Epissage alternatif et codon start

[nicokupo]

Salut a tous

Une question me trotte dans la tête : voila, prenons un gène formé de 11 exons et 10 introns. Ce gène subit un épissage alternatif dans lequel l’intron 1 est conservé. Dans l’intron 1, il y a un codon stop. Dans l’exon 4, on trouve un codon start (et évidemment un dans l’exon 1).
Lors de la synthèse de protéine de ce variant d’épissage, est-ce que le ribosome fait la synthèse protéique de l’exon 1 (codon start) à l’intron 1 (codon stop) puis s’arrête. Ou bien peut-il reprendre la synthèse à partir du codon start de l’exon 4 pour produire une protéine tronquée ?

chuss

[escherichia]

non ce n'est pas possible qu'il commence a l'exon 4, car les ribosomes se lie a une sequence specifique (shine-dalgarno chez les proc et kozack chez les eucaryotes) en amont du 1er ATG et non pas en amont de plusieurs ATG. donc il peut demarrer qu'a partir du 1er ATG.

[jmbowie]

non ce n'est pas possible qu'il commence a l'exon 4, car les ribosomes se lie a une sequence specifique (shine-dalgarno chez les proc et kozack chez les eucaryotes) en amont du 1er ATG et non pas en amont de plusieurs ATG. donc il peut demarrer qu'a partir du 1er ATG.

Oui mais il a été décrit des cas ou le ribosome "saute" non?

[Morphine]

Bonsoir,

je pense que les IRES (internal ribosome entry site) peuvent se situer assez loin en aval du shine-dagarno.
De même, il me semble que ce n'est pas toujours le 1er ATG qui correspond au +1. De mé moire, un prof m'avait dit qu'il existait une protéine dont la traduction commencait a partir du 12eme ATG.
C'a doit être les "sauts" dont parle jmbowie.

PAr contre, je ne pense pas que ces mcanismes impliquent de l'epissage alternatif.

[Yoyo]

non ce n'est pas possible qu'il commence a l'exon 4, car les ribosomes se lie a une sequence specifique (shine-dalgarno chez les proc et kozack chez les eucaryotes) en amont du 1er ATG et non pas en amont de plusieurs ATG. donc il peut demarrer qu'a partir du 1er ATG.

C'est vrai chez les procaryotes mais pas chez les eucaryotes! Chez ces derniers la petite sous-unité du ribosome se lie a l'extremité 5' (la coiffe) puis scanne l'ARNm jusqu'a l'ATG, alors la grande sous-unité se fixe a la petite pour former le ribosome complet. La traduction démarre avec l'ARNt methionine dans le site P du ribosome.

Salut a tous

Une question me trotte dans la tête : voila, prenons un gène formé de 11 exons et 10 introns. Ce gène subit un épissage alternatif dans lequel l’intron 1 est conservé. Dans l’intron 1, il y a un codon stop. Dans l’exon 4, on trouve un codon start (et évidemment un dans l’exon 1).
Lors de la synthèse de protéine de ce variant d’épissage, est-ce que le ribosome fait la synthèse protéique de l’exon 1 (codon start) à l’intron 1 (codon stop) puis s’arrête. Ou bien peut-il reprendre la synthèse à partir du codon start de l’exon 4 pour produire une protéine tronquée ?

chuss

Non il ne le fera pas, mais pas pour les raisons indiquées. Dans le cas que tu donnes le codon stop est considéré comme "precoce", puisqu'il se trouve en 5' d'un jonction exon-exon. Dans ce cas la l'ARNm est dégradé par la voi "NMD" (non sense mediated decay), qui en plus inhibe la traduction.

YOyo

[piwi]

Mots clés pour une petite recherche sur internet:
"leaky scanning" et IRES (internal ribosomic entry site)

Cordialement,
piwi