Un code bactérien φ80dlacZΔM15Δ(lacZYA-argF)...

[Biologiste16]

Hello !

Alors là je pige pas grand chose je me demande bien que veulent dire toutes ces lettres et ces chiffres avec des symboles bizarres !!! j'ai trouvé ça dans les caractéristiques d'E.coliDH5α : φ80dlacZΔM15Δ(lacZYA-argF) recA endA hsdR supE

Je peux deviner que 80 représente le diamètre de la souche, vu le symbole à côté.
lacZ veut dire qu'elle a un opéron lactose
recA, enA... il me semble que c'est des gènes cloné mais pas du tout sûre de moi !

Qui peut me le confirmer SVP ^^

[kamor]

Je pencherai plutôt que φ80 désigne un phage phage φ80
LacZΔM15Δ(lacZYA-argF) c'est que l'opéron a du être modifié. Je laisse des personnes plus au fait du codage des mutations expliquées au juste, ça fait longtemps que je me suis pas intéressé à ça.

[mmm91]

Bonsoir,

Si je ne me trompe pas, le "Δ" signifie une délétion dans la séquence d'un gène (c'est une souche mutante) et le "lacZYA" est effectivement l'opéron lactose avec les trois gènes lacZ, lacY et lacA qui se suivent et qui ont un promoteur et un terminateur communs

[Biologiste16]

φ80 ""pour le phage"".
dlacZΔM15Δ(lacZYA-argF) recA endA hsdR supE """"pour la mutation des gènes"""".

En gros il s'agit d'une bactérie mutante, mais ca m'intrigue quand même !!! le M15 et aussi y a un dlacZ...ca signifie quoi tout ca : (

[piwi]

Bonsoir.

La réponse à votre question se trouvait dans la bibliothèque FS ^_^
Voyez ce lien: http://openwetware.org/wiki/E._coli_genotypes#DH5.CE.B1

Vous pouvez en user et en abuser

piwi

[Biologiste16]

Je vais peut être abuser de ta gentillesse Piwi car le lien que tu m'a donné me complique beaucoup plus la vie ! je comprends pas cette histoire de génotype, c'est toujours dans le style des codes; chiffres et symboles, rien n'est claire : (

[piwi]

Tout est pourtant expliqué en haut de la page.
(φ80) = Cell carries the lambdoid prophage φ80. A defective version of this phage carrying lacZM15 deletion (as well as wild-type lacI, lacYA, and flanking sequences) is present in some strains.
lacZΔM15 = partial deletion of the lacZ gene that allows α complementation of the β-galactosidase gene; required for blue/white selection on XGal plates. Deletes the amino portion of lacZ (aa 11-41).
Δ( ) = chromosomal deletion of genes between the listed genes (may include unlisted genes!)
hsdR = For efficient transformation of cloned unmethylated DNA from PCR amplifications
recA1 = For reduced occurrence of unwanted recombination in cloned DNA; cells UV sensitive, deficient in DNA repair
supE = suppression of amber (UAG) stop codons by insertion of glutamine; required for some phage growth
endA1 = For cleaner preparations of DNA and better results in downstream applications due to the elimination of non-specific digestion by Endonuclease I

Je ne vois pas ce qui n'est pas clair. Tout est dit.

piwi

[Biologiste16]

Oh Piwi vraiment désolée, je ne voulais pas te faire un travail en plus, j`avais pas du tout remarqué ce qui était expliqué en haut de la page :/ , en tout cas je te remercie beaucoup c`est claire et net ^^

[piwi]

Pas de souci ^_^
Si vous avez toutes vos infos, alors le but est atteint.

Cordialement,
piwi