Protéine lysine free

[Vinc]

Bonjour à tous!
Je cherche une protéine sans lysine dans sa séquence?? En connaissez vous une ?

Merci d'avance...

V.
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[Vinc]

Bon....
Ma question n'a pas eu beaucoup de succès mais j'ai ma réponse! Pour ceux que ça intéresse, il existe des programmes permettant de cribler une banque en excluant un ou plusieurs acides aminés..... vive la bioinfo....

V.

[MaliciaR]

Salut,

Elle s'appelle comment, ta prot?
Et elle aura quelles propriétés?

Cordialement,

[Vinc]

Non en fait c'est pour un test, il me faut une protéine sans lysine pour mettre un domaine Cter....

V

P.S: les Bonobos ont eu raison de mon stress...............

[A voir en vidéo sur Futura]

[Yoyo]

Non en fait c'est pour un test, il me faut une protéine sans lysine pour mettre un domaine Cter....

et si tu nous donnais le lien vers ton programme, ca serait sympa non?

P.S: les Bonobos ont eu raison de mon stress...............

ah mon pauvre... j'espere au moins que tu n'as pas eut trop de shift sur tes autoradios

Yoyo

[MaliciaR]

En quoi les lysines empêcheraient l'addition d'un Cter? Moi rien comprendre aux protéines

Je t'ai dit que fallait pas être réfractaire aux Bonobos...

Cordialement,

[Vinc]

et si tu nous donnais le lien vers ton programme, ca serait sympa non?

Je ne sais pas si tu le mérites............
Mais je suis un seigneur.....

http://www.expasy.ch/tools/scanprosite/http://www.expasy.ch/tools/scanprosite/

Et la notice eplicative:

http://www.expasy.ch/tools/scanprosi...html#patsyntaxhttp://www.expasy.ch/tools/scanprosi...html#patsyntax

ah mon pauvre... j'espere au moins que tu n'as pas eut trop de shift sur tes autoradios

Le plus difficile ce sera de les expliquer en réunion de labo............

En quoi les lysines empêcheraient l'addition d'un Cter? Moi rien comprendre aux protéines

Non non c'est juste que je veux mettre un Cter sur une protéine qui n'a pas de lysine....

[MaliciaR]

En réunion de labo... et en "Matériels et méthodes" aussi...

Cordialement,

[jmbowie]

Non en fait c'est pour un test, il me faut une protéine sans lysine pour mettre un domaine Cter....

V

P.S: les Bonobos ont eu raison de mon stress...............

Et tu en as trouvé beaucoup de ces protéines? chez quels organismes? quel est ce programme?

Ca m'intéresse

[Yoyo]

Le plus difficile ce sera de les expliquer en réunion de labo............

Je croyais que c'etait une coutume dans ton labo

Non non c'est juste que je veux mettre un Cter sur une protéine qui n'a pas de lysine....

ca je suis sur que c'est pour savoir si les lys presentent dans son Cter jouent un role dans la localisation/stabilite de la proteine

YOyo

PS/ merci pour le lien

[Vinc]

Je croyais que c'etait une coutume dans ton labo

Ca dépend pour qui.... Les statutaires sont au dessus de "La Dure Loie du Labo" .....

ca je suis sur que c'est pour savoir si les lys presentent dans son Cter jouent un role dans la localisation/stabilite de la proteine

Ha comme quoi....... j'étais persuadé que tu étais trop concentré sur ta pizza pour m'écouter mais non......

Et tu en as trouvé beaucoup de ces protéines? chez quels organismes? quel est ce programme?

Il m'a sortit les 1000 premières séquences mais je n'arrive pas encore à voire les autres...
Il a y a pas mal de petits peptides de 2 ou3 acides aminés minimum, évidemment, mais aussi des protéines de plus de 300 AA comme p16, des aquaporines, des sous unités de l'ATP synthase, etc....
Il y a pas mal d'enzymes du métabolismes et au niveau de la répartition tous les organismes sont représentés : beaucoup de bactéries, des plantes, des champignons, des unicellulaires, pluricellulaires, vertébrés homme comprit, .....

Donc voilà, très sympa ce petit algo....

V.

[LXR]

En tout cas, les protéines acides doivent être majoritaires dans la grande famille des protéines lysine free que tu as décelé car la lysine est basique donc les organismes acidophiles tels que ceux vivant dans les sources sulfurées doivent posséder quelques protéines de ce genre ou alors bien enfouir leurs lysines...

Greg

PS : Les lysines ne seraient elles pas les "substrats" de certaines enzymes de popularité croissante....?(Tiens une idée pour la "molécule mystère", mais je viens déjà d'en poster une nouvelle...).