Meilleur technique de séquençage

[rowing91]

Je voulais connaitre les techniques de séquençage:
- la plus rapide
- la plus simple
- la plus utilisé
- la moins chère.
Je voulais savoir si de nouvelle technique de séquençage existé (plus récente de Sanger).

Merci de vos réponses

[escherichia]

la methode utilise pour le sequencage de l'homme est la methode "shotgun" mais elle doit etre completer par d'autre methode comme sanger. cependant aujourd'hui il existe des sequencages automatiques sur ordinateur, je crois que c'est grace a des fluorescences lies au nucleotides. chaque nucleotide possede une couleur. je n'en sais pas plus.

[MaliciaR]

Salut, Rowing,

Regarde du côté du pyroséquençage

Cordialement,

P.S. L'analyse des données se fait par ordinateur, pas le séquençage lui-même, Escherichia

[jmbowie]

Le principe moléculaire, c'est toujours du Sanger je crois bien. Ensuite, le shotgun ou le pyroséquençage, ce sont des stratégies pour séquencer plus rapidement de longs génomes, basés sur des stats qui optimisent le nombre et la taille des fragments à séquencer pour être exhaustif.

[directeurkoa]

je crois que toute les approche de sequençage qui existe sont encore basé sur le principe de sanger.
concernant t'as question si c'est pour réaliser une séquence le plus simple, le plus rapide et le moins cher c'est de l'envoyer à une société qui s'occupe de te séquencer ton produit de PCR.
concernant le pyrosequençage je crois que tu es limité au max à 200 paire de bases et cette technique sert sourtout pour identifié de point de mutation precis sur ta séquence.

[Xany]

ouais enfin le plus rapide, le plus simple, le moins cher ca s'exclut souvent les uns les autres

Après la "nouveauté" c'est le pyroséquençage oui, qui se demarque plutot de la methode de Sanger je trouve (pas les meme molecule, pas les meme mesures...)

Mais bon, ca coute plutot cher ce truc (^^) donc pour le côté le moins cher c'est raté

[gorben]

Salut,

J'avais lu quelque part il y a un moment que des physiciens avaient trouves une methode pour sequencer rapidement (alternative a sanger). Un brin d'ADN etait fixe sur un support immobile alors que le brin complementaire etait fixe sur un support mobile. En faisant bouger le support mobile ils arrivaient a ouvrir la double helice comme une fermeture eclair, et en enregistrant l'energie dispensee par la "dechirure" de chaque bases, ils en deduisaient la sequence... Cela pouvait etre fait avec des morceaux d'ADN plutot gros.

Voila, ca n'a rien a voir avec la question, mais c'etait juste pour souligner que potentiellement il allait bientot y avoir une nouvelle alternative a la methode de sanger.

A+

[rowing91]

En faite je voulais avoir une méthode dans chaque cas, une méthode qui est la moins chère, une autre qui est la plus rapide,....

Donc maintenant on utilise plus que le pyroséquençage. Cela se fait en labo ou dans des sociétés?

merci à tous pour vos réponses

[orthank]

Mise à part la technique de séquençage par la méthode des didésoxynucléotides (méthode de Sanger), on peut distinguer trois autres techniques :
- Pyroséquençage à ultra haut-débit (système automatisé 454 Life Science), adapté au séquençage de novo et au re-séquençage.
- Séquençage par re-synthèse via terminateurs réversibles (système automatisé Illumina), adapté au re-séquençage.
- Séquençage par hybridation/ligation (système automatisé SOLiD), adapté au re-séquençage, à la détection de SNP et à l'étude de l'organisation des génomes.

Pour connaître le principe de ces méthodes de séquençage, les sites (commerciaux) des entreprises qui ont automatisé ces techniques, proposent des animations et des explications très accessibles.
Pour une compréhension plus avancée un grand nombre de reviews abordent ces sujets.

Voilà

[rowing91]

Mise à part la technique de séquençage par la méthode des didésoxynucléotides (méthode de Sanger), on peut distinguer trois autres techniques :
- Pyroséquençage à ultra haut-débit (système automatisé 454 Life Science), adapté au séquençage de novo et au re-séquençage.
- Séquençage par re-synthèse via terminateurs réversibles (système automatisé Illumina), adapté au re-séquençage.
- Séquençage par hybridation/ligation (système automatisé SOLiD), adapté au re-séquençage, à la détection de SNP et à l'étude de l'organisation des génomes.

Pour connaître le principe de ces méthodes de séquençage, les sites (commerciaux) des entreprises qui ont automatisé ces techniques, proposent des animations et des explications très accessibles.
Pour une compréhension plus avancée un grand nombre de reviews abordent ces sujets.

Voilà

oki d'oki je vais voire sur les sites. Merci