brin sens / brin antisens

[mimismall]

bonjour tout le monde!
j'ai mes exam dans deux semaines mais une petite notion sur l'ADN me gène!!peut etre avez vous une idée?
Comment differencie t'on le brin sens de l'adn du brin antisens? dans le but de le placer dans un plasmide.
merci beaucoup. a bientot

[sed s/war/peace/ *]

Parler de brin sens ou antisens sur l'ADN n'a de sens (humour) que si on se place dans le contexte de la transcription.
Le brin sens est celui qui a la même séquence nucléotidique que l'ARN messager transcrit (T / U mis a part bien sûr). Le brin antisens sert de matrice à la polymerase.
L'ARN est polymerisé du 5' au 3'.
La matrice (brin "antisens") peut donc être représenté du 3' au 5'
Le brin complémentaire (brin "sens") est donc représenté du 5' au 3'.

sens 5'-ATTTGCTGCCTT...TGC-3'
antisens 3'-TAAACGACGGAA..ACG-5'

messager 5'-AUUUGCUGCCUU..UGC-3'
(police de merde !)



Hope this help.

[jmbowie]

Les termes "sens" et "antisens" dépendent du sens de transcription de ton gène d'intérêt!!!
En général, le brin "sens" (brin "+") est celui que l'on représente 5' -> 3' et le brin "antisens" (brin -) son antiparallèle.

[mimismall]

merci beaucoup pour vos reponses

[Perco]

et dans le cadre d'une PCR? je n'arive jammais à me souvenir qui est l'amorce sens de l'antisens ?

5' NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNN 3'
-------------------------------------------NNNNN <- amorce 1
--NNNNNN <- amorce 2
3' NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNN 5'

alors amorce 1 ou 2 ?( les - ne représente rien c'est juste pour les espacements)

merci

[jmbowie]

et dans le cadre d'une PCR? je n'arive jammais à me souvenir qui est l'amorce sens de l'antisens ?

5' NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNN 3'
-------------------------------------------NNNNN <- amorce 1
--NNNNNN <- amorce 2
3' NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNN 5'

alors amorce 1 ou 2 ?( les - ne représente rien c'est juste pour les espacements)

merci

Dans ce cas là, on appelle souvent amorce "sens" celle qui va "de gauche à droite" , c'est à dire l'amorce 2 (amorce de séquence identique au brin sens).

[jeje12.ultra]

Attention a tous .... vous rappele que le therme sens anti-sens n'est pas qu'une spéculation ... sa existe vraiment !! car si l'on prend en compte le ARNm , il se finissent par une queue d'acides aminées poly A. 5'-> ATGCATGGTCATGAAAAAAAAAAA 3'
donc sont brin anti-sens devrai avoir une queue T....

il y aussi les histoir de CDNA....

a discuté si sa vous interresssss

[Yoyo]

Attention a tous .... vous rappele que le therme sens anti-sens n'est pas qu'une spéculation ... sa existe vraiment !! car si l'on prend en compte le ARNm , il se finissent par une queue d'acides aminées poly A. 5'-> ATGCATGGTCATGAAAAAAAAAAA 3'

Ce ne sont pas des acides aminés, ce sont des nucleotides.

donc sont brin anti-sens devrai avoir une queue T....

he non la queue polyA est rajouté apres la transcription, elle n'est pas présente dans l'ADN.

YOyo

[akimniktou]

Ce ne sont pas des acides aminés, ce sont des nucleotides.

he non la queue polyA est rajouté apres la transcription, elle n'est pas présente dans l'ADN.

YOyo

bonjour juste une petite précision
la queue polyA est rajouté juste apres la transcription mais toujours par l'ARN pol et seulement parce qu'il y a un site de ployadénylation sur l'adn de séquence AATAAA que l'ARN pol reconnait

[LXR]

Bonjour,

Le signal de polyadénylation est reconnue par un complexe de clivage qui reconnait la séquence AAUAAA, la clive, et ce complexe recrute ensuite la polyadenylate polymérase qui va synthétiser la queue polyA en 3' du site clivé.

Greg

[major_nobody]

C'est dingue...personne n'est d'accord...

En réalité le "signal de polyadénylation" se trouve sur l'ADN (c'est AATAAA), situé en aval d'un site d'arrêt prématuré de la transcription, il est là pour rappeler à l'ARN pol II qu'il doit synthétiser la queue poly A, et il est transcrit en AAUAAA (par l'ARN pol II) dans le pré-ARNm.
Lors de la maturation du pré-ARNm (après la fin de la transcription), un facteur "CPSF" (Facteur particulier de Clivage et de Polyadénylation) se fixe sur le pré-ARNm au niveau du site AAUAAA, et un autre facteur "CSTF" (facteur stimulant le clivage) se fixe sur le pré-ARNm au niveau d'une séquence G/U (située en 3' ).
Deux facteurs (CFI et CFII) se fixent entre CPSF et CSTF, et l'enzyme Polyadénylate Polymérase vient alors se fixer sur le complexe (CPSF + CSTF + CFI + CFII) et provoque le clivage ENTRE AAUAAA et G/U, et non pas SUR AAUAAA.
Les facteurs de clivage se dissocient du pré-ARNm et c'est en aval de AAUAAA que les "A" sont ajoutés (environ 200 ou 250 Nucléotides) par la PolyA Polymérase et l'activateur PABII...

Pour ce qui est des amorces lors de la PCR:
-l'amorce "sens" s'hybride en 3' du brin antisens
-l'amorce "antisens" s'hybride en 3' du brin sens.

Brin sens :...........5' AATCCGTAACGTCATGGGC 3'
Amorce antisens:...............<==== 3' TACCCG 5'

Brin antisens :......3' TTAGGCATTGCAGTACCCG 5'
Amorce sens :......5' AATCCG 3' ====>

Si vous regardez bien, l'amorce antisens est identique au début (5') de la séquence du brin antisens, donc elle est COMPLEMENTAIRE de la fin (3') du brin sens, où elle s'hybride.
Même chose avec l'amorce sens qui est identique au début du brin sens, donc complémentaire à la fin du brin antisens, où elle s'hybride.