exercices sur l'interaction proteine ligand

[futur biologiste]

bonsoir ,j'ai un cours d'enzymologie dans lequel an a abordé l'interaction entre proteine et ligand ...la representation de scatchard et jaimerais bien savoir si quelqun a des exercices traitant ce sujet .merci

[léo2]

Salut,

Je n'ai pas d'exo à te proposer.Mais je croyais que la représentation de scatchard est utilisable pour caractériser la capacité d'un ligand à se fixer sur sa cible (et pas pour l'enzymo): en utilisant le fait que:

récepteur + ligand donne Ligand lié (de manière réversible) et que concentration en ligand (connu dés le départ)= ligands libre + ligand lié
En général,on utilise un ligand radiomarqué et on sépare (filtration ou colonne) le ligand libre et le ligand lié.Par comptage de la radioactivité,on a accés à la concentration du ligands libre et lié.On fait alors un graph en représentation de scatchard: ligand lié/ligand libre=f(ligand lié). on obtient une droite qui coupe l'axe des abscisses en un point qui correspond au nombre de site de liaison fixant la protéine et la pente correspont à (-1/Kd(constante de dissociation à l'équilibre révélateur de l'affinité) si mes souvenirs sont bon). Si tu fais la même manip avec un inhibiteur, en scatchard, tu peux déterminer si c'est compétitif (pas de variation du nombre de site mais variations du Kd) ou non compétitif. A mon avis, il faut savoir à partir de données (par exemple, valeur de radioactivité aprés séparation libre lié avec ou sans inhibiteur):tracez un scatchard, déterminer le Bmax et le Kd, savoir si ily a un ou plusieurs sites de liaisons, caractériser l'inhibition compétitif ou pas de l'inhibiteur.
En enzymo, c'est différent: on a enzyme +substrat donne ES qui donne un produit, dans ce cas,on détermine le Vmax et le Km avec les représentations de Lineweaver Burke (par exemple)