Ecologie des populations : capture & recapture

[Gotchapy]

Bonjour,

Tout d'abord, mes félicitations aux créateurs de ce site, le sérieux et la qualité des intervenants sont au rendez-vous !

Voici la question qui me pose quelques soucis, j'espère que vous pourrez y répondre.

En démécologie, un des objectifs primaires est de déterminer la densité d'une population dans une aire géographique donnée.

J'ai toujours été intrigué par la manière dont les spécialistes du domaine déterminent l'effectif d'une population pour une espèce en mouvement (exemple : population de pigeons à Paris, nombre de manifestants dans une grève ).

Au hasard d'une lecture, je suis tombé sur la description d'une méthode qui semble être très utilisée pour ce genre d'applications : la méthode de capture - marquage - recapture.

L'oracle Google ne m'a pas vraiment donné satisfaction, j'ai globalement compris le protocole mais je me pose quelques questions :
1- Comment estime t-on la fiabilité de cette méthode ?

2 - Comment détermine t-on la taille minimale des échantillons lors de la phase de recapture pour avoir une estimation fiable ?

Si j'ai bien compris, après avoir capturé et marqué un nombre a d'animaux, on les relâche et après une période plus ou moins longue d'attente, on établit une nouvelle campagne de capture où on prélève b animaux sur plusieurs échantillons, parmi lesquels figurent alors un nombre c d'animaux recapturés (ceux qui portent la marque).

On a alors la relation qui nous donne l'effectif global de la population
n = (a*b) / c

a est constant, mais b et c varient selon les divers échantillons de recapture.
Question : combien d'échantillons de recapture doit-on prendre en compte pour le calcul de n ?
Les échantillons de recapture où l'on ne retrouve pas d'animaux capturés sont-ils significatifs ? (j'imagine que oui mais..)
Intuitivement je serais tenté de faire une moyenne des résultats, mais j'ai encore quelques doutes.

Merci par avance !


PS: Si vous avez une référence abordable (i.e pas de maths de niveau DEA , qui traite de long en large de cette méthode CMR, je suis preneur !).

A+
Gotchapy

[kinette]

Bonjour,

Citation:

Au hasard d'une lecture, je suis tombé sur la description d'une méthode qui semble être très utilisée pour ce genre d'applications : la méthode de capture - marquage - recapture.
L'oracle Google ne m'a pas vraiment donné satisfaction, j'ai globalement compris le protocole mais je me pose quelques questions :
1- Comment estime t-on la fiabilité de cette méthode ?

C'est plutôt compliqué, et en fait il me semble qu'il existe plusieurs méthodes, et non une seule.
J'ai fait un petit stage dans une équipe spécialisée dans le domaine: tout ça fait appel à des notion mathématiques qui me dépassent largement. L'équipe que je connais développait ses propres tests et méthodes statistiques.

Citation:

Si vous avez une référence abordable (i.e pas de maths de niveau DEA , qui traite de long en large de cette méthode CMR, je suis preneur !)..

A partir de cette adresse tu trouveras peut-être ton bonheur: http://www.cefe.cnrs-mop.fr/wwwbiom/default.htm (ils ont notamment en accès libre des logiciels de stat pour traiter les données de capture-recapture).

Bonnes recherches,
K

[Gotchapy]

Citation:

Posté par kinette

Bonjour,

C'est plutôt compliqué, et en fait il me semble qu'il existe plusieurs méthodes, et non une seule.
J'ai fait un petit stage dans une équipe spécialisée dans le domaine: tout ça fait appel à des notion mathématiques qui me dépassent largement. L'équipe que je connais développait ses propres tests et méthodes statistiques.

Damned, moi qui brille par mes faibles dispositions en maths ca promet

Citation:

A partir de cette adresse tu trouveras peut-être ton bonheur: http://www.cefe.cnrs-mop.fr/wwwbiom/default.htm (ils ont notamment en accès libre des logiciels de stat pour traiter les données de capture-recapture).

Bonnes recherches,
K

Merci !

[kinette]

Hello,

Citation:

Damned, moi qui brille par mes faibles dispositions en maths ca promet

Désolée de t'avoir fait peur comme ça... ceci dit je pense qu'il y a des méthodes "de base" comme celle que tu proposes, et ensuite d'autres façons de traiter les données qui permettent de s'affranchir des incertitudes liées à la méthode de capture-recapture, mais je ne m'y connais pas assez pour te conseiller.

K.

[Gotchapy]

Je pense également que les calculs statistiques poussés que l'on peut rencontrer dans ce type de méthode permet de se rapprocher toujours plus de la réalité. Je vais me contenter de l'analyse de données basique pour le moment, tout en gardant dans un coin de mon esprit que l'on peut toujours affiner la précision en creusant un peu plus.

Btw, si quelqu'un a un autre avis sur cette méthode ou une lecture intéressante à me soumettre, je prends volontiers

[yanou]

slt,

c tout bete cette methode gotchapy mais ce ne sont que des statistiques. si tu me laisse un peu de tps je te retrouve ca ca fait bien longtps que je ne l'ai pas utilise.
d'autre part le fait de ne pas retrouver d'animaux marquer entraine un biais. la presence de chasseur, de predateur, l'intervalle de tps entre deux campagnes.
il faut eviter de tomber pendant les cycles de fecondite ou de procreation, ta population ke tu cherches a estimer va grandir d'un coup...
laisse moi quelque jour je te retrouve ca..
ciao

yanou

[Gotchapy]

Evidemment j'ai oublié de définir les hypothèses de départ, et les problèmes inhérents à la méthode qui vont forcément influencer la méthode.

Ca serait génial si tu retrouvais ce dont tu me parles, je suis pas du tout préssé

Merci et bon week-end

[emmhem]

Salut,
à la recherche de doc sur la méthode de capture/marquage /recapture, je viens de tomber sur cette discussion,

Yanou semble proposer un papier intéressant, est-ce toujours d'actualité?