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Articles importants dans Nature, Science ou Cell

  1. #31
    tortuga

    Re : Plos

    Citation Envoyé par toutouchka
    salut
    je trouve cette idée de forum excellente! par contre je trouve dommage de se cantonner aux publis des trois géants nature science et cell.
    mais heu, même pas vrai-heu moi j'ai proposé PNAS (qui est à mon avis vraiment classe), J bact et ne pas oublier tous les journaux ASM, qui sont d'une très grande qualité !

    a+
    t.

    -----


  2. Publicité
  3. #32
    Yoyo

    Re : Plos

    Bonsoir

    Vous etes bienvenue pour poster des liens vers les resumés des articles qui vous semblent importants. Maintenant je m'etait limité qu'aux plus grandes revues car les articles sont plus généraux et peuvent donc interesser plus de monde.

    J'aimerai rappeler que ce fil n'a pas pour objectif de discuter des articles eux meme, mais de faire circuler l'information
    Si ensuite vous souhaitez discuter d'un article cela est facile d'ouvrir une nouvelle discussion avec le "multiquote"

    Merci
    Yoyo

  4. #33
    gab

    Re : Plos

    Salut!
    je relance un peu ce fil avec une actu (c'est relatif (aout)) très très très très très très très très CHAUDE!!!

    Transgeneration memory of stress in plants
    Jean Molinier, Gerhard Ries, Cyril Zipfel, Barbara Hohn
    Nature 442, 1046 - 1049 (31 Aug 2006) Letters to Editor

    Qui tenterai à prouver que l'on a enterré Lamarck un peu vite... Lisez et régissez braves gens... Amen

  5. #34
    gab

    Re : Plos

    Voici l'abstract ... jue voudrai bien vous mettre le pdf mais je me jetter à chaque fois....

    Transgeneration memory of stress in plants
    Jean Molinier1,2, Gerhard Ries1,2, Cyril Zipfel1,2 and Barbara Hohn1

    Top of pageAbstractOwing to their sessile nature, plants are constantly exposed to a multitude of environmental stresses to which they react with a battery of responses. The result is plant tolerance to conditions such as excessive or inadequate light, water, salt and temperature, and resistance to pathogens. Not only is plant physiology known to change under abiotic or biotic stress, but changes in the genome have also been identified1,2,3,4,5. However, it was not determined whether plants from successive generations of the original, stressed plants inherited the capacity for genomic change. Here we show that in Arabidopsis thaliana plants treated with short-wavelength radiation (ultraviolet-C) or flagellin (an elicitor of plant defences6), somatic homologous recombination of a transgenic reporter is increased in the treated population and these increased levels of homologous recombination persist in the subsequent, untreated generations. The epigenetic trait of enhanced homologous recombination could be transmitted through both the maternal and the paternal crossing partner, and proved to be dominant. The increase of the hyper-recombination state in generations subsequent to the treated generation was independent of the presence of the transgenic allele (the recombination substrate under consideration) in the treated plant. We conclude that environmental factors lead to increased genomic flexibility even in successive, untreated generations, and may increase the potential for adaptation.

  6. #35
    gab

    Re : Plos

    ça vous excite pas trop les plsntes ... mais c'est l'avenir!

  7. #36
    gab

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    -salut gab,
    -salut!
    -comment vas tu?
    -pas mal et toi
    -ça va, sauf que j'ai vraiment l'impression de faire vivre ce FIL tout seul.
    -A bon?
    -OUI, mais bon je continue parce que je pense que c'est un des meilleur FIL de ce forum... alors voila.
    -Je comprends. T'as une info donc si t'es entrain d'écrire là.
    - Oui la voilà:

    Punctuational evolution has been a contentious idea, but recently, it has become possible to detect signals of punctuational and gradual evolution on molecular phylogenetic trees. Pagel et al. (p. 119) show that bursts of evolution associated with speciation across a wide range of organisms account for approximately 20% of the nucleotide substitutions in published gene-sequence alignments, the remainder being attributable to more gradual forces of evolution. These "punctuational" effects are more frequent in plants and fungi, compared with animals, presumably because of their higher rates of polyploidy and hybridization.

    Large Punctuational Contribution of Speciation to Evolutionary Divergence at the Molecular Level
    Mark Pagel,* Chris Venditti, Andrew Meade
    A long-standing debate in evolutionary biology concerns whether species diverge gradually through time or by punctuational episodes at the time of speciation. We found that approximately 22% of substitutional changes at the DNA level can be attributed to punctuational evolution, and the remainder accumulates from background gradual divergence. Punctuational effects occur at more than twice the rate in plants and fungi than in animals, but the proportion of total divergence attributable to punctuational change does not vary among these groups. Punctuational changes cause departures from a clock-like tempo of evolution, suggesting that they should be accounted for in deriving dates from phylogenies. Punctuational episodes of evolution may play a larger role in promoting evolutionary divergence than has previously been appreciated.

    School of Biological Sciences, University of Reading, Whiteknights, Reading RG6 6AJ, UK.

    Sans pdf evidement!

  8. #37
    Vinc

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Salut!
    Bon moi c'est un truc un peu particulier que je vous propose car ce n'est pas un article (et par conséquent peut-être que ce n'est pas le bon fil...)! En tout cas ce que vous allez voir (en cliquant sur le lien plus bas ) est vraiment exceptionnel, perso je trouve ça beau, point final (et avec le son on pourrait presque pleurer ):

    http://aimediaserver.com/studiodaily...640&height=520

    Vinc

    EDIT: précisons bien sûr qu'absolument tout dans ce film a une réalité biologique....
    Primum non nocere.

  9. #38
    gab

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Le problème c'est que le cytplasme parait bien vide dans cette vidéo!!! alors que la molarité (pas moralité) y est démentielle!!! alors ...

  10. #39
    Vinc

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Et alors??? La molarité ets essentiellement due aux ions dissous... Tu ne veux quand même pas qu'on te représente les Na+ et les Cl-
    C'est la même chose pour les protéines : on en vois pas beaucoup sous forme soluble dans le film. Mais ça n'empêche que je trouve que c'est une vue particulièrement réaliste, surtout pour tout ce qui concerne l'actine, les MT, les kinésines/dynéines et le transport vésiculaire....

    Et puis le cytoplasme est plus une sorte de gel qu'un milieu liquide, or si tu représentes vraiment ce qu'il y a de dans, c'est impossible d'en faire un film car c'est beaucoup trop dense....

    Vinc
    Primum non nocere.

  11. #40
    Djelaba

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Un immense Merci à toi Vinc pour ce lien exceptionnel !
    Magnifique, j'suis sous le charme. C'est beau la vie et en effet on pourrait presque pleurer.

    Je suis bluffé, bouche bée.
    Je crois que pour le bien du dynanisme scénaristique, ils ont toutefois pris quelques libertés par rapport à la réalité, mais ce n'est pas gênant outre-mesure et surtout ça rend le film encore plus accrocheur. ^^

    Si tu as d'autres bijoux comme ça, je suis preneur.

    Gab, imagine que c'est un schéma en 3D, ca te rendra plus indulgent

  12. #41
    Prolagus

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Un génome d'à peine 160 Kb :
    http://www.nature.com/news/2006/0610...061009-10.html

    De l'eau au moulin du modèle endosymbiotique du vivant
    Péteux de caillasse en exil.

  13. #42
    Vinc

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Conetent que ça te plaise !
    Citation Envoyé par Djelaba Voir le message
    Si tu as d'autres bijoux comme ça, je suis preneur.
    Oui j'ai pas mal d'autres film un peu dans le même style mais moins bien fait et moins longs mais interessant quand même, nottament sur la motilité cellulaire et j'en ai un pas mal sur les MAP-Kinases aussi! Contacte moi par MP si ça t'intéresse car je n'ai pas les liens et je ne peux que te les envoyer par mail...

    A+
    Vinc
    Primum non nocere.

  14. #43
    mantOs

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Citation Envoyé par Vinc Voir le message
    Salut!
    Bon moi c'est un truc un peu particulier que je vous propose car ce n'est pas un article (et par conséquent peut-être que ce n'est pas le bon fil...)! En tout cas ce que vous allez voir (en cliquant sur le lien plus bas ) est vraiment exceptionnel, perso je trouve ça beau, point final (et avec le son on pourrait presque pleurer ):

    http://aimediaserver.com/studiodaily...640&height=520

    Vinc

    EDIT: précisons bien sûr qu'absolument tout dans ce film a une réalité biologique....

    Merci pour cette vidéo vraiment superbe.

    J'avoue que j'ai pris un réel plaisir à la regarder et me suis amusé à essayer de retrouver chaque processus décris .

    Cordialement.
    Paul
    Desole pour l'absence d'accentuation, je suis sur clavier QWERTY.

  15. #44
    madfly

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Bonjour a tous. je trouve ce topic tres interessant et accepte volontiers d'y participer !!! Mais pourquoi restreindre aux quelques revues a fort impact factor ? En effet, les articles devraient etre selectionnés par nos soins justement sans passer sous les fourches caudines de la politique. Je vous propose plutot un systeme de focntionnement "thématique". On définit une dizaine quinzaine de thématiques en biologie et on propose chaque mois un article qui nous semble marquant en l'expliquant et le relativisant. Un peu le principe de la 'faculty of 1000" pour ceux qui connaissent.
    Pourquoi meme ne pas mettre un vote ou disons un accord du public pour par mois selectionner l'article qu'on trouve le plus marquant ???

  16. #45
    madfly

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    tu auras sans doute lu les derniers papiers sur hothead qui remettent au gout du jour l'hypothèse de la contamination de pollen dans le cas de reversion de hothead, du aux modifications de la sturcture de la paroi vegetale en contexte mutant... Point n'est forcement besoin de petits arns pour expliquer ce cas la. D'ailleurs l'equipe ayant publie hothead n'a rien ressorti depuis un moment, alors que je sais qu'ils sont justement etudie l'effet de mutants DICER ou argonautes. Et si tout cela n'etait qu'un effet d'annonce surfant un petit peu sur la mode epigenetique ?

  17. #46
    Yoyo

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Citation Envoyé par madfly Voir le message
    Bonjour a tous. je trouve ce topic tres interessant et accepte volontiers d'y participer !!! Mais pourquoi restreindre aux quelques revues a fort impact factor ? En effet, les articles devraient etre selectionnés par nos soins justement sans passer sous les fourches caudines de la politique.
    Salut

    c'est deja le cas puisque tu peux proposer un article de ton choix. MAintenant mon choix initial portait sur ces revues car elles proposent des articles de qualités et pouvant souvent intéréssé une vaste audience. