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Actu - Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?



  1. #1
    RSSBot

    Actu - Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?

    Le dogme de la biologie vient d'être remis en question par un groupe de généticiens. Les pseudogènes, reliquats du passé, ne seraient pas aussi désuets que ce que l'on a cru jusqu'à présent. Ils pourraient même avoir un rôle dans le développement de certains cancers.<br />
    Le séquençage du génome humain, qui fête d'ailleurs ses 10 ans cette semaine, aura au moins permis aux scientifiques de réaliser qu'il est bien plus compliqué à décrypter que prévu. Il y a une décennie, les généticiens considéraien...

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  3. #2
    piwi

    Re : Actu - Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?

    Bonjour.

    Je ne suis pas certain qu'il soit exact de dire que ce travail met à mal le "dogme" central de la biologie. Enfin, les biologistes n'ont pas attendu ce papier pour l'ébranler. La découverte des miRNA aura déjà fait ce travail, en supprimant la partie ARN --> protéine de la définition d'un gène. Partant de là il est évident que l'ADN que l'on considérait jusque là comme non codant ou "poubelle" prend une nouvelle dimension. Il est intéressant que l'on trouve des gènes miRNA, c'est à dire dont l'ARN n'a pas pour finalité (si tant est qu'il en est une, l'expression est utilisée en conscience, à la seule fin d'être facilement compréhensible) d'être traduit en protéine. Mais on a aussi des miRNA codés dans les exons, et là c'est l'épissage des préRNA qui prend un jour nouveau. Même un gène qui code pour une protéine ne code pas nécessairement que pour une protéine. L'expression des gènes est multiple, complexe.
    Donc non, ce travail ne révolutionne pas notre compréhension de l'expression des gène, il la raffine. Et c'est déjà énorme.

    Cordialement,
    piwi
    Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.

  4. #3
    Daklok

    Re : Actu - Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?

    Citation Envoyé par RSSBot Voir le message
    Des chercheurs [...] ont mis au jour un mécanisme épigénétique qui bouleverse le dogme de la biologie qui stipule que l’ADN est transcrit en ARN, lui-même traduit en protéines. Le journal Nature a publié leurs travaux, démontrant que l'ARN aurait en effet bien plus qu'un rôle de messager.
    Attention quand même : dit comme ça on dirait qu'on vient de découvrir les ARN non codants et leur importance (alors que la suite enchaine justement sur des miRNA).

    Si ces pseudogènes sont capables de réguler l'expression du génome, c’est toute la biologie qu’il faut repenser !
    Euh ben non, on a juste (encore) amélioré notre compréhension de l'information génétique dans les génomes. Une jolie avancée, mais rien de révolutionnaire en soit qui doive tout faire repenser.

    Ceci dit, c'est intéressant de voir un nouveau mécanisme comme celui-ci. Pensez donc : tout cet ADN "poubelle" que d'aucuns pensaient inutile regorge finalement d'informations essentielles, même jusque dans les pseudos-gènes. Reste cependant à voir dans quelles proportions l'ensemble des pseudogènes jouerait un rôle.

    Comme quoi, il vaut mieux dire « on ne sait pas si ça sert à quelque chose » que « ça ne sert à rien » quand on ne sait pas. Et ça vaut pour pas mal de choses.

  5. #4
    Rubyman

    Re : Actu - Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?

    Comment faire comprendre aux gens que la science n'est pas dogmatique si même Futura utilise ce mot dans ces articles ? Rien ne permet ici de parler de dogme : s'il bien y a eu un consensus à ce sujet, il a été remis en cause dès qu'on a eu de bonnes raisons de le remettre en cause et cette remise en cause à été acceptée par la communauté, et c'est justement la différence fondamentale avec un dogme. On n'aurait pu parler de dogme que si la communauté avait rejeté toute remise en cause malgré les preuves, ce qui n'est (heureusement) pas le cas.
    Dernière modification par Rubyman ; 25/06/2010 à 13h04.

  6. A voir en vidéo sur Futura
  7. #5
    Pfhoryan

    Re : Actu - Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?

