[génétique] Besoin D'aide Pour Arbre Génétique...

tite rose · 08/03/2007, 16h58

Bonjour,

Je suis toute nouvelle sur ce forum et j'ai grandement besoin de votre aide !

Je suis en prépa paramedical et je vais passer les concours de podo et psychomot.
Le probleme, c'est que je ne comprends pas comment fonctionnent les arbres généalogiques génétiques... et pourtant il y a de nombreux exercices dessus...

Pouvez-vous m'éclairer un peu..??

Les arbres "simples", ca va, je comprends. Mais dès qu'il y a plusieurs générations, ou il faut déterminer comment se transmet la maladie... la c'est une horreur...!

Y a-til une ou des astuces??!

Merci beaucoup beaucoup beaucoup pour ceux et celles qui pourront m'éclairer un peu....

BioCell · 08/03/2007, 17h24

Salut,
si tu as un exemple d'arbre sous la main, tu peux l'envoyer pour une explication pas à pas.
Ca serait plus facile je pense que d'expliquer dans le vide.

tite rose · 08/03/2007, 18h11

Bonjour, merci de me répondre, voilà le lien vers des annales. L'exercice avec son arbre est tout a la fin.

Merci par avance !

http://www.etudiant-podologie.fr/index.php?option=content&task= view&id=809&Itemid=97

BioCell · 08/03/2007, 19h47

Voilà ce que je dirais:
Tout d'abord, déterminer si la mutation est récessive ou dominante.
Famille A: les parents 1 et 2 sont sains et ils ont des enfants atteints, donc mutation récessive.
Ensuite, déterminer si la mutation est autosomale ou liée au sexe.
Dans le texte, on te dit que cela touche surtout les garçons, donc à priori plutot porté par les gonosomes. Ca ne peut pas etre sur Y car tous les garcons seraient malades. Donc c'est sur X.
A ton tour avec la famille B!

Effie · 09/03/2007, 12h08

Ce type d'exercice tombe effectivement très souvent, mais l'analyse est finalement toujours la même:
- l'allèle responsable de la maladie est-il dominant ou récessif? Pour cela, il faut repérer si des parents sains peuvent avoir des enfants malades.
- le gène est-il porté par un autosome ou un gonosome? Ce qui revient à chercher un lien éventuel entre le sexe et la présence de la maladie. Lorsque la maladie est liée au sexe, il faut faire 2 hypothèses: 1) porté par le chromosome Y 2) porté par le chromosome X. Pour tester les hypothèses, il faut faire des échiqiers de croisements.
- pour les calculs de probabilité d'avoir un enfant malade: il faut déterminer le génotype des parents (ou les génotypes possibles, avec leur probabilité) et faire un échiquier pour déterminer les phénotypes possibles dans la descendance et leur probabilité.

Ces analyses font appel à la logique et à quelques principes très simples de démonstration, genre "si je trouve dans l'arbre un cas où le gène ne peux pas être porté par Y, alors je rejette cette hypothèse".

Allez, on attend tes réponses pour la fin de l'exo!

tite rose · 10/03/2007, 23h37

Coucou !

Merci a vous deux pour vos réponses !!!
Depuis je me suis vraiment plongée dans le probleme et j'arrive plutot bien a me dépatouiller...!
Finalement, il me fallait surtout un point de départ : il faut regarder tel truc desuite.
Par exemple, pour déterminer si une maladie est récessive ou pas, d'entrée il faut regarder si elle saute ou pas des génération, et ca aide pas mal...!
Bref, a force de recherche a droite et a gauche et de vos aides, je me dépatouille !!

Merci beaucoup !!

Néanmoins, j'ai besoin encore de votre aide !!

J'arrive a faire un échiquier de croisement pour les chromosomes autosomals, mais pour X et Y je bloque.
En effet, si dans une case on mets :

homme : X l Y

dans l'autre on mettra :

femme : X l X

Et j'ai comme l'impression que c'est pas ca !!!

Comment déterminer les probabilité avec ca...?!!

Merci d'avance !!

Et merci pour vos précieux conseils !

