Problème sur un exercice de génotypage

[laniae37]

Bonjour à tous,

j'essaie de comprendre un exercice de génotypage à l'aide de marqueurs microsatellites mais je n'ai pas tout compris à cette technique et je n'arrive à rien.
Pourriez-vous répondre à quelques questions svp ?
On doit génotyper 92 génotypes avec 4 marqueurs microsatellites.
On doit alors expliquer comment on poursuivrait l'expérimentation face aux situations suivantes :
- Vous faites une PCR avec le premier marqueur puis les produits d'amplification sont séparés par électrophorèse et vous n'observez rien. Pourquoi ?

-Vous faites une PCR avec le premier marqueur puis les produits d'amplification sont séparés par électrophorèse et 5 individus ne présentent aucune bande. Pourquoi ?

- Vous avez eu des résultats satisfaisants pour 3 marqueurs sur l'ensemble des individus et pour le quatrième marqueur vous n'observez aucune bande sur 30 individus. Pourquoi ?

Voilà... si vous pouviez m'aider et m'expliquer ce serait vraiment sympa. Merci beaucoup par avance
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[chamouulox]

si le profil electrophorétique de ton produit pcr ne permet pas l'observation de bandes deux possibilités :

1- le marqueur ciblé par les primers n'est pas présent dans l'acide nucléique testé (rien a amplifier => pas de bande)

2- les amplicons obtenus sont si petits qu'ils sont sortis du gel lors de la migration électrophorétique

cordialement,