Bonjour,
Je dois faire un expose pour mon cours de bioinformatique et le sujet est la recherche de sites de restriction.
J aimerais savoir si il est possible de trouver un programme dans lequel on copie une sequence d adn et une ou plusieur enzymes et qu on puisse observer la decoupe de l adn au niveau de la structure primaire eventuellement en 3D ou en video??
Bonjour et bienvenue sur Futura Sciences,
Déjà connais-tu des programmes online permettant de trouver les sites des enzymes de restriction connues sur une séquence donnée? Quelle peut être l'utilité du programme que tu décris, s'il existe (ce qui m'étonnerait beaucoup)?
En revanche, tu peux trouver une bonne vidéo montrant la coupure d'un plasmide par une enzyme de restriction, puis le collage par une DNA ligase des deux extrémités d'un insert dans ce plasmide clivé : http://www.youtube.com/watch?v=aA5fyWJh5S0. Si tu maitrises les logiciels vidéos, tu peux extraire uniquement la coupure par l'enzyme pour ton projet.
J'ai trouvé le programme dans lequel j'entre une sequence et je choisis une enzyme puis je récupère ma sequence avec des espaces aux niveau des sites de restrictions correspondant a l'enzyme choisie.
Mais j'aimerais une façon plus imagée pour mettre dans mon powerpoint, une vidéo serait plus concrete et plus facile a comprendre qu'une suite ttaccgta...
Je vais regarder la video que tu m'a envoyée, je te remercie!
Il y a les sites commerciaux de vente d'enzymes de restriction:
PROMEGA et NEBCUTTER.
pour les sites de coupure de l'adn, tu peux utiliser le programme gratuit Serial Cloner.
