Digestion avant MS

[mailaure]

Bonjour,

Pourquoi avant de faire une analyse par LC-ESI-MS/MS, il faut digérer les protéines en peptides?

On ne peut pas analyser les protéines directement?

Bien à vous,


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[berzelius]

Bonsoir!

Si c'est possible mais c'est pas la même façon de réfléchir son expérience, et on ne cherche pas la même chose.

ce site permet de comprendre comment cela fonctionne et les différences.

après il y a aussi des contraintes techniques: est ce que la protéine s'ionise bien en ESI, est ce qu'on dépasse pas la gamme de masse accessible...

cela dépend du matériel et de ce que l'on cherche.

typiquement, on va faire un préséparation, une digestion, une séparation, l'injection en MS, puis analyse MS/MS pour avoir la séquence, la position modification post trad et sa séquence (s'il y en a une)