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Actu - La bactérie E. coli recréée avec un génome entièrement artificiel et compressé



  1. #1
    RSSBot

    Post Actu - La bactérie E. coli recréée avec un génome entièrement artificiel et compressé

    C’est le plus grand génome jamais reconstitué : des chercheurs ont réussi à fabriquer en laboratoire les quatre millions de paires de bases de la bactérie Escherichia coli, et même à le «...

    Lire la suite : La bactérie E. coli recréée avec un génome entièrement artificiel et compressé

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  3. #2
    vgondr98

    Re : Actu - La bactérie E. coli recréée avec un génome entièrement artificiel et compressé

    Citation Envoyé par FUTURA Voir le message
    Les protéines nécessaires au fonctionnement de l’organisme sont constituées d’acides aminés, eux-mêmes composés de codons, une séquence de trois nucléotides sur l’ARN messager. Le codon CUU va par exemple générer l’isoleucine, un acide aminé impliqué dans la synthèse de glucose. Comme il n’existe que 20 acides aminés différents, on pourrait penser qu’il suffit de 20 codons pour le produire. Hélas, le code génétique est plein de redondances pour des raisons encore assez inconnues. La sérine par exemple est codée par six codons différents. Au total, il existe 61 codons, plus les trois codons Stop indiquant à l’ARN où arrêter et commencer l’acide aminé, soit 64 codons sur lesquels repose entièrement la vie.
    Bonjour, j'ai repéré une erreur dans cet encart. En effet les acides aminés ne sont pas composés de codons puisque les codons sont un constituant de l'ARNm tandis que les acides aminés sont un constituant des protéines. Il est également faux de dire qu'un codon génére un acide aminé. Ce qui se passe c'est que un ARNm est "capturé" par une protéine appelé ribosome qui lit les codons au fur et à mesure. Dès qu'un codon est identifié par le ribosome, le ribosome met en place l'acide aminé correspondant et passe au codon suivant. Cette étape s'appelle la traduction. Elle débute lors de la reconnaissance du codon d'initiation et se termine lors de la reconnaissance du codon stop.
    L'étape de reconnaissance du codon et de mise en place de l'acide aminé correspondant a lieu grâce à de petits ARN appelés ARNt (t pour transfert). Ces ARNt sont constitués de deux parties, une partie qui se fixe sur les codons de manière spécifiques et une partie associé à un acide aminé.

    Les ARNt se fixe de manière spécifiques surtout sur les deux premiers nucléotides d'un codon, le troisième nucléotide offrant plus de libertés. Cela explique la redondance du code génétique (Le code génétique est l'ensemble des règles permettant de traduire les informations contenues dans le génome des cellules vivantes afin de synthétiser les protéines) qui est donc implémenté par les ARNt.

  4. #3
    Flyingbike

    Re : Actu - La bactérie E. coli recréée avec un génome entièrement artificiel et compressé

    pour rebondir à propos de ce paragraphe :

    la redondance du code génétique est au moins en partie une forme de protection contre les mutations faux sens ou non sens

    Le codon CUU va par exemple générer l’isoleucine, un acide aminé impliqué dans la synthèse de glucose. Comme il n’existe que 20 acides aminés différents, on pourrait penser qu’il suffit de 20 codons pour le produire.
    je n'ai pas compris ce que le glucose venait faire là dedans...
    La vie trouve toujours un chemin

  5. #4
    vgondr98

    Re : Actu - La bactérie E. coli recréée avec un génome entièrement artificiel et compressé

    Citation Envoyé par FUTURA Voir le message
    Au total, il existe 61 codons, plus les trois codons Stop indiquant à l’ARN où arrêter et commencer l’acide aminé
    Cette phrase est fausse également, car le codon d'initiation de la traduction n'a rien à voir avec les codons stop.

