choix des 2 amorces sens et antisens

[Yaneza]

Bonjour j'ai un exo sur la biologie moléculaire de L2.
On me demande de choisir 2 amorces sens et antisens de 20 nucléotides parmi celles que l'on me propose, on m'a donné un fragment du gène et la région a amplifier qui va de 277 à 522. J'ai trouvé les amorces mais pour l'amorce Antisens on me dit que c'est faux et je n'ai pas compris pourquoi. voici l'exercice et mes réponses.

J'ai choisie l'amorce 1 en content a partir de 277 les 20 nucléotides et j'ai appliqué la RCB pour trouver l'amorce 2 antisens donc j'ai choisie les réponse A et C mais on me dit que la bonne réponse c'est A et D je ne comprend pas pourquoi l'amorce D.
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[Flyingbike]

Je ne vois pas de quoi l'amorce C est complémentaire sur votre matrice. Avez vous remarqué qu'elle est donnée dans le sens 3' 5' ?

Par contre, le reverse complément de l'amorce D est

caaagactgtcacaagggcc qui se retrouve bien dans votre séquence.

[Yaneza]

pouvez vous m'expliquer s'il vous plait? je ne comprend pas comment trouver l'amorce

[Flyingbike]

pour amplifier une séquence d'ADN, il faut deux amorces. L'une sera complémentaire du brin matrice, et l'autre sera complémentaire de l'autre (ou inversement).
Si les amorces ne sont pas dans le bon sens ou si elle ne sont pas chacune sur un brin, l'amplification ne peut pas fonctionner.


Si vous avez une première amorce dont la séquence est dans le brin matrice (celui de l'énoncé), c'est donc une amorce qui s'hybridera avec l'autre brin (celui qui est complémentaire de celui de l'énoncé).

La seconde amorce doit être donc dans l'autre sens, donc en opposition et en complément du brin de l'énoncé.

Voyez cette image peut être plus parlante :

[A voir en vidéo sur Futura]

[Yaneza]

je comprend mon erreur en fait je lisais pour les deux amorces toujours dans le meme sens, or l'amorce 2 doit être dans le sens opposé, je me sens bête maintenant que j'ai compris mon erreur �� merci beaucoup pour votre aide.

[Flyingbike]

Avec plaisir, à bientôt