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Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie



  1. #31
    invité6543212033

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Pourquoi une hydrolyse ???

    Selon moi, l'adénosine triphosphate se transforme par le métabolisme énergétique de la cellule en adénosine diphosphate !!!

    @ +

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  3. #32
    Amanuensis

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Citation Envoyé par octanitrocubane Voir le message
    Pourquoi une hydrolyse ???
    Parce que ATP + H20 --> ADP + Pi + énergie est une hydrolyse

  4. #33
    invité6543212033

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    OK ... c'est loin pour moi tout çà !

    Sinon pourquoi tu mets un "i" après P pour inductif ???

  5. #34
    noir_ecaille

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Pi (et non "Pi") pour "inorganique"

    Autrement dit H3PO4.
    "Deviens ce que tu es", Friedrich W. Nietzsche

  6. #35
    invité6543212033

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Ah merci !

  7. #36
    Amanuensis

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Citation Envoyé par octanitrocubane Voir le message
    Sinon pourquoi tu mets un "i" après P pour inductif ???
    P devrait être réservé à l'atome de phosphore.

    Les biologistes utilisent P aussi pour "phosphate" (dans ATP par exemple).

    Pi : ion phosphate (dont les formes dominantes en solution aqueuse autour de pH 7 sont H2PO4- et HPO42-)

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  9. #37
    invité6543212033

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Oui çà me rappelle des souvenirs !

  10. #38
    JPL
    Responsable des forums

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Citation Envoyé par Amanuensis Voir le message
    Parce que ATP + H20 --> ADP + Pi + énergie est une hydrolyse
    Ou plus exactement les réactions où est impliqué l'ATP sont formellement équivalentes à une hydrolyse car il n'y a jamais dans le métabolisme normal de réaction directe de l'eau avec l'ATP. Donc c'est une approximation verbale qu'on peut se permettre à condition de ne pas la prendre au pied de la lettre.
    Rien ne sert de penser, il faut réfléchir avant - Pierre Dac

  11. #39
    invité6543212033

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Oui, çà se note Pi-Pi~Pi !!!

  12. #40
    JPL
    Responsable des forums

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Et ne pas en conclure que quand on fait pipi c'est de l'adénosine diphosphate !
    Rien ne sert de penser, il faut réfléchir avant - Pierre Dac

  13. #41
    Alhec

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Citation Envoyé par JPL Voir le message
    Ou plus exactement les réactions où est impliqué l'ATP sont formellement équivalentes à une hydrolyse car il n'y a jamais dans le métabolisme normal de réaction directe de l'eau avec l'ATP. Donc c'est une approximation verbale qu'on peut se permettre à condition de ne pas la prendre au pied de la lettre.
    Ah bon? La biochimie ça n'a jamais été mon fort, tu peux expliquer un peu? J'ai cherché un peu dans un bouquin de bioch mais je n'ai pas trouvé.

  14. #42
    Pfhoryan

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Citation Envoyé par Amanuensis Voir le message
    Et y-a-t'il des différences importantes entre la chimie de l'ion phosphate et de l'ion arséniate ?
    Westheimer a fait une revue sur l'intérêt du phosphate pour le vivant il y a quelques années. Il y parle aussi rapidement des alternatives comme l'arsenate.
    “if something happened it’s probably possible.” Peter Coney

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  16. #43
    invité6543212033

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Petite question : est-ce que les ribosomes sont touchés par As ???

    @ +

  17. #44
    JPL
    Responsable des forums

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Citation Envoyé par Alhec Voir le message
    Ah bon? La biochimie ça n'a jamais été mon fort, tu peux expliquer un peu? J'ai cherché un peu dans un bouquin de bioch mais je n'ai pas trouvé.
    En fait quand on fait le bilan global des réactions impliquant de l'ATP tout se passe comme si une molécule d'eau avait été consommée, bien qu'il n'y ait pas d’hydrolyse réelle de l'ATP en ADP + Pi parce que le phosphate "libéré" ne l'est pas réellement : il sert à phosphoryler une autre molécule. Néanmoins l'énergie récupérée par ces réactions est bien quantitativement la même que celle que libérerait une hydrolyse de l'ATP.
    Citation Envoyé par octanitrocubane Voir le message
    Petite question : est-ce que les ribosomes sont touchés par As ???
    Si ce qui est prétendu est vrai (à mon avis il faut attendre d'autres travaux) la réponse serait oui puisque les ribosomes sont majoritairement constitués d'ARN.
    Rien ne sert de penser, il faut réfléchir avant - Pierre Dac

  18. #45
    Amanuensis

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Citation Envoyé par Pfhoryan Voir le message
    Westheimer a fait une revue sur l'intérêt du phosphate pour le vivant il y a quelques années. Il y parle aussi rapidement des alternatives comme l'arsenate.
    Thanks !....

