Analyse expression différentielle

[makomoko]

Bonjour à tous,

Je sollicite votre aide pour des analyses de séquençages Illumina (étude d'expression différentielle).

En effet, j'ai réalisé le traitement bioinformation des données brutes de séquençages (fiche de comptages, mapping etc réalisés). Je souhaite désormais réaliser le traitement statistique des résultats sous R afin de notamment identifier les gènes exprimés différemment entre les différents conditions, réaliser des diagramme de Venn pour identifier les similarités etc ?

Malgré des recherche en fin, je sollicite en dernier recours la communauté du forum.

AU plaisir de vous lire,

Makram.
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[MissJenny]

bonjour,

tu as vu ça ? https://www.bioconductor.org/package...naseqGene.html

c'est assez complet. Maintenant si tu n'y connais rien tu vas galérer.

[makomoko]

Salut,

Merci de ta réponse. Ce qui me pose soucis, c'est plus l'analyse des résultats avec R je pense qu'en consultant les forums et en s'armant de patiente ça devrait le faire !

Effectivement comme je n'y connais rien c'est la galère