Bonjour tout le monde,
J'ai une petite question, car je prépare un concours en autodidacte.
Une question me demande ce qu'est un ORF ainsi que le nom et la fonction des séquences avant et après l'ORF.
Pour l'ORF, j'ai dit que c'est le "cadre ouvert de lecture", qui commence et se termine par un codon STOP.
Par contre pour les séquences avant et après, je ne vois vraiment pas.
Quelqu'un pour m'aider ?
Merci d'avance.
Bonjour.
Un ORF est une séquence qui commence par un codon d'initiation (ATG) et se termine par un codon stop.
J'imagine que la réponse attendue est que les séquences en amont et en aval sont des séquences non traduites participant à la régulation de la transcription et de la traduction (notamment les régions dites 5'-UTR ou 3'-UTR) cependant je tiens a préciser que la notion d'ORF désigne des séquences POTENTIELLEMENT codantes et n'a rien à voir avec la réalité de l'existence d'un gène puis d'une protéine.
PS : l'article ORF de wikipedia dit que les ORF sont délimités par 2 codons stop. Dans la réalité de la biologie, quand on recherche des ORF on se base sur des séquences telles que je les ai décrites plus haut. LE reste de l'article n'est pas très rigoureux ni intéressant.
Dernière modification par Flyingbike ; 22/01/2013 à 07h19.
Merci beaucoup.
Et par curiosité, pourquoi est-ce des séquences potentiellement codantes et pas codantes tout court ?
parce qu'une ORF se définit simplement par ce qui est compris entre deux codons. Etant donné la fréquence de ces codons, on peut avoir des millions d'ORF dans le génome.
Cependant expérimentalement on vérifiera très simplement que la présence d'une ORF, c'est à dire d'une séquence encadrée par un codon d'initiation et d'un codon stop, n'est pas systématiquement liée à l'existence d'un messager correspondant, puis d'une protéine.
Merci beaucoup