  6. #5
    Bounoume

    Re : Actu - La bactérie E. coli recréée avec un génome entièrement artificiel et compressé

    Excellent rappel à la loi: ça rafraîchit des souvenirs un peu estompés....

    une réflexion:
    après avoir pu modifier de grandes longueurs de code, on va pouvoir expérimenter aussi l'effet des suppressions/ajouts des (fréquentes) copies multiples d'un gène, et aussi élucider le rôle des (nombreuses) séquences (en apparence) non codantes (en apparence) de l'ADN......

    par contre, bidouiller pour faire des protéines avec des acides aminés exotiques..... c'est pas demain la veille....
    le bruit tue l'information......

  7. A voir en vidéo sur Futura
  8. #6
    JPL

    Re : Actu - La bactérie E. coli recréée avec un génome entièrement artificiel et compressé

    Citation Envoyé par Bounoume Voir le message
    par contre, bidouiller pour faire des protéines avec des acides aminés exotiques..... c'est pas demain la veille....
    Là par contre il faut bidouiller les ARN de transfert.
    Rien ne sert de penser, il faut réfléchir avant - Pierre Dac

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  10. #7
    Flyingbike

    Re : Actu - La bactérie E. coli recréée avec un génome entièrement artificiel et compressé

    Citation Envoyé par Bounoume Voir le message

    par contre, bidouiller pour faire des protéines avec des acides aminés exotiques..... c'est pas demain la veille....
    Pourquoi tant de certitudes... ça se fait déjà depuis un certain temps....
    https://www.mdpi.com/1422-0067/20/3/522/htm
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/m/pubme...076453/related

    Là par contre il faut bidouiller les ARN de transfert.
    Ça se fait. Il y a même des équipes qui ont mis au point des systèmes pour des codons à 4 bases
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/m/pubme...310775/related
    Dernière modification par Flyingbike ; 18/05/2019 à 03h05.
    La vie trouve toujours un chemin

  11. #8
    jacquolintégrateur

    Re : Actu - La bactérie E. coli recréée avec un génome entièrement artificiel et compressé

    Citation Envoyé par Futura Voir le message
    Ces travaux ouvrent la voie à la synthèse d’organismes dotés de fonctions particulières, notamment pour fabriquer des molécules d’intérêt chimique ou des médicaments.
    Bonjour
    Autrement dit, on a réalisé la synthèse de la vie! Mais en copiant ce qui existe. Un peu comme si, pour réaliser une machine, on copiait toutes ses pièces, puis substituait, une par une, les copies aux pièces de l'original.
    Cordialement
    Ne jetez pas l’anathème : il peut servir !

  12. #9
    JPL

    Re : Actu - La bactérie E. coli recréée avec un génome entièrement artificiel et compressé

    Citation Envoyé par Flyingbike Voir le message
    Ça se fait. Il y a même des équipes qui ont mis au point des systèmes pour des codons à 4 bases
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/m/pubme...310775/related
    Je n’ai pas dit le contraire, sinon j’aurais écrit : il faudrait.
    Rien ne sert de penser, il faut réfléchir avant - Pierre Dac

  13. #10
    Flyingbike

    Re : Actu - La bactérie E. coli recréée avec un génome entièrement artificiel et compressé

    Je n’en doute pas
    En cherchant le lien j’ai vu qu’il y avait des codons à 5 bases aussi. Ça en fait des combinaisons !

    Par contre c’est du boulot à s’arracher les cheveux, je pense....
    La vie trouve toujours un chemin

  14. #11
    JPL

    Re : Actu - La bactérie E. coli recréée avec un génome entièrement artificiel et compressé

    Mais il faut qu’il y ait de tRNA adaptés et là je pense qu’il faut inventer la boucle de bout en bout ainsi que la zone de reconnaissance de l’aminoacide.
    Rien ne sert de penser, il faut réfléchir avant - Pierre Dac

  15. #12
    Flyingbike

    Re : Actu - La bactérie E. coli recréée avec un génome entièrement artificiel et compressé

    j'ai pas regardé en détail, mais oui, c'est du tRNA engineering, et ça doit pas être facile parce que ces bestioles là, niveau structure secondaire, c'est un bazar !

    Il me semble même qu'une approche a nécessité l'optimisation/modification du ribosome
    La vie trouve toujours un chemin

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