Bonjour, je dois donner la taille des séquences (pb) qui seront amplifiées par PCR pour chacune des associations possibles des amorces utilisées :
Amorces 1-2
Amorces 1-3
Amorces 1-4
...
Je vous ai joint la séquence en pièce jointe.
Je ne comprends pas à partir d'où il faut commencer à compter, par exemple pour l'amorce 1-2 je compte les nucléotides entre les 2 amorces ou je prends aussi en compte les nucléotides des amorces 1 et 2 ?
Merci
Les amorces sont incorporées dans l'amplicon. Le produit de PCR à la taille comprise entre le 5' de l'amorce forward et le 3' de l'amorce reverse
La vie trouve toujours un chemin
Ok merci
Pour la taille de l'amplifiât pour l'amorces 2-3 c'est 21 ou 0 ?
Pour l'amorces 1-4, comme l'amorce 4 est anti-sens, je dois pas compter jusqu'au bout (c) mais m'arrêter au début, c'est bien ça ?
ca n'a pas trop de sens, les amorces vont s'hybrider et il n'y aura pas d'amplification.Pour la taille de l'amplifiât pour l'amorces 2-3 c'est 21 ou 0 ?
non, l'amorce antisens est inclusePour l'amorces 1-4, comme l'amorce 4 est anti-sens, je dois pas compter jusqu'au bout (c) mais m'arrêter au début, c'est bien ça ?
par contre 1-2, vu que les deux amorces sont sur le même brin, il n'y aura aucune amplification
pareil pour 3-4 par exemple.
La vie trouve toujours un chemin
Les amorces sont sur le même brin ? Je suis pas sur d'avoir compris
La taille de l'amplifiat pour les amorces 1-2 et 1-3 est alors le même ?
deux amorces sens (ou antisens) sont sur le même brin. Pour que la PCR fonctionne il faut que les amorces soient chacune complémentaire d'un des brins.
Regardez cette animation : si les deux amorces sont choisies sur le même brin et donc s'hybrident du même coté, il n'y a pas d'ammplification
La vie trouve toujours un chemin
