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08/07/2006 - 23h55 Gecko38 Composition d'une cellule souche
Salut à tous !!
Quelqu'un pourrait t'il me donner des renseignements sur la composition détaillée de cette formule : DH5a-MCR ? S'agit t'il bien d'une cellule souche ? Je ne parviens pas à avoir d'infos dessus. Merci d'avance !
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09/07/2006 - 08h12 Toll
Re : Composition d'une cellule souche
bonjour,
ce nom précis ne me dit rien par contre la souche DH5a m'est familière et l'est sans doute pour qui utilise des bactéries électrocompétentes.
la souche bactérienne DH5a (a pour alpha) est très connue et très couramment utilisée en biomol.
le même nom n'étant généralement pas donné à des organismes très différentes, je ne pense pas que le terme DH5A-MRC qualifie une cellule souche (implicitement eucaryote).
sur pubmed et l'ATCC, il n'en est pas fait mention en tout cas.
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09/07/2006 - 10h12 Gecko38 Re : Composition d'une cellule souche
Salut !
Donc ce serait une souche d'origine bactérienne DH5a. Peux-tu me donner la signification des autres lettres ? ça m'intéresse. En tous cas, merci de m'avoir déjà éclairé là-dessus.
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09/07/2006 - 16h48 Toll
Re : Composition d'une cellule souche
bonjour,
effectivement, la souche DH5 alpha est une souche Escherichia Coli (orthographe à vérifier pour Escherichia).
par contre, en cherchant rapidement je ne trouve rien concernant les lettres MRC, désolé.
si un bactério ou un pro de la BM pouvait prendre le relai!
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09/07/2006 - 17h51 Gecko38 Re : Composition d'une cellule souche
OK, c'est donc une cellule souche de Escherichia coli. La lettre a correspond à Alpha. Mais que signifient les autres lettres ? D et H ? et le 5 correspond à quoi ?
Merci pour tes réponses -
10/07/2006 - 03h23 Toll
Re : Composition d'une cellule souche
Bonjour,
j'essaie de me renseigner pour la signification exacte du nom. Bon pas tout de suite.... je me remet doucement du match (voleurs!!! stop pas le bon forum!! )
par contre, je n'aime pas trop l'emploi de "cellule souche" pour parler d'une souche bactérienne.
le terme cellule souche est plutot utilisé pour les parler de cellules souches embryonnaires ou cellules ES (Embryonic Stems cells); choses qui n'ont rien à voir.
et d'après les restent de bactério qui me restent (resteraient?), on parle de souches bactériennes mais jamais de cellules souches pour traiter des bactéries.
bon, je te/vous tiens au courant pour l'explication DH5a (si je trouve of course)
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10/07/2006 - 11h25 Gecko38 -
10/07/2006 - 12h17
Re : Composition d'une cellule souche
Une rapide recherche avec DH5 -MCR sur le web dit que c'est une souche d'E coli dérivée de DH5 .
Jean-Luc
La violence est le dernier refuge de l'incompétence.
Salvor Hardin -
10/07/2006 - 12h41 piwi
Re : Composition d'une cellule souche
C'est une souche de coli déficiante pour le système de méthylation/restriction MCR.
Pour ce que veut dire exactement MCR: methyl-coenzyme M reductase. Il est formé de plusieurs sous unités
L'interet d'une telle souche est de permettre d'inserer des fragments d'ADN sans se soucier de la méthylation. On peut donc insérer des framgents d'origine divserses sans qu'ils ne soient dégrader.
Cordialement,
piwi
Dernière modification par piwi ; 10/07/2006 à 12h44.
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10/07/2006 - 12h50
Re : Composition d'une cellule souche
 Envoyé par piwi C'est une souche de coli déficiente pour le système de méthylation/restriction MCR.
Pour ce que veut dire exactement MCR: methyl-coenzyme M reductase. Il est formé de plusieurs sous unités
L'interet d'une telle souche est de permettre d'inserer des fragments d'ADN sans se soucier de la méthylation. On peut donc insérer des framgents d'origine divserses sans qu'ils ne soient dégradés.
dégradés ?
Perso j'utilise ce genre de souche quand j'ai un site de restriction sensible à la méthylation, comme XbaI dans certains contextes pour les dam méthgylases.
