Identité de séquence et similarité

[bobmadinina]

Bonjour, je voudrai connaitre la différence entre l'identité de séquence et la similarité entre 2 protéines. Merci

[MaliciaR]

Salut

Beh identité ça veut dire ce que ça veut dire : deux résidus sont identiques.
Pour similarité, je pense que tu veux parler de similarité de séquences. Ca signifie qu'un résidu a été substitué par un autre avec des propriétés biochimiques similaires. Exemple : Arg et Lys.

Hope that helps

[bobmadinina]

Merci de ta réponse, mais en fait j'aurai besoin d'une définition plus précise, que j'arrive pas à obtenir ailleur sur le net ... Pour mercredi je doit expliquer un article dans lequel les auteurs comparent 2 protéines (cdc25A et cdc25B pour la petite histoire qui ont respectivement 66.7% et 76.5% d'identité de séquence et de similarité.

[MaliciaR]

Merci de ta réponse, mais en fait j'aurai besoin d'une définition plus précise, que j'arrive pas à obtenir ailleur sur le net ... Pour mercredi je doit expliquer un article dans lequel les auteurs comparent 2 protéines (cdc25A et cdc25B pour la petite histoire qui ont respectivement 66.7% et 76.5% d'identité de séquence et de similarité.

Je ne vois pas de quelle autre définition tu pourrais avoir besoin Ce serait par contre mieux que tu donnes les détails de ton article. Je peux dire des âneries, mais c'est possible que tes deux prot ont 66.7% d'identité de séquences et dans le restant qui est différent, elles partagent 76.5% de similarité.

Mais bon, ça c'est de l'extrapolation. Donne des détails (logiciel d'alignement, paramètres de l'alignement tels matrice utilisée, pénalités de gap et d'extension de gap) et on y verra plus clair.