Distance génétique

chentouf · 08/08/2012 - 20h49

Bonsoir à tous,
Comment fait-on pour calculer, à l'aide d'un exemple, la distance génétique entre deux gènes dans la cas du tri-hybridisme ?
Merci d'avance.

chentouf · 09/08/2012 - 02h00

Un peu d'aide svp.

toothpick-charlie · 09/08/2012 - 08h09

quelle distance génétique? il y en a une palanquée.

chentouf · 09/08/2012 - 15h13

Celle qu'on voit en terminale S.

Merci d'avance.

**Guillaume69** · 09/08/2012 - 16h22

Salut,

Ce genre d'exercice date un peu pour moi, mais cela revient au même qu'avec deux gènes.

Il s'agit de dénombrer les fréquences de recombinaison entre chaque gène. Pour cela, il faut disposer d'un individu triple hétérozygote (aA ; bB ; cC) et le croiser avec un triple homozygote récessif (aa, bb, cc ; c'est le "test cross") pour révéler les événements de recombinaison dans la descendance.

La seule chose qu'il faut prendre en compte ici, c'est qu'en plus des simples recombinants y a des doubles recombinants, ( [aBc] et [AbC] )qu'il ne faut pas oublier de comptabiliser lors de ton calcul de distance.
La distance entre le gène a et b, par exemple sera donc la sommes des fréquences de [aBC] + [Abc] + [AbC]/2 + [aBc]/2

Que quelqu'un me corrige si je me suis planté

chentouf · 09/08/2012 - 17h51

Bonjour Guillaume :
Le problème est un peu plus compliqué que ça :

Le problème se trouve à la page 18 / 19 du pdf suivant :

Le seul inconvénient, c'est qu'il est en arabe ... mais, c'est facile à comprendre, car, c'est écrit en langage mathématique, en plus, il y'a des images illustratives, et quelques termes traduit en français.

Merci d'avance.

**Guillaume69** · 09/08/2012 - 18h54

De loin, pourtant, il me semble que c'est ce que je viens de dire ... Sauf que tes allèles ne s'appelles pas abc et ABC.

Dans le détail par contre, comme c'est en arabe, je ne peux pas t'aider plus.

chentouf · 14/08/2012 - 20h40

Re - Bonjour,

Voici le problème :
Deux générations de races pures ont été croisées. La première (SM) à feuilles vertes, à taille normale et à fruits "lisses". L'autre, notée (M) est à feuilles tachetées, à taille petite et à fruits "doux".

On obtient une génération F1 homogène à feuilles vertes, à taille normale et à fruits "lisses". Les individus de la génération hybride/hétérozygote F1 sont croisés avec une plante de la génération (M).
Voici les résultats:
417 : plantes à feuilles vertes, à taille normale et à fruits lisses.
425 : plantes à feuilles tachetées, à petite taille et à fruits doux.
16 : plantes à feuilles vertes, à taille normale et à fruits doux.
3 : plantes à feuilles vertes, à à petite taille et à fruits lisses.
55 : plantes à feuilles vertes, à petite taille et à fruits doux.
59 : plantes à feuilles tachetées, à taille normale et à fruits lisses.
5 : plantes à feuilles tachetées, à taille normale et à fruits doux.
20 : plantes à feuilles tachetées, à petite taille et à fruits lisses.

1. Que pouvez-vous déduire de l'analyse du premier croisement?
2. En utilisant les notations suivantes : $(N,n)$ : taille normale $(V,v)$ : feuilles vertes $( L,l )$ : fruits lisses $( C,c )$ : taille petite $(T,t )$ : feuilles tachetés $( R,r)$ : fruits lisses. exprimer les phénotypes de la génération F2 en calculant le pourcentage que constitue chacun de ces phénotypes.
3. Que déduit - on des résultats du rétro-croisement ? Comment expliquer l'apparition des nouveaux phénotypes chez les tomates?
4. Calculer les distances entre les gènes étudiés ?
5. Effectuer la carte factorielle entre les trois gènes.

