Dénaturation de l'adn en pH acides

[Didie13]

Bonjour à tous,

Voilà j'aurais une question.
Je sais qu'on dénature l'adn en pH acide. Il me semble que c'est parce que les liaisons phosphates se rompent (car elles ont un pK faible).
Mais est ce que quelqu'un aurait un schéma ou pourrait m'expliquer plus précisement ce qui se passe lors de la dénaturation de l'adn en pH acide?

Merci d'avance
Didie13

PS: Je suis en 1ère année de licence Bio.

[DaoLoNg WoNg]

Salut.

Dénaturer l'ADN signifie qui tu sépares les deux brins. Il n'est pas question de cliver l'ADN lui même. Ce sont donc les liaisons hydrogènes qui cèdent. A confirmer...

Bonne continuation.

[jess88]

Bonsoir,

Je confirme, une dénaturation est la rupture des liaisons hydrogénes, donc separer les 2 brins d'ADN, la rupture de liaisons phosphodiester est une degradation.

Désolé de ne pas apporter plus d'element de réponse a ta question, car le milieu acide, je n'ai aucune idé, mais par contre on m'a déjà répondu concernant le milieu basique si cela t'interresse, fais moi signe, je retrouverai le lien .

Bonne soirée
Jess

[Didie13]

Merci pour vos réponses!
Ma prof n'a pas du employer le bon mot alors, puisqu'elle me parle de "dégradation" en milieu acide...
Donc je vais voir si quelqu'un d'autre sait quelque chose.

Merci jess88 pour le milieu basique j'ai aussi les informations nécessaires

[Didie13]

D'ailleurs en parlant de "dénaturation" de l'ADN, on parle souvent de digestion par des enzymes de restriction de l'ADN avant des techniques de séquençages comme des Southern blot etc...

J'aimerais savoir: Peut-on digérer n'importe quel ADN (génomique) par des enzymes de restriction?

Merci d'avance
Didie13

[mantOs]

J'aimerais savoir: Peut-on digérer n'importe quel ADN (génomique) par des enzymes de restriction?

Biensur

Certaines enzymes de restrictions ont des fréquences de coupures plus grandes suivant la complexité de la séquence reconnue .


Cordialement
Paul

[Didie13]

Ok! Merci beaucoup!

[gorben]

J'aimerais savoir: Peut-on digérer n'importe quel ADN (génomique) par des enzymes de restriction?

Didie13

Salut,

Pas necessairement, souvent n'importe quelle enzyme de restriction coupera n'importe quel ADN genomique. Cependant il y a certaines limites. Par exemples :
- Une enzyme ne coupera pas l'ADNg de la souche productrice parce que ce dernier est methyle specifiquement pour empecher la coupure.
- Dans le meme esprit, une enzyme ne pourra en aucun cas couper un ADNg d'une bacterie methylant le site de coupure.


De plus, petite precision, le southern blot n'est pas une technique de sequencage.

A+

[Didie13]

Ah ok Merci pour ces précisions!

Mais le southern blot tu appelles ca comment alors?

[gorben]

heu... ben southern blot c'est le nom de la methode. Le principe de la methode est d'hybrider une sequence d'ADN connue sur un pannel de sequence d'ADN inconnues (banque d'ADN, ADNg coupé par des enzymes de restriction, etc...) pour mettre en evidence la presence ou l'absence de la sequence connue.
En aucun cas tu ne peux sequencer par cette methode qui ne te permet d'affirmer que 2 choses :
- presence de la sequence connue dans la sequence inconnue et selon les conditions le nombre de copies
- absence de la sequence connue dans la sequence inconnue.

[Didie13]

Aaah ok! Oui je vois... (doucement doucement tout s'éclaircit...)

Donc en fait c'est le même principe pour le Northen Blot pour l'ARN et le Western Blot pour les protéines. Aucun séquençage n'est possible. Tout n'est qu'identification.

Merci Gorben!