    Citation Envoyé par Rubyman Voir le message
    Comment faire comprendre aux gens que la science n'est pas dogmatique si même Futura utilise ce mot dans ces articles ?
    C'est juste un moyen d'attirer l'attention du lecteur. Ce n'est pas différent dans le principe qu'une couverture de Science & Vie qui titre: "le temps n'existe pas!" ou "Einstein avait tort!"
    “if something happened it’s probably possible.” Peter Coney

  8. #6
    poulenjard

    Re : Actu - Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?

    En 2000, Kupiec et Sonigo avançaient que l'ADN non codant détermine les probabilités de transition de la chromatine d'un état à l'autre. Dans quelle mesure leur modèle de "l'élastique enroulé" est-il confirmé ou non par cette nouvelle découverte ?

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  10. #7
    douzieme case

    Re : Actu - Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?

    Citation Envoyé par Rubyman Voir le message
    Comment faire comprendre aux gens que la science n'est pas dogmatique si même Futura utilise ce mot dans ces articles ? Rien ne permet ici de parler de dogme : s'il bien y a eu un consensus à ce sujet, il a été remis en cause dès qu'on a eu de bonnes raisons de le remettre en cause et cette remise en cause à été acceptée par la communauté, et c'est justement la différence fondamentale avec un dogme. On n'aurait pu parler de dogme que si la communauté avait rejeté toute remise en cause malgré les preuves, ce qui n'est (heureusement) pas le cas.
    J'irais aller plus loin en pointant le danger de parler de "dogme" à propos de sciences dans un article de vulgarisation. Si les sciences sont un dogme, alors pourquoi un autre "dogme" ne serait-il pas aussi valide que les connaissances scientifiques ? On assiste là à la possibilité d'un relativisme dans les moyens de développer la connaissance. Si tout est dogme, alors toute affirmation peut être admise comme vraie, quel que soit le cheminement pour y arriver : pourquoi faire si grand cas de la science alors ?

    Les mots ont un sens et ils trainent avec eux un champs de pré-supposés (cf forum L'Acupuncture Expliquée par la Science ?) : utiliser le mot dogme pour la science, c'est donner aux pseudo-sciences dogmatiques la possibilité de se voir reconnaître le même niveau de fiabilité en termes de connaissances que celles issues de la démarche scientifique.

    "Consensus" aurait parfaitement convenu, mais l'accroche du titre est là pour faire lire l'article ... (Re-cf réponses données dans le forum L'Acupuncture Expliquée par la Science ?)

  11. #8
    Daklok

    Re : Actu - Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?

    À propos du dogme : notez que dans ce cas particulier c'est une expression (malheureusement) consacrée par l'usage : l'ensemble « ADN -> ARN -> protéines » est ce qu'on appelle le dogme central de la biologie moléculaire (mais il s'agit dans ce cas d'un problème de sémantique ; voyez Wikipedia pour plus de details, notamment la version anglophone).

    Ce n'est donc pas la faute de l'auteur de l'article s'il utilise le terme « dogme », même si un autre choix de mot aurait été judicieux. Sauf à jouer avec la « remise en cause » dudit dogme...

  12. #9
    douzieme case

    Re : Actu - Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?

    Citation Envoyé par Daklok Voir le message
    À propos du dogme : notez que dans ce cas particulier c'est une expression (malheureusement) consacrée par l'usage : l'ensemble « ADN -> ARN -> protéines » est ce qu'on appelle le dogme central de la biologie moléculaire (mais il s'agit dans ce cas d'un problème de sémantique ; voyez Wikipedia pour plus de details, notamment la version anglophone).

    Ce n'est donc pas la faute de l'auteur de l'article s'il utilise le terme « dogme », même si un autre choix de mot aurait été judicieux. Sauf à jouer avec la « remise en cause » dudit dogme...
    Il s'agit, bien évidemment, de sémantique. Je ne pense pas que FS pense que la biologie est un dogme.

    Très intéressant, Wikipédia : ce qui s'appelle le "central dogma" en anglais est traduit par "théorie fondamentale" en français : la langue française prédispose-t-elle a plus de rationalité ?

