Actu - Une bactérie inconnue découverte dans l’ISS

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Une bactérie piégée dans un filtre installé dans la Station spatiale internationale a été repérée par une équipe du JPL et son espèce n’était pas connue. Elle n'est bien sûr pas « extraterrestre »...

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[Geb]

Bonsoir,

Parmi les auteurs de l'article publié dans l'édition d'avril 2017 de l'International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, on trouve, certes, deux employés du JPL, mais aussi trois employés de la Microbial Type Culture Collection & Gene Bank située dans les locaux de l'Institute of Microbial Technology (IMTECH) à Chandigarh dans le nord de l'Inde (à ~200 km de la frontière pakistanaise).

Aussi, étant donné que d'après les estimations les plus récentes, le nombre d'espèces de procaryotes serait compris entre quelques millions et 1000 milliards (sachant qu'on en a décrit environ 15000), même si le lieu de la trouvaille est assez insolite, il n'y a effectivement pas à s'étonner que la bactérie en question soit inconnue sur Terre. Il y a de très nombreuses espèces de micro-organismes qui restent à découvrir.

Cordialement.

[Topix]

Enfin, que cette bactérie soit inconnue n'est pas étonnant non plus. Une récente extrapolation, sur la base des données recueillies par le Earth Microbiome Project (recensement des bactéries mondiales), le Human Microbiome Project (étude de la flore bactérienne portée par les humains) et les deux expéditions Tara Oceans, parvenait à une estimation de mille milliards d'espèces de bactéries (1012), alors que nous n'en connaissons que dix millions (107). Devant l'une d'elles, nous n'avons donc qu'une chance sur cent mille de tomber sur une espèce déjà rencontrée...

Dit comme ça, je pense que c'est un peu trompeur... dans un environnement donné, la chance ne doit pas être d'1 sur 100 000.

On pourrait faire une remarque similaire pour les insectes, oui mais si l'on vit en région parisienne, la probabilité de trouver une espèce inédite est quand même assez rare.

[Geb]

Bonjour,

Enfin, que cette bactérie soit inconnue n'est pas étonnant non plus. Une récente extrapolation, sur la base des données recueillies par le Earth Microbiome Project (recensement des bactéries mondiales), le Human Microbiome Project (étude de la flore bactérienne portée par les humains) et les deux expéditions Tara Oceans, parvenait à une estimation de mille milliards d'espèces de bactéries (10¹²), alors que nous n'en connaissons que dix millions (10⁷). Devant l'une d'elles, nous n'avons donc qu'une chance sur cent mille de tomber sur une espèce déjà rencontrée...

Dit comme ça, je pense que c'est un peu trompeur... dans un environnement donné, la chance ne doit pas être d'1 sur 100 000.

On pourrait faire une remarque similaire pour les insectes, oui mais si l'on vit en région parisienne, la probabilité de trouver une espèce inédite est quand même assez rare.

Voici un article de presse qui a pour sujet cette "récente extrapolation" :

- Earth may be home to 1 trillion species

On y trouve une remarque à mettre en parallèle avec celle de l'auteur de l'article de Futura :

“Of those cataloged species, only about 10,000 have ever been grown in a lab, and fewer than 100,000 have classified sequences,” Lennon says. “Our results show that this leaves 100,000 times more microorganisms awaiting discovery — and 100 million to be fully explored. Microbial biodiversity, it appears, is greater than ever imagined.”

De ces 10 millions d'espèces soit-disant cataloguées, environ 1 sur 10.000 ont été cultivées en labo, et une sur 100.000 ont des séquences classifiées. Puis, on retrouve la remarque de l'auteur de l'article pour Futura en ces mots : "Our results show that this leaves 100,000 times more microorganisms awaiting discovery".

Le papier des chercheurs :

- Scaling laws predict global microbial diversity (Locey & Lennon, 2016)

Donc, d’après cette étude récente (2 mai 2016) de Locey & Lennon, il y aurait entre 3,9 ± 0,05 × 10¹¹ et 3,2 ± 0,23 × 10¹² espèces de "microbes" (bactéries, archées et champignons microscopiques confondus) au niveau mondial.

Aussi, d’après la même étude, si on extrapole les données du Earth Microbiome Project (EMP), on aurait un nombre d’espèces supposées par métagénomique compris entre 6,9 × 10⁴ et 5,6 × 10⁶ espèces. Mais là aussi, il ne s’agit que d’une estimation du nombre total d’espèces de "microbes" (bactéries, archées et champignons microscopiques).

Or, le nombre de procaryotes décrits dans les Approved Lists of Bacterial Names (voir ici) est, au 25 mai 2017, de "seulement" 15626 espèces.

En outre, l'estimation du nombre total d'espèces de procaryotes sur la Terre varie énormément. Il n'y a aucun consensus sur la question à ma connaissance, comme je le disais par ailleurs dans une autre discussion, il y a quelque temps.

Les estimations vont de quelques millions pour les uns (Amanna & Rosselló-Móra, 2016) à plusieurs milliers de milliards pour les autres (Locey & Lennon, 2016, citée ci-dessus).

Et franchement, les arguments d'Amanna & Rosselló-Móra (2016), eux-mêmes largement basés sur les résultats de Schloss et al. (2016), ne sont pas dénués de sens.

En ce qui me concerne, je suis plus enclin à me tourner vers l'hypothèse conservatrice d'Amanna & Rosselló-Móra, sans pour autant y souscrire parfaitement. Le problème c'est qu'il s'agit surtout d'un problème de définition.

Cordialement.

[A voir en vidéo sur Futura]

[Topix]

Oui, cela fait une énorme variation. Et puis comme vous le précisez, c'est au niveau mondial et ce chiffre doit inclure beaucoup de micro-organismes que l'on trouve essentiellement dans le milieu marin.

Avec l'hypothèse conservatrice couplée aux environnements que les humains fréquentent réellement, la probabilité de trouver de nouvelles espèces doit baisser drastiquement.

Ce qui serait intéressant, c'est d'essayer de trouver la bactérie inédite de l'ISS sur Terre.