  19. #46
    Pfhoryan

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Citation Envoyé par octanitrocubane Voir le message
    Petite question : est-ce que les ribosomes sont touchés par As ???
    On peut s'y attendre vu qu'ils sont constitués en grande partie d'ARN. (edit: doublé avec JPL. Tout arrive... )

    Ce qui est très difficile a avalé dans cette histoire, c'est que dans cette bactérie, toutes les réactions chimiques impliquant un phosphate fonctionneraient toutes raisonnablement bien avec un arsenate.
    “if something happened it’s probably possible.” Peter Coney

  20. #47
    super_phoenix

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Bonjour,

    L'intérêt intrinsèque de la découverte est, selon moi, incontestable.
    Mais n'est ce là qu'une curiosité de la nature, nous interpelant toujours au moment ou on croit pouvoir la saisir, ou est ce que quelqu'un a des idées d'applications pratiques qu'une telle bactérie pourrait permettre?
    Dépollution peut être...

    Cordialement
    La seule chose absolue dans un monde comme le nôtre, c'est l'humour. A.Einstein

  21. #48
    Jean-Luc P

    Cool Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Citation Envoyé par JPL Voir le message
    Ou plus exactement les réactions où est impliqué l'ATP sont formellement équivalentes à une hydrolyse car il n'y a jamais dans le métabolisme normal de réaction directe de l'eau avec l'ATP. Donc c'est une approximation verbale qu'on peut se permettre à condition de ne pas la prendre au pied de la lettre.
    Ah bon ? L'ATP est une molécule stable ? Bien sûr qu'elle s'hydrolyse, c'est bien pourquoi les stocks d'ATP ne sont que transitoires.

    Elle est certes stabilisée par la répulsion électrostatique des trois phosphates, mais en pratique elle reste sensible à l'hydrolyse. Je dois avoir quelque part des données cinétiques là-dessus...
    Jean-Luc
    La violence est le dernier refuge de l'incompétence.
    Salvor Hardin

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  23. #49
    Insight

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Citation Envoyé par super_phoenix Voir le message
    Bonjour,

    L'intérêt intrinsèque de la découverte est, selon moi, incontestable.
    Mais n'est ce là qu'une curiosité de la nature, nous interpelant toujours au moment ou on croit pouvoir la saisir, ou est ce que quelqu'un a des idées d'applications pratiques qu'une telle bactérie pourrait permettre?
    Dépollution peut être...

    Cordialement
    Il me semble que cette bacterie appartient a la meme famille qui est utilisee pour nettoye le petrol dans le golf de Mexico.

  24. #50
    JPL
    Responsable des forums

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Citation Envoyé par Jean-Luc P Voir le message
    Ah bon ? L'ATP est une molécule stable ? Bien sûr qu'elle s'hydrolyse, c'est bien pourquoi les stocks d'ATP ne sont que transitoires.
    Je n'ai jamais dit cela. Bien sûr si l'on fait une solution d'ATP dans l'eau celui-ci va être rapidement hydrolysé. Ce que j'ai voulu dire c'est que dans les réactions du métabolisme où l'ATP est impliqué celui-ci ne réagit pas avec une molécule d'eau, mais avec les métabolites impliqués. Simplement quand on fait le bilan global tout se passe comme si on avait
    ATP + H2O =>ADP + Pi et l'énergie fournie est égale à celle de cette réaction d'hydrolyse, mais c'est fictif.
    Rien ne sert de penser, il faut réfléchir avant - Pierre Dac

  25. #51
    Carcharodon

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    J'ai trouvé un article qui résume assez bien, de mon point de vue, ce qu'il faut penser de cette annonce :

    http://www.slate.fr/story/31181/nasa...xtraterrestres

    Je n'aurais personnellement rien a rajouter, et je trouve le point de vue de l'auteur très pertinent, sans connaitre cependant la valeur de cette source (merci de m'informer a ce sujet -valeur de cette source- si vous en savez plus que moi !).
    Restons superficiel pour ne pas fâcher

  26. #52
    Daklok

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Hop une petite mise à jour : j'avais raison d'être un peu circonspect, il semble que pas mal de monde (experts) critiquent la découverte.

    Pour certains, les preuves apportées ne sont pas suffisantes pour justifier les conclusions que l'arsenic est bien incorporé dans l'ADN (et encore moins dans les autres molécules qui en contiennent normalement).

    http://rrresearch.blogspot.com/2010/...ria-nasas.html

    http://scienceblogs.com/webeasties/2...-based_dna.php

    Bref, la Nasa semble vouloir faire dans le sensationnel plutôt que le scientifique. Dommage.