    Quant à l'article "dogme" de Wikipédia, il insiste bien sur le fait qu'employé dans le domaine de la science, il amène une connotation péjorative au domaine où il est employé.

    Alors ? Faux-ami traduit un peu trop précipitamment que ce "dogme de la biologie" ? J'aurais tendance à le croire, car cette explication prendrait en compte le processus de fabrication de la news incriminée.

  13. #10
    jihel

    Re : Actu - Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?

    Il est vrai que le mot "dogme" est très fort mais il s'utilise facilement en science dans son sens de "vérité établie" et il n'a pas été confisqué par les sectes ou la religion.
    C'est vrai aussi que, comme le rappelle Piwi, "les biologistes n'ont pas attendu ce papier pour l'ébranler". Mais ce qui a déjà été ébranlé peut l'être de nouveau
    L'article montre bien la nouveauté qu'apporte cette découverte et les mécanismes encore inconnus qu'elle suggère.

  14. #11
    douzieme case

    Re : Actu - Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?

    Pour synthétiser :

    "dogme" employé entre biologistes = consensus fort que rien n'est venu remettre en cause jusqu'à présent. Sens non-ambigu entre gens du milieu.

    "dogme" employé entre religieux = affirmation considérée comme fondamentale, incontestable et intangible (cf Wikipédia). Acception commune et spontanée lorsque le contexte n'est pas précisé.

    "dogme" employé devant des lecteurs situés hors du champ de la biologie => manque de référentiel partagé pour empêcher l'ambiguïté, qui amène à l'incompréhension voire au contresens.

  15. #12
    poulenjard

    Re : Actu - Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?

    Citation Envoyé par jihel Voir le message
    Il est vrai que le mot "dogme" est très fort mais il s'utilise facilement en science dans son sens de "vérité établie" et il n'a pas été confisqué par les sectes ou la religion.
    C'est vrai aussi que, comme le rappelle Piwi, "les biologistes n'ont pas attendu ce papier pour l'ébranler". Mais ce qui a déjà été ébranlé peut l'être de nouveau
    L'article montre bien la nouveauté qu'apporte cette découverte et les mécanismes encore inconnus qu'elle suggère.
    Cette discussion sur la rhétorique de la vulgarisation scientifique est très intéressante du point de vue didactique . Mais pour moi qui essaie d'acquérir quelques rudiments de génétique, une petite réponse sur le contenu plutôt que sur la forme serait la bienvenue.

    Ma question était:
    En 2000, Kupiec et Sonigo avançaient que l'ADN non codant détermine les probabilités de transition de la chromatine d'un état à l'autre. Dans quelle mesure leur modèle de "l'élastique enroulé" est-il confirmé ou non par cette nouvelle découverte ?

    Un grand merci !

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  17. #13
    Daklok

    Re : Actu - Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?

    Citation Envoyé par poulenjard Voir le message
    En 2000, Kupiec et Sonigo avançaient que l'ADN non codant détermine les probabilités de transition de la chromatine d'un état à l'autre. Dans quelle mesure leur modèle de "l'élastique enroulé" est-il confirmé ou non par cette nouvelle découverte ?
    Dans la mesure où c'est un livre de vulgarisation et non un papier scientifique, je ne sais pas si on peut en dire grand chose. Je n'ai trouvé aucune référence claire à cette hypothèse dans des papiers publiés.

    Mais pour répondre franchement, je crois que ça n'a tout simplement rien à voir. Le repliement de la chromatine n'a pas grand chose en commun avec les informations génétiques elles-mêmes qu'elle contient, que ce soit sous forme de pseudogènes ou non.

  18. #14
    qqvvdb

    Re : Actu - Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?

    Bonjour,

    un article sympa concernant le repliement de la chromatine : http://atlasgeneticsoncology.org/Edu...tinEducFr.html

  19. #15
    uneautreterre

    Re : Actu - Les pseudogènes vont-ils bouleverser la biologie ?

    Citation Envoyé par qqvvdb Voir le message
    un article sympa...
    Sympa peut-être, mais au premier paragraphe, il est dit que le noyau d'une cellule mesure quelques millimètres de diamètre.

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