux comment se déroule ce mécanisme qui nous semble assez simple quand il n'est pas expliqué en profondeur. Mais là on voit toute sa complexité.

Voilà le lien de la page où il y a toute les videos, en passant notamment par la formation d'un complexe d'initiation de la transcription :

Vidéos

Finalement on était partit pour 4 videos sur la réplication mais avec ce lien, c'est une dizaine de videos qui vous attendent!!!

[invitec9f0f895]

merci pour cette reponse. Elles sont superbes en effet ces videos.

Yoyo

[A voir en vidéo sur Futura]

[invite6db66ef2]

Oui, merci beaucoup !
Dommage que je n'ai pas eu ces vidéos un peu plus tot, ça complemente très bien mes cours du premier semestre

[invite5351d78c]

Salut,

Au fait est-ce que vous avez reconnu toute les protéines impliquées dans la réplication : Le complexe MCM 2-7 (hélicase), la DNA polymérase alpha, le RFC, le facteur beta, la DNA polymérase delta. Par contre je ne vois vraiment pas quelle est la protéine centrale qui lie toute les protéines et qui les organise durant la réplication. Finalement je me demande si ce n'est pas le RFC mais d'après les descriptions que j'ai toujours eu sur ce facteur, il ne serait pas sous cette forme. Ici, on dirait plutôt une protéine apparentée au facteur Tau des bactéries, vous trouvez pas?

Sinon c'est dommage qu'ils n'est pas pu faire entrer la topoisomérase 1 dans cette vidéo, ça aurait finit de compléter le schéma, et pourquoi pas en plus les DNA ligase et RNase H pour les fragments d'Okasaki. Mais après je pense qu'ils n'auraient pas pu zoomer autant sur le complexe principal.

[invite8f0c515e]

C'est quoi le truc vert qui se fixe succintement sur l'hélicase?

[invite5351d78c]

Salut!

Tu veux plutôt dire le truc marron-vert je pense. C'est la polymérase alpha (plus couramment appelée primase) qui est une RNA polymérase DNA dépendante. Elle se fixe sur l'hélicase (complexe MCM2-7) pour synthétiser une courte amorce d'ARN sur le brin lagging (brin tardif). D'ailleurs je sais pas si t'as remarqué mais l'amorce d'ARN synthétisée apparait en jaune, et à peine synthétisée, on a repliement du complexe central, fixation du PCNA (vert flash) sur l'amorce et basculement sur la pol delta du brin lagging.

Sinon après le truc vert qui se fixe sur la protéine centrale (d'ailleurs je voit toujours pas laquelle c'est, peut être RFC) et qui chope le brin lagging séquentiellement, c'est le PCNA, le facteur de processivité. Et en violet, c'est notre bonne vieille polymérase delta, qui est toujours la même et reste fixe sur le brin lagging, contrairement à ce qu'on peut imaginer quand nous apprend la réplication .

Les autres vidéos sont pas mal aussi, surtout la coupure par EcoR1 et ligation par la DNA ligase.

[invite8f0c515e]

Merci ! Ouai en fait je m'en suis rendu compte apres que c'étais la primase, mais c'est vrai que c'est dur de s'y retrouver dans cette machinerie. Quand je vois les poly de la prof, ça me fait marrer. Et ouai effectivement j'ai cru au départ que la polymérase c'était le truc vert flashy vu que sur mes poly, il y a autant de polymérase utilisées sur le brin tardif que de fragment d'Okasaki. On nous cache des choses, c'est pas bien ! Et donc le facteur de processivité est vert et sert à "huiler" la mécanique si je comprend bien.
Ya aussi le petit train qui est marrant en vidéo (transcription)
A+

[invite8f0c515e]

Ah oui derniere question. La protéine du bas en violet clair sur laquelle se fixe le PCNA c'est quoi? Et ça sert à quoi? Juste à fixer le PCNA et à l'ouvrir puis le refermer sur l'amorce d'ARN?
Vielen danke

[invite5351d78c]

Bein justement je vois pas trop. C'est comme la protéine centrale qui permet la cohésion du système je vois pas trop laquelle c'est. Les bactéries ont une protéine centrale qui s'appelle Tau et il se pourrait qu'on ait là l'homologue de Tau chez l'eucaryote. En tout cas c'est sûr que le PCNA intéragit avec RFC mais les schémas sont pas très clairs. Donc je suppose que le truc violet comme tu dis est le RFC. Mais après le truc bleu clair qui a des espèces de bras faisant les allers retours du brin lagging...je vois pas du tout. C'est pêut-être aussi le RFC mais alors je le pensais pas du tout aussi gros et important par rapport aux descriptions.

Encore une chose : cette vidéo a été faite à partir de l'état actuel des connaissances (état de l'art), il se peut donc que les infographistes ait modélisé le complexe pas tout à fait exactement comme on peut le retrouver dans la réalité, sans parler des simplifications (pas de topo, pas de RNase H, pas de DNA ligase, pas de RPA et sans doute beaucoup d'autres..).

A+ et ravi que ça te plaise!