Bonjour,
Les groupements amine et carboxyle dans un acide aminée sont sous leur forme ionisé(H3+N et COO-) dans une cellule à cause du pH d'environ 7. Ce que je ne comprends pas c'est de quelle façon les liaisons peptidique ont-elles lieu dans une cellule si les extrémités sont ionisés? Et quand elles ont lieu, les extrémités vont-elles être ionisés aussi?
Merci d'avance!
Bonjour,
Pourquoi est-ce que tu penses que l'ionisation gène la formation de la liaison ?
Les extrémités N-terminale et C-terminale d'une protéine sont ionisées oui.
À trop se fier à son sixième sens, on finit par ne se fier à rien.
Par exemple, si 2 acides aminés se rencontre pour former un dipeptide, il doit y avoir une réaction de condensation. Je ne comprend par quel processus l'eau sera formé si l'extrémité est un oxygène ayant une charge négative de -1...
Par logique, l'extrémité amine devra donné un atome d'hydrogène à l'extrémité carboxyle ionisé n'Est-ce pas?
Bonjour,
Dans une cellule, la formation d'une liaison peptidique est toujours catalysée par une enzyme (sauf cas particuliers).
Dans le cas classique de la formation d'un peptide lors de la traduction d'un ARNm par le ribosome, l'acide carboxylique est sous la forme d'un ester activé formé avec l'ARNt. C'est ce qui permet la réaction. En image, cela donne cela http://biowiki.ucdavis.edu/@api/deki...gif?revision=1
Effectivement. deux acides aminés dans l'eau, a température ambiante, ne réagissent pas ensemble pour former une liaison peptidique
NB: Ne pas oublier également que les pKa des tables sont mesurés dans l'eau. Le site actif d'une enzyme est tout sauf un environnement aqueux classique.
Dernière modification par vpharmaco ; 07/09/2014 à 22h17.
ok c'est bon merci pour l'explication!
