Calcul de retrotransposition

[invite404cc6c8]

Bonjour,

Suite à un TP sur l'analyse de la retrotransposition chez la levure, on a un compte-rendu classique a faire. Mais il nous faut déterminer le nombre de retrotransposition effectuees dans une levure qui l'a subit efficacement.

J'ai strictement aucune idee de faire....

Vous auriez pas des ptits tuyaux des fois?...

Merci d'avance
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[invitefe7212d1]

Salut

Quels sont les données dont tu disposes car la il est difficile de t'aider.

Lilie

[invite404cc6c8]

Effectivement ca peut etre fort utile ^^""

Alors je sais pas si je vais bien mettre des trucs utiles...

- Le fragment d'interet fait 1.7kbp avec intron et 0.5 sans
- il y a 4 400 levures ayant subit la transposition
- l'electrophorese du produit de PCR sur le fragment qui peut subir la transposition montre une grosse bande d'ADN à 5kbp
- la frequence de transposition est de 6,8.10-4 soit 0,068%

Voila dit moi s'il manque des trucs a ton avis parce que c'etait un gros TP et y a bcp de données...je vois pas trop comment trier....

[MaliciaR]

il nous faut déterminer le nombre de retrotransposition effectuees dans une levure qui l'a subit efficacement.

- il y a 4 400 levures ayant subit la transposition
(...)
- la frequence de transposition est de 6,8.10-4 soit 0,068%

C'est moi ou il y a un souci dans tes questions et donnees?

[A voir en vidéo sur Futura]

[invite404cc6c8]

Arf...je vais reformuler la question alors...


Il faut determiner le nombre d'elements transposes dans 1 levure qui a subit cette transposition efficacement.

Et je suis pas tres douee dans cette matiere alors je suis loin de tout comprendre, c'est le flouuuuuuuu bien flouuuuuuu......


Si tu pouvais aussi m'expliquer pourquoi ca t'as paru bizarre mon truc, ca m'aidera peut etre un peu...

[MaliciaR]

Bon, on va reprendre les choses histoire de comprendre un peu de quoi parle ton TP. Parce que la, j'avoue que ce n'est pas clair...
Tu as un endroit dans tes levures ou un element transposable peut s'inserer. Tu sais que cet element est un fragment d'une certaine taille (connue pour toi).
Donc, si tu fais une PCR sur l'endroit en question, tu t'attends a quelles tailles de bandes si pas d'insertion de cet element et si insertion?

P.S. Pourquoi ca m'a paru bizarre? Beh tu demandes un % de transposition dans ton 1er post et tu le donnes ensuite ... Ce que tu viens de poser comme question (ie, nombre d'elements inseres) n'est absolument pas clair pour moi a partir de tes autres posts...