============================== ==================

Ce qui m’intéresse dans cette exercice, ce sont les questions 2. et 4. :
Voici les réponses :
2. Les phénotypes résultants de la deuxième générations $F2$ :
- Phénotypes parentales $84,2 %$ :
$[V,N,L]$ : $100 \times \frac{417}{1000} = 41,7 %$
$[t,c,r]$ : $100 \times \frac{425}{1000} = 42, 5%$
- Apparition de nouveaux phénotypes chez les tomates : $15,8 %$
$[V,N,r]$ : $100 \times \frac{16}{1000} = 42, 5%$
$[ V,c, L ]$ : $100 \times \frac{3}{1000} = 42, 5%$
$[V,,c,r]$ : $100 \times \frac{55}{1000} = 42, 5%$
$[t,N,L]$ : $100 \times \frac{59}{1000} = 42, 5%$
$[t,N,r]$ : $100 \times \frac{5}{1000} = 42, 5%$
$[t,c,L]$ : $100 \times \frac{20}{1000} = 42, 5%$
4. Calcul des distances entre gènes :
La distance entre la taille et la couleur des feuilles :
$d ( V - N ) = \frac{5+59+55+3}{1000} \times 100 = 12,2 cMg$
La distance entre la taille et la forme des fruits :
$d ( N-L) = \frac{16+3+5+20}{1000} \times 100 = 4,4 cMg$
La distance entre la couleur des feuilles et la forme des fruits :
$d ( V-L ) = \frac{16+25+59+20}{1000} \times 100 = 15 cMg$

============================== =========

Ma question est :
Comment ont - ils fait pour calculer : $d ( V-N )$ , $d ( N - L )$ et $d ( V- L )$ ... Je ne comprends pas quelle règle ont suivi pour trouver ces résultats.
Par définition : la distance entre deux gènes $a$ et $b$ est la quantité :
$d ( a-b ) = \frac{ \mathrm{le \ nombre \ d \ individus \ ayant \ de \ nouveaux \ phenotypes} }{\mathrm{Nombre \ globale \ des \ individus}} \times 100$

Merci d'avance.

chentouf · 15/08/2012 - 18h54

Un peu d'aide svp.

**Yoyo** · 15/08/2012 - 21h29

salut

tu sais on ne va pas faire ton exercice à ta place. Alors je dirait aide toi toi même en nous donnant déjà les bases de ton raisonnement (même si c'est faux c'est pas grave), on corrigera et t'aidera à avancer.

YOyo

chentouf · 15/08/2012 - 21h38

Je ne vous demande pas que vous faites mon exo à ma place ... Le corrigé, je l'ai dèjà sur mon bouquin ... cela montre que tu n'a même pas lu une seule phrase de ce que j'ai écrit et où se situe le problème ...

**Yoyo** · 15/08/2012 - 21h48

en effet, j'ai lu trop vite ton message, tellement habitué aux demandes d'aide!

###je regarde de plus pret l'exercice###
YOyo

**Yoyo** · 15/08/2012 - 22h00

Bon il me semble bien y avoir un problème dans ta correction.
Déjà tout est à 42,5% ce qui est faux (réponse 2).
Ensuite ta formule pour calculer la distance est bonne et correspond bien à celle (plus détaillée donnée par Guillaume69).
Les calculs de la solution sont faux eux aussi, car leur regroupement d'individus n'a aucun sens logique.
Elle sort d'ou cette correction?

YOyo

chentouf · 15/08/2012 - 22h08

Je sais qu'il y'a des erreurs de calcul dans ce que j'ai érit, mais, ce n'est pas le calcul qui m’intéresse, mais la logique suivie dans ce calcul ... Je n'arrive pas encore à faire la différence entre ce qui est écrit comme réponse et les justifications de Guillaume ... C'est moi qui a mal recopié les chiffres parce que Latex m'épuise un peu ... Les bonnes chiffres se trouvent dans le pdf que j'ai mis à votre portée sur ce topic ( rédigé en arabe ).
Merci d'avance.

chentouf · 16/08/2012 - 00h38

Par exemple, pour calculer $d ( V - N )$ , pourquoi on choisit simplement d'additionner les proportions des phénotypes suivants : $[V,c,L]$ , $[V,c,r]$ , $[t,N,L]$ et $[t,N,r]$ , et on laisse tomber les proportions des phénotypes : $[V,N,r]$ et $[t,c,L]$ ?
Merci d'avance.