[biologie moleculaire] logiciel équivalent à DNA strider sur PC

[Noun]

Bonjour,
Est-ce que quelqu'un connait un bon logiciel d'analyse de sequences (ADN et proteines) equivalent a DNA strider (alignements, sites de restrictions, identification dORFs, etc...) mais qui marche avec un PC (DNa strioder ne marche que sur MAc) ?
Merci
Noun

[gorben]

salut

Au labo on utilise vecteur NTI (informax, invitrogene) c'est l'equivalent de DNA strider. Il peut s'installer sur pc ou mac, et il est gratuit pour les instituts publics à condition d'en faire la demande sinon je crois que la licence est à peu prés de 3 ou 4K€.

Sinon y'a pleins de trucs sur le net gratos et trés performant.

A+

[Bertrand]

J'utilise personnellement le logiciel ApE (A plasmid Editor) qui est très performant et multiplateforme. Bien entendu il est gratuit. Je n'ai pas l'adresse en tête mais vous la trouverez facilement avec les mot clé "a plasmid editor" sous google.

[Jean-Luc P]

Pour les alignements :

clustalw
genedoc
bioedit

pour les cartes de plasmides :
Ape
pDRAW32 (beerware)

[nayeki]

Vector NTI est gratuit depuis qq annees, tres utile pour designer ses clonages...

[Jerome.ENS]

Bonjour,

Es-ce qu'il est possible d'utiliser gratuitement Vector NTI en tant qu'étudiant réalisant un stage dans un laboratoire ne disposant pas de compte online chez Invitrogen ? Après avoir créer un compte personel (car j'ai vu que normalement c'est gratuit pour les instituts de recherche public mais le labo dans lequel je suis n'a pas de compte online) invitrogen me facture la licence a 44 € ?

Ici tout le monde utilise des Mac avec DNA strider, et j'ai un PC

Merci d'avance,

Jérôme

[gorben]

Salut,

Je comprend pas bien la difference entre un compte online et un compte perso dans ton cas. Pour avoir la licence, il suffit de t'enregistrer sur leur site, de remplir les 3 ou 4 pages d'infos puis de commander VNTI. La si tu ne rajoute pas le manuel ou autre chose du style, la facture est de 0 euro et ils te donnent une clefs directement. Je ne sais pas ou tu es en stage, mais le systeme de reconnaissance des mails d'invitrogen attribue la licence gratuite automatiquement aux adresses *.gov ou *.edu.

Pour une adresse bien francaise en *.fr, faut les appeler pour leur dire que tu es bien dans un institut gouvernemental a but non lucratif...

A+

PS : Ne demande pas la licence a titre perso, mais au nom du labo...

[Jerome.ENS]

Effectivement je pense que le problème vient du fait que mon adresse mail se termine en .fr, je vais essayer de les contacter demain pour régler cette affaire.

Merci encore pour ta réponse,
A bientôt,

Jerome