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Vieux 02/06/2006, 22h21   Sujet GFP et oxygène - Message #1
tortuga
 
Date d'inscription: octobre 2004
Localisation: Norwich, UK
Messages: 174
GFP et oxygène
Salut !

Est-ce que quelqu'un connait précisément la quantité d'O2 nécessaire pour que la GFP fluoresce ?

Cette question m'est venue de la lecture d'articles sur l'expression de gènes au sein de biofilms bactériens, où la concentration en oxygène est très limitée.

Cordialement,
T.
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Vieux 03/06/2006, 08h54   Sujet GFP et oxygène - Message #2
Yoyo
 
Date d'inscription: janvier 2003
Messages: 10 854
Re : GFP et oxygène
c'est L'O2 qui est directement necessaire? Ou c'est plutot l'ATP cofacteur de la GFP synthétisé grace a l'O2 qui est important?

Yoyo
Yoyo est déconnecté   Réponse avec citation
Vieux 03/06/2006, 11h03   Sujet GFP et oxygène - Message #3
tortuga
 
Date d'inscription: octobre 2004
Localisation: Norwich, UK
Messages: 174
Re : GFP et oxygène
L'O2 moléculaire permet la mise en place finale du fluorophore, sans enzymes ni cofacteurs. Si on regarde la maturation de la GFP en milieu anaérobie, la protéine a le même comportement sur gel que la GFP normale mais ne fluoresce pas. Après maturation, l'oxygène n'a plus aucun rôle.

J'ai trouvé la réponse à ma question dans quelques articles : certains ont observé qu'à 1% d'oxygène atmosphérique, la GFP continuait à fluorescer. D'autres ont carrément montré qu'à 0,025 ppm, la GFP ne fonctionnait plus. La concentration en oxygène dans les biofilms pouvant être divisée jusqu'à 30 fois, au centre la GFP ne doit pas fonctionner.

En fait, étrangement, assez peu de travaux ont été menés précisément sur ce sujet: par exemple, on ignore (d'après ce que j'ai lu) si une pression partielle en oxygène plus grande que la pression atmosphérique accélèrerait la maturation. En revanche, on sait que la protéine met 2h à devenir fonctionnelle (des mutants abaissent ce temps à 30 minutes) et que des composés réducteurs peuvent "décolorer" la GFP en réhydrogénant le chromophore.
tortuga est déconnecté   Réponse avec citation
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