MS/MS et Maldi/MS
Bonjour,
C'est quoi la différence entre un MS/MS et Maldi/MS?
Si j'ai donnée mon gel sds-page à analyser qu'ils l'on a digéré avec la trypsine pour générer des peptides et qu'ils l'on ensuite analyser par spectro de masse pour comparer à une base de données quelles méthodes ils ont fait?
Merci!!!
Le Maldi est une technique d'ionisation de ton échantillon. Une autre méthode couramment utilisée en bio est l'ESI.
Une fois ionisé, les produits sont analysés dans le spectrometre de masse (MS).
On cherche parfois a obtenir des infos supplémentaires en utilisant un tandem de spectro de masse (MS/MS): Apres ionisation, les produits sont analysés dans le premier MS, puis refragmentés, et les fragments sont analysés dans le second MS.
Re : MS/MS et Maldi/MS
Merci!
Pourquoi les échantillons sont réduits et alkylés avant le test?
La réduction des ponts disulfure facilite l’étape de digestion enzymatique de la protéine: Le squelette peptidique est plus accessible.
L'alkylation des Cys permet d'éviter qu'elles reforment des pont S-S + limite les risques d'alkylation des Cys par des monomères d'acrylamide dans les gels PAGE
Ok Merci c'est déjà plus clair
Si ma bande a été coupé d'un gel Coomassie (SDS-PAGE) ces étapes de réductions et alkylation ont déjà été réalisé avec les produits dénaturants du SDS-PAGE?
(Comme il y a du b-mercaptoéthanol et que tu me dis que l'alkylation est aussi faite pour éviter l'interférence avec les monomères du gel d'acrylamide).
nb: Je ne vois pas quel genre de produit est mis pour réaliser une alkylation?
Merci!!!
