Actualité - En vidéo : BigBrain, l’atlas 3D du cerveau à la résolution inégalée

[V5bot]

Des chercheurs allemands et canadiens viennent de présenter leur atlas en 3D d’un cerveau humain, à une résolution de 20 µm, soit 50 fois plus précis que ce qui se faisait jusque-là. Ce projet, nommé BigBrain,...

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[invite73192618]

Allo,

Janlou Chaput, pourrais-tu en dire plus sur le fait qu'il a fallu 10 ans? Ce n'est pas 10 ans de traitement ni de collecte, est-ce que ce serait 10 ans... avant que le projet soit finalement financé?

Quelques remarques:
-1000 heures, c'est probablement le temps de coupe et non le temps de calcul (qui n'est d'ailleurs pas complètement automatisé)
-les meilleurs microtomes peuvent aller jusqu'à quelques dizaines de nanomètre, échelle à laquelle on peut observer l'intérieur des synapses. Évidement traiter et stocker 1 zettaoctet sera une autre paire de manche
-je ne pense pas qu'on puisse superposer une carte de l'activité génique étant donné qu'il s'agit d'un cerveau individuel (sauf si ces données ont été collectées). Par contre on pourrait avec presque la même technique utiliser différents colorants pour identifier l'expression génétique, les canaux, etc.

[ansset]

bjr,
j'ai compris 10 ans au total, depuis la conception initiale.
1000 heures , mais sur combien de CPU ?
et celà intègre probablement le traitement fin et les corrections.

[JPL]

-les meilleurs microtomes peuvent aller jusqu'à quelques dizaines de nanomètre, échelle à laquelle on peut observer l'intérieur des synapses.

Tu veux parler des microtomes pour microscopie électronique avec inclusion d'une pièce de quelques millimètres maximum dans une résine époxy ? Là on parle d'inclusion à la paraffine (qui a dû être extrêmement longue pour assurer une pénétration complète). Recueillir des tranches entières de cerveau de 20 µm sans en déchirer une seule c'est un exploit (même si c'est très épais : pour de la microscopie classique c'est au plus 10 ou 5 µm). Je crois me souvenir que dans les temps antiques on utilisait pour des pièces aussi étendues une inclusion à la celloïdine.

[A voir en vidéo sur Futura]

[invite73192618]

Tu veux parler des microtomes pour microscopie électronique

Tout-à-fait. Cela dit ce n'est probablement pas la méthode la plus facile étant donnée les progrès en "supermicroscopie " qui permettent des résolutions de quelques dizaines de nanomètres sans besoin de couper aussi fin que pour la microscopie électronique.

[JPL]

Les choses ont bien changé depuis l'époque où je pratiquais ces techniques.

[invite73192618]

A qui le dis-tu, on serait aussi bien de repasser nos diplômes de biologie tellement ça va vite.

[JPL]

Si tu dis ça à 36 ans imagine ce que ce doit être pour moi !

[plof]

Quid de la résonance magnétique nucléaire ? Il me semblait qu'un gros projet européen était en cours de démarrage sur la modélisation du cerveau, avec d'importants moyens en RMN pour des cartographies de cerveau ?