Système de correction MMR et BER

[Kavey]

Bonjour, j'ai un petit problème pour comprendre le système de correction MRR et BER =S
J'aimerais comprendre pourquoi dans le système MMR doit-on ouvrir l'ADN double brin avec la DNA-Hélicase-II alors que l'endonucléase Mut-H découpe déjà en 5' du G de la séquence GATC? Je ne comprends pas l'intérêt d'ouvrir l'ADN double brin en fait =/
Si quelqu'un pouvait me montrer un schéma ce serait sympa parce-que je n'en trouve pas moi-même

Ensuite j'ai un autre problème dans le système de correction BER, dans lequel je ne comprends pas non plus pourquoi, après que la base étrangère ait été excisée par une DNA N-béta-glycosylase qui nous donne un site AP (apurinique ou apyrimidique) qui voudrait donc dire que la base a été coupée de l'un des brins d'ADN et qu'il y a "un trou" pourquoi on fait agir par la suite une exonucléase 5'-3' en plus? Que coupe-t-elle puisque la base a déjà été coupée... =S

Je vous remercie d'avance pour vos réponses =D
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[Kavey]

Quelqu'un pour m'aider? =S

[MaliciaR]

Salut,
as-tu pensé à consulter des pages explicatives générales ?
Exemple : http://en.wikipedia.org/wiki/DNA_mismatch_repair (MMR) et http://en.wikipedia.org/wiki/Base_excision_repair (BER).

Je les trouve assez clairs et il y a tes réponses

[Kavey]

Merci MaliciaR =D, et oui j'ai essayé de trouver justement mais en tapant "système de correction MMR" ou "BER" sur google je ne trouvais rien... Et je ne savais pas quel article en anglais pouvait traiter de cela =I Mais en tout cas merci je vais y jeter un coup d'oeil =)

[A voir en vidéo sur Futura]

[MaliciaR]

Pas de soucis, si tu as des questions précises, n'hésites pas

[Kavey]

Oui en fait je n'arrive pas à traduire tout l'article sur le système MMR et donc je n'arrive toujours pas à trouver de réponse à ma question sur le système MMR pourrais-tu m'aider à y répondre s'il te plait? =/

[MaliciaR]

J'aimerais comprendre pourquoi dans le système MMR doit-on ouvrir l'ADN double brin avec la DNA-Hélicase-II alors que l'endonucléase Mut-H découpe déjà en 5' du G de la séquence GATC? Je ne comprends pas l'intérêt d'ouvrir l'ADN double brin en fait =/
Si quelqu'un pouvait me montrer un schéma ce serait sympa parce-que je n'en trouve pas moi-même

Comme on a dû te le préciser, MMR est un mécanisme de réparation des mésappariements (mismatch) qui est spécifique à un brin (strand-specific).
Tu conviendras que, pour pouvoir séparer les brins (avant de pouvoir accéder à la base fautive), il faut une hélicase. Si les cours n'ont pas changé depuis quelques années, l'hélicase est toujours l'enzyme qui défait les liaisons entre les deux brins de l'ADN

Tu remarqueras aussi l'histoire de spécificité de brin : MutH ne reconnaît pas n'importe quel G de séquence GATC, mais reconnaît un G méthylé. Après la fin de la réplication, le brin parental l'est, mais pas le brin néosynthétisé. D'où la notion d'état hémiméthylé. Ainsi, le modèle ayant servi pour la fabrication du brin où il y a une faute est marqué et sert donc de référence pour la réparation.

Ce cas d'hémyméthylation n'est trouvé que chez les Gram-négatifs. Je ne sais pas s'il y a un truc bien clair chez les Gram-positifs.

Bon, si je n'ai pas raconté de bêtises (je ne suis plus ces histoires de réparation), tu dois avoir une bonne base pour comprendre comment ça marche.