Jean-Luc
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Salvor Hardin -
10/07/2006 - 12h57 piwi
Re : Composition d'une cellule souche
je me suis planté !
Ca n'est pas le bon MCR dont je donnais l'acronyme. Celui dont il est question ici est modified cytosine restriction system.
Toutes mes excuses!
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10/07/2006 - 12h58 Gecko38 -
10/07/2006 - 13h02 Gecko38 Re : Composition d'une cellule souche
 Envoyé par piwi je me suis planté !
Ca n'est pas le bon MCR dont je donnais l'acronyme. Celui dont il est question ici est modified cytosine restriction system.
Toutes mes excuses! Pas grave
Je vais me pencher là-dessus alors -
10/07/2006 - 13h04 piwi
Re : Composition d'une cellule souche
Elle est aussi utilisée quand l'ADN à integrer est deja méthylé et qu'il risque d'être dégradé par la bactérie (fragments de virus). Enfin c'est ce que j'ai vu dans les abstracts de plusieurs publis en essayant de chercher la signification exacte de MCR.
Maintenant, si l'on veut, on peut généraliser en disant qu'elle est utile quand la méthylation peut poser un problème pour atteindre l'objectif que l'on s'est fixé.
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11/07/2006 - 17h38 Gecko38 Re : Composition d'une cellule souche
Salut !
La question que je suis en train de me poser, c'est : Quel inconvénient/avantage la méthylation apporte à l'ADN ? Quand je cherche dans un livre, ils expliquent platement : Addition d'un groupement méthyle. Ok, mais ça n'explique pas concrètement ce que ça donne.
Quelqu'un pourrait t'il m'éclairer aussi sur ce point ? -
11/07/2006 - 17h49 Yoyo
Re : Composition d'une cellule souche
C'est un systeme de protection contre l'ADN exogene (comme les phages par expl). Cet ADN ne possede pas le meme pattern de methylation que celui de la bacterie donc le systeme de restriction de la bacterie doit pouvoir fragment l'ADN avant que celui ci ne s'exprime.
Yoyo
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11/07/2006 - 18h05 Gecko38 -
11/07/2006 - 20h47 Yoyo
Re : Composition d'une cellule souche
Chez les bacteries il n'y pas de noyeau, et la methylation concerne l'ADN par l'ARNm
Yoyo
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11/07/2006 - 21h18 Gecko38 Re : Composition d'une cellule souche
oups ! Non, en fait, le sujet de cette discussion ( à l'origine ) c'était la composition détaillée de DH5a-MCR. ( qui serait donc une souche de E. coli )
En fait, j'ai légèrement dérivé en demandant les conséquences de la méthylation de l'ADN. Mais, dans mon esprit, j'étais partis sur une cellule animale, pas bactérienne.
Donc, en réalité, ma question concernait les cellules humaines. Pour résumer, si j'ai bien compris, la méthylation serait donc la réprimation de l'expression des gènes post-transcription ? ça veut dire que dans tous les cas, ces gènes portant sur eux la marque de méthylation ne seront jamais transcrits ? Est-ce bien ça ? -
12/07/2006 - 10h10
Re : Composition d'une cellule souche
 Envoyé par Gecko38 Donc, en réalité, ma question concernait les cellules humaines. Pour résumer, si j'ai bien compris, la méthylation serait donc la réprimation de l'expression des gènes post-transcription ? ça veut dire que dans tous les cas, ces gènes portant sur eux la marque de méthylation ne seront jamais transcrits ? Est-ce bien ça ?  La méthylation des promoteurs est impliquée dans une répression (!) de la transcription qui se veut définitive dans un organisme donné (sauf gamétogénèse). C'est un processus important dans la différenciation cellulaire.
Par exemple les gènes qui ne sont utiles qu'au moment du développement embryonnaire sont mis sous silence et ne s'exprimeront pas chez l'adulte. Mais on ne parle pas forcément post-transcription, c'est un phénomène qui se produit lors de la différenciation vers un type cellualire, une sorte de mémoire.
Après il est fort possible qu'il y ait de nombreux contre exemples.
Jean-Luc
La violence est le dernier refuge de l'incompétence.
Salvor Hardin -
12/07/2006 - 19h43 Gecko38
Re : Composition d'une cellule souche
Ok, Merci de m'avoir expliqué, c'est déjà beaucoup plus clair qu'au début | | |