BioCell · 11/03/2007, 10h32

Salut,

pour les gonosomes, c'est pareil que pour les autosomes.
Supposons qu'une femme soit porteuse saine de l'hémophilie (h). Si tu mets le père en horizontal et la mère en vertical, tu as:
___X____Y
X XX____XY
X_h XX_h _ X_hY

Donc une chance sur 4 d'avoir un fils malade et 1 sur 4 d'avoir une fille porteuse saine.

(Les tirets sont pas hyper esthétiques, mais sinon j'arrive pas à mettre mon tableau en forme).

tite rose · 11/03/2007, 15h29

Ah bah alors..... Ca me paraissait bizarre mais effectivement... ils ont 50% de chances d'avoir un garcon ou une fille, et 1/4 de probabilité pour que l'un ou l'autre soit malade...

C'est plus simple que je ne me l'avais imaginer alors !!

Merci beaucoup !!

Bon maintenant il me reste a apprendre par coeur tous les % de Mendel... ca va etre bien chiant.... Mais j'imagine que c'est la seule solution pour réussir des exo de type : on croise une souris blanche a poil long avec une souris noir a poil court.. etc etc.... Mieux encore avec les drosophiles !!

Rah lala....!

Enfin merci beaucoup !! Je viens d'avancer d'un GRAND pas!!

tite rose · 11/03/2007, 15h54

PS !

Et une ptite question encore !

Concernant les calculs de distances entre gène... Pour les sordoria, ca va, c'est facile.
Mais quand on nous demande ca pour les hommes.... comment faut-il faire...??
Quelles sont les étapes à faire pour y parvenir..?
Quelles est la formules..??

Merci d'avance !

tite rose.

Effie · 11/03/2007, 16h17

Pour la distance entre les gènes, tu ne la détermines pas à partir d'un arbre généalogique mais à partir de croisements; lorsque deux gènes sont liés (sur un même chromosome), il y a chez un individu hétérozygote des crossing over qui s'effectuent et qui permettent de former des gamètes que l'on dit recombinées. Lorsque que tu fais un croisement test (càd un croisement avec un double homozygote récessif), tu vas observer des phénotypes dans la descendance qui sont représentatifs des gamètes transmises par l'hétérozygote. Le pourcentage de phénotypes recombinés dans génération obtenue est représentatif du nombre de crossing over, donc de la distance entre les deux gènes, que l'on exprime en centimorgans (cM): x% de recombinaison = x cM entre les gènes.

Je te donne un exemple d'exercice, avec des questions pour te guider dans ta démarche:
On considère 2 gènes, chacun possède deux allèles: A et a, et B et b.
Tu croises un individu de phénotype [Ab] avec un individu [aB]. La génération F1 obtenue comporte 100% d'individus [AB].
Détermine ce qui est dominant et récessif, et si les individus sont homozygotes ou hétérozygotes
Tu effectues un croisement test avec un individu F1. Tu obtiens en F2 40% de phénotype [Ab], 40% de phénotype [aB], 10% de phénotype [AB] et 10% de phénotype [ab]
Teste l'hypothèse "les gènes sont indépendants". Quelles proportions de phénotypes obtiens-tu en F2? Tu en déduis que les gènes sont liés: fais une représentation des chromosomes des parents et des F1, tu visualiseras mieux ce qu'on appelle non recombiné (sans crossing over) et recombiné. Détermine donc le génotype des individus F2 ayant un phénotype recombiné, et détermine la distance entre les gènes en te servant du pourcentage de ces phénotypes.

Bon courage!

tite rose · 11/03/2007, 16h48

On considère 2 gènes, chacun possède deux allèles: A et a, et B et b.
Tu croises un individu de phénotype [Ab] avec un individu [aB]. La génération F1 obtenue comporte 100% d'individus [AB].
Détermine ce qui est dominant et récessif, et si les individus sont homozygotes ou hétérozygotes

--> A et B sont les allèles dominants, et a et b les récessifs. Les individus F1 sont donc tous hétérozygotes [AB/ab].

