Question à propos du logiciel de statistique R

[invite425296bf]

Bonjour,

J’effectue ce stage au sein d’une entreprise spécialisée dans la sélection d’animaux d’élevage. Dans le cadre de cette activité des mesures sont faites par
ultrasons sur des animaux vivants à l’élevage tandis que ces même mesures sont ensuite effectuées avec une règle à l’abattoir, sur les carcasses de ces
mêmes animaux.
Ma mission est de vérifier que les mesures faites par ultrasons reflètent bien celle faites à l’abattoir.
J’ai d’abord eu recours à un test de comparaisons des moyennes pour vérifier l’égalité des résultats obtenus.
Ces 2 façons de mesurer étant différentes, je cherche donc maintenant à trouver un modèle qui comprend les facteurs qui influencent de façon significative ces mesures.

Vous trouverez en pièce jointe, le jeu de données sur lequel je travaille actuellement.
Les différentes mesures effectuées par ultrasons sont les suivantes : US_FD, US_LD et US_ IMF
Celles faites à l’abattoir sont : FD, LD et IMF
Quant aux facteurs pris en compte pour l’établissement de ce modèle, ce sont : Sire (la mère du porcelet), Dam (le père), Sex (le genre du porcelet), Date (à laquelle les mesures sont effectuées), Room (salle de provenance du porc) et Pen (sa case dans a salle).
Pour identifier ces facteurs, j’ai d’abord utilisé la fonction anova() du logiciel R avec la commande suivante :

anova (lm(formula = US_FD ~ Sire + Dam + Sex + Date + Room + Pen + Sex:Date + Sex:Room + Sex:Date:Room, data = Dataset)) # random is ~Sire

Cependant, l’utilisation de cette fonction s’est vite montrée limitée quant à la détermination d’un modèle.
J’ai donc maintenant recours à la fonction aov.sum du package agrocampus avec la commande suivante :

aov.sum(formula = IMF ~Sire + Dam + Sex + Room + Pen + Date + Sex:Room + Sex:Date + Sex:Room:Date, data=Dataset) # Random is ~Sire

Le problème étant que lorsque je souhaite lancer cette fonction, le message d’erreur suivant apparaît « there are aliased coefficients in the model ».
Ma question étant la suivante : d’où vient ce message d’erreur ? que signifie-t-il ?
Que puis-je faire pour y remédier ?

En vous remerciant d’avance pour votre réponse,

Pierre ADAM.
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[Dlzlogic]

Bonjour,
Je ne connais pas les possibilités de R.
Par contre, j'ai un outil qui permet de créer un modèle avec de nombreux paramètres, jusqu'à 16.
Quand je regarde votre fichier les champs non numériques me paraissent pas très normal.
D'autre part, pour un modèle, il me semble qu'il faudrait avoir quelque-chose de la forme y=f(x1,x2,x3, ... ,xn).
Autrement dit, il faudrait préciser quel est le y.

[invite425296bf]

En gros, je souhaite étudier l'influence de variables qualitatives (Sex, Pen, Room, Date, Dam et Sire) sur les variables qualitatives que sont US_FD, US_LD, US_IMF, FD, LD et IMF.
Le y serait donc, si j'ai bien compris, une de ces variables quantitatives.

Merci,

Pierre

[Dlzlogic]

Donc, les valeurs HCW et CCW ne sont pas concernées.
Oui, Y peut être tout ce qu'on veut, mais il faut choisir.
Si les valeurs FD, LS et IMF sont indépendantes, chacune peut fait l'objet du résultat du modèle.
Toute la question est de savoir ce que vous voulez évaluer. Ca peut être la différentielle de FD, puis de LD, puis de IMF. ça peut-être la valeur de FD tous les US en paramètre, ou tout ce qu'on veut.

[A voir en vidéo sur Futura]

[toothpick-charlie]

plutôt que
Sex + Date + Room + Pen + Sex : Date + Sex : Room + Sex : Date : Room
tu peux écrire juste
Sex*Date*Room - Date : Room
mais bon, les intéractions d'ordre 3, on ne sait pas bien les interpréter.