  27. #53
    invite73192618

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Merci bien. Dans le cas de ALH 84001 j'avais encore un doute, mais là... la révolution attendra

  28. #54
    mtheory

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Citation Envoyé par Jiav Voir le message
    Merci bien. Dans le cas de ALH 84001 j'avais encore un doute, mais là... la révolution attendra
    On a quelque chose là-dessus, stay tuned !
    “I'm smart enough to know that I'm dumb.” Richard Feynman

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  30. #55
    Cendres
    Modérateur

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Et c'est là que l'on voit que certains commentaires dans cette discussion sur les "dogmes biologiques" ou le supposé état d'esprit des biologistes auraient mérité plus de nuances...
    N'a de convictions que celui qui n'a rien approfondi (Cioran)

  31. #56
    piwi

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    J'ai lu le dernier des deux liens donné récemment. En tant que biologiste moléculaire, je ne suis pas certain de recevoir l'argument d'invalidation par simple relecture d'une expérience si simplement qu'il est présenté dans le blog.
    L'extraction phénol/chloroforme ne se fait pas, comme son nom l'indique, dans l'eau. Elle se fait en 4 étapes:
    1. extraction dans un mélange 50/50 de phénol saturé en tris et de chloroforme.
    2. précipitation de l'ADN dans l'ethanol absolu
    3. lavage dans l'ethanol 70%
    4. séchage et reprise dans l'eau.

    On voit bien que seule la dernière étape se fait dans l'eau pure. Dans quelle mesure, les données d'hydrolyse spontannée en milieu aqueux peuvent être directement extrapolées aux différents milieux de la procédure? Aucune idée. Si un chimiste a une idée...

    Parler de l'arsenic comme résidu contaminant résiduel me convainc assez peu aussi. D'ailleurs, à parler d'eau salée, l'étape 2 de l'extraction doit se faire en présence de 200mM de sels, minimum. Donc, si les ions devaient se coller sur l'ADN, on devrait présisément les retrouver dans toutes extractions comme le suggère son expérience de pensée. En fait, on en élimine beaucoup au cours de l'étape de lavage 3. J'imagine que les taux d'arsenate, qui auraient du être lavés eux aussi, sont suffisant pour ne pas avoir été considérés comme de simples traces.

    Maintenant, les autres arguments, me semblent bien plus pertinants. En particulier le fait de considéré non pas le taux de phosphore relativement à l'arsenic mais d'une manière absolue. D'un coup, l'argument principal tombe.
    Par ailleurs, on reste avec le problème de la gestion du switch (incompréhensible) par la cellule.

    Cordialement,
    piwi
    Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.

  32. #57
    Alhec

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    C'est même plus de la critique, à ce niveau-là c'est "a piece of ownage" comme disent les anglo-saxons. Faut avouer que quand il se demande pourquoi les auteurs n'ont pas fait de spectroscopie de masse sur l'ADN directement, c'est assez pertinent. Ne me dites pas qu'ils n'ont pas ce genre d'appareils ni les moyens à la NASA pour réaliser cette expérience simple C'est quand même hallucinant non? Qu'en pensez-vous? Pourquoi tous ces détours alors qu'il existe un moyen bien connu d'analyser la composition d'une molécule? Il y aurait des restrictions qui m'échapperaient?

  33. #58
    piwi

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Disons que pour ce genre de publication j'irais encore plus loin. On peut se demander pourquoi les reviewers n'ont pas exigé une cristallo de cet ADN.
    Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.

  34. #59
    Daklok

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Citation Envoyé par piwi Voir le message
    Disons que pour ce genre de publication j'irais encore plus loin. On peut se demander pourquoi les reviewers n'ont pas exigé une cristallo de cet ADN.
    Ça me semble être trop demandé ; une « simple » spectrographie de masse devrait pouvoir faire l'affaire, apparemment.

    En plus, je ne suis pas sûr qu'une cristallo soit très intéressante dans ce cas, entre un atome d'Arsenic et de Phosphore, ça n'est peut-être pas différent ; ce serait intéressant si la structure elle-même est altérée... mais avant d'en arriver là il faudrait d'abord être sûr qu'il y a effectivement de l'arsenic dans l'ADN.

  35. #60
    piwi

    Re : Actu - Un ADN à l'arsenic : nouvelle forme de vie et révolution en exobiologie

    Disons que c'est un peu le truc du papier. Ils annoncent qu'il y a de l'arsenic dans l'ADN. En un mot, il annoncent une nouvelle forme d'ADN. Devant la dimension de l'annonce, on voudrait la voir cette molécule. Watson et Crick n'ont pas fait moins! Dans les années 1950...
    La résolution de la cristallo aujourd'hui serait suffisante pour identifier l'arsenic.
    A mon sens ce n'est pas trop demander (même si ça ne se fait pas tout seul, c'est évident). Il y a des équipes très au point, on parle d'une recherche supportée par la NASA, on parle d'une découverte majeur.

    En gros la question est: imaginons que ce soit moi (ou toi) qui ait cherché à publier cette histoire. Penses-tu qu'en l'état elle serait sortie dans Science? Dans un journal moins coté? Disons que les reviewers ont été sympa.

    piwi
    Je sers la science et c'est ma joie.... Il parait.

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