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Vieux 12/10/2007, 17h18   #1
 
Date d'inscription: octobre 2004
Localisation: Lune
Messages: 462
Question Base de données interactions protéine-protéine ?

Yo

Je cherche une base de données regroupant, pour une protéine donnée, tous ses partenaires protéiques répertoriés dans la littérature (toutes techniques confondues, et sans vouloir me taper PubMed à coup de keywords). Les base de données "protéiques" que je connais ne fournissent pas ce genre d'informations (elles sont axées sur la reconnaissance de domaines/motifsconservés, ou compilent des infos sur une famille de protéine, etc.)

Vous avez une idée ?

Thanks
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Vieux 12/10/2007, 17h33   #2
 
Date d'inscription: février 2007
Localisation: Lyon
Âge: 24
Messages: 67
Re : Base de données interactions protéine-protéine ?

Salut!
Tu travailles sur quoi?
Je sais que ça existe pour les levures en tout cas :

http://db.yeastgenome.org/cgi-bin/locus.pl?locus

dans "all interactions deteils and references"
sacharybalka est déconnecté   Réponse avec citation
Vieux 12/10/2007, 18h06   #3
 
Date d'inscription: février 2004
Localisation: Dans le labo...
Messages: 2 924
Re : Base de données interactions protéine-protéine ?

Salut!
Tu as par exemple la base HPRD:

http://www.hprd.org/


et tu as également BIND qui est très bien mais il faut s'inscrire:

http://bond.unleashedinformatics.com/Action?

V.
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Vieux 12/10/2007, 20h30   #4
 
Date d'inscription: octobre 2004
Localisation: Lune
Messages: 462
Re : Base de données interactions protéine-protéine ?

Citation:
Envoyé par sacharybalka Voir le message
Salut!
Tu travailles sur quoi?
Souris/homme

Merci à vous deux pour les liens, je vais voir ça de ce pas !
__________________
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Vieux 14/10/2007, 00h26   #5
 
Date d'inscription: août 2007
Localisation: Ligne 12
Messages: 2 571
Re : Base de données interactions protéine-protéine ?

Salut,
Je ne sais pas si tu as trouvé ton bonheur, mais regarde ça, qui sait

http://www.ihop-net.org/UniPub/iHOP/

Cordialement,
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Tags
interaction, base de donnees, proteine

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