séquence consensus

Solène · 14/09/2004, 16h44

Bonjour à tous !
Donc la seule chose que j'ai compris au cours c'est que la séquence consensus intervient dans la période d'initiation de la réplication... et je n'ai rien suivi de l'explication concernant cette séquence à cause d'un guignol qui avait décidé d'"biiip"

tout l'amphi en parlant aussi fort que la prof.

Les sites internet que j'ai pu visiter n'étant pas assez vulgarisés ,je vous pose la question : qu'est-ce qu'une séquence consensus ? Comment la reconnait-t-on ? et de quelle manière intervient-elle dans la réplication ??
Merci bien !

9herve · 14/09/2004, 16h56

http://forums.futura-sciences.com/sh...ad.php?t=14173

Une séquence consensus peut etre proteique ou nucleique, c'est une sequence que tu retrouves dans plusieurs genes ou proteine par ex et qui a la même fonction ex la Tata box : tataa
Cette séquence peut etre plus ou moins dégénérée.

John78 · 14/09/2004, 17h17

A mon avis Solène veut parler de la séquence d'initiation de la réplication OriC qui est globalement conservée chez les Bactéries. Cette séquence est assez longue (250 paires de base) et contient des motifs qui sont spécifiquement reconnus par la protéine DnaA qui initie la réplication. Il y aussi dans cette région du génome des motifs palindromiques qui sont reconnus par les Dam-méthylase pour méthyler certaines bases. D'ou la relative conservation de cette séquence quand on la compare entre différentes espèces de bactérie (on peut donc en déduire une séquence consensus entre toutes ces séquences)...

Ex :
Bactérie 1 : ATGTGGCGGCGATAT
Bactérie 2 : ATCTCCCGGCGACAT
Bactérie 3 : ATCTGGCGGCGTTAT
consensus : AT*T**CGGCG**AT

Je ne sais pas si j'ai répondus a coté ou pas...

A+
John

9herve · 14/09/2004, 19h26

Nan pas du tout à coté, john, mais elle pensait qu'une séquence consensus était spécifique du mécanisme de la réplication...; On parle de consensus pour la transcription, la dégradation de mRNA, l'export etc.
Chez les eucaryotes (peut etre à part la levure, peut etre), Les origines de réplication ne sont pas facilement identifiables et changent au cours du dévelopement, il me semble (à vérifier)

Solène · 14/09/2004, 20h15

Citation:

elle pensait qu'une séquence consensus était spécifique du mécanisme de la réplication

Disons que je ne l'ai étudiée que dans ce cas précis... En tout cas merci à vous deux de m'avoir éclairée je pense avoir compris le système

9herve · 14/09/2004, 21h01

Citation:

Posté par Solène

Disons que je ne l'ai étudiée que dans ce cas précis... En tout cas merci à vous deux de m'avoir éclairée je pense avoir compris le système

T'es sure? on va te faire une interro!!!!!