Bonjour,
Disons-le tout de suite: la manip que tu décris (avec échange des disques durs) relève quelque peu de la bidouille
Mais comme le dit lou_ibmix_xi, ça peut marcher quand les configs sont vraiment analogues. Pourquoi inclus-tu 2 disques dans la manip? Peut-être pour faire coexister Linux et Windows? Dans ce cas, on peut supposer que la présence d'un lecteur DVD sur l'autre PC perturbe la numérotation des périf IDE, et ta config GRUB/LILO sera fausse: essaie de faire une installation Linux basique sur un seul disque pour éclaircir le problème.
Autres solutions, plus "propres":
- le lecteur DVD externe - à condition que ta carte mère accepte de booter dessus!
- l'installation réseau: pour cela, il te faut quand-même, sur le PC cible:
. un lecteur de disquette bootable
. ou une carte réseau équipée du dispositif PXE (boot sur le réseau)
Et, en plus:
. la liaison réseau (câble croisé, ou 2 câbles + routeur)
. mettre en oeuvre un serveur NFS pour partager le lecteur DVD
. et, pour PXE: mettre en oeuvre un serveur DHCP et un serveur TFTP.
Toutes (ou presque?) les distributions Linux disposent des serveurs NFS, DHCP et TFTP, et proposent une installation réseau: c'est donc l'occasion d'apprendre plein de choses (plus ou moins utiles...

). Un coup d'oeil au README accompagnant ta distribution te donnera un aperçu des possibilités d'installation alternatives.
Cordialement,