Tu effectues un croisement test avec un individu F1. Tu obtiens en F2 40% de phénotype [Ab], 40% de phénotype [aB], 10% de phénotype [AB] et 10% de phénotype [ab]

--> D'apres mon court, il ne peux s'agir d'un cas de genes liés car sinon il aurrait 1/2 de [aB] et 1/2 et [Ab].
Il ne s'agit pas non plus d'un cas de gènes indépendants car sinon il aurrait 1/4; 1/4; 1/4; 1/4.
Donc il s'agit de gène partiellement liés avec une majorité de [Ab] et [aB]. Le pourcentage de génotype restant est donc de 20%.

--------> Un des deux genes se trouvent a 20 ucm du centromere.
L'autre a 80 ucm (??).
Donc la distance entre les deux et de 80-20 = 60.

La distance qui séparent les deux gènes est de 60 ucm.

Est-ce que c'est bien ainsi...???????!!

tite rose · 11/03/2007, 16h56

ben non c'est pas possible puisque l'unitée centi morgan s'évalue entre 0 et 50.....

tite rose · 11/03/2007, 17h00

Serait-ce alors.....

les 20% refletent les gènes recombinés.

Donc on applique a la formule de sordoria :

d= 1/2 ( 20/100) x100.

donc

d= 1/2 (0,2) x 100

d = 10.

La distance entre les genes est de 10 ucm.

.... muef, ca me laisse perplexe...!!

Effie · 11/03/2007, 17h54

Je reprend tes réponses:

A et B sont les allèles dominants, et a et b les récessifs. Les individus F1 sont donc tous hétérozygotes [AB/ab].

c'est juste, mais au concours:
- le correcteur doit suivre ton raisonnement (la génération F1 est homogène dont les parents sont homozygotes. Les individus F1 sont hétérozygotes, ils expriment les allèles dominant, donc A est dominant par rapport à ...)
- les génotypes s'écrivent entre parenthèse, les phénotypes entre crochets
- à ce stade, tu ne sais pas encore si les gènes sont liés ou non, or l'écriture du génotype est différente pour des gènes liés (Ab//aB) et indépendants (A//B, a//b)

--> D'apres mon court, il ne peux s'agir d'un cas de genes totalement liés car sinon il aurrait 1/2 de [aB] et 1/2 et [Ab].
Il ne s'agit pas non plus d'un cas de gènes indépendants car sinon il aurrait 1/4; 1/4; 1/4; 1/4.
Donc il s'agit de gène partiellement liés avec une majorité de [Ab] et [aB] (phénotypes non recombinés). Le pourcentage de recombinés est donc de 20%.

Juste

--------> Un des deux genes se trouvent a 20 ucm du centromere.
L'autre a 80 ucm (??).
Donc la distance entre les deux et de 80-20 = 60.

La distance qui séparent les deux gènes est de 60 ucm.

Attention, on ne s'occupe pas de la distance au centromère mais de la distance séparant les 2 gènes!!!!

Tu as trouvé 20% de phénotypes recombinants. Le pourcentage de recombinaison est égal à la distance séparant les 2 loci en cM, donc les gènes sont distants de 20 cM

Si tu as d'autres questions...

tite rose · 11/03/2007, 19h39

Daccord !

Et bien merci beaucoup beaucoup énormément pour ces précieux conseils !!

ANNOUCHKA · 06/02/2008, 15h24

bonjours à vous deux...
j'ai du mal dans la compréhention de la deuxième partie de l'exo
J'ai bien trouvé en F1 génotype (AB//ab)
donc si au deuxième croisement [AB] (AB//ab) avec [ab] (ab//ab) les phénotypes recombinés de la F2 sont ceux nouveaux (différents de ceux parentaux) donc [Ab] et [aB]... Ils sont présents à 80%... donc supérieurs aux phéotypes parentaux... ils doivent alors être très éloignés l'un de l'autre non?
Mon résonnement est il juste? parce que je comprend pas le votre...

ANNOUCHKA · 06/02/2008, 16h49

Personne pour faire une petite corection d'exo sur la génétique? SVP...

MaliciaR · 06/02/2008, 18h06

Tu ne trouves pas que tu exagères un peu? Les gens ne passent pas leur temps sur FSG! Ce n'est pas la première fois que tu demandes une réponses expresse et c'est franchement un peu agaçant...
Cordialement,