la bioinformatique

[invited7465f38]

salut,
y'a t-il quelqu'un qui pourrait m'aider à contruire un arbre phélogénétyque aprés une analyse à partir de la base de données NCBI format FASTA et BLAST
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[MaliciaR]

Salut,
un arbre phylogénétique peut être construit avec BioNumerics.
Sinon, étant donné que c'est un logiciel payant, essaie avec PHYLIP, PHYML ou fastDNAml 1.2. C'est mieux si tu as eu une petite formationa avant quand même, ce n'est pas vraiment très intuitif.

J'espère que ça aide.

Cordialement,

[invited7465f38]

merci pour le coup de main !

[John78]

Salut
Sur ton fichier de sortie de blast fait au ncbi au format HTML tu as une option "construct the distance tree" qui te permet d'avoir l'arbre. Je sais pas si le résultat est hyper fiable vu la méthode utilisée mais ca te donne un aperçu global de l'arbre sans se prendre la tête.
A+
J

[A voir en vidéo sur Futura]

[invited7465f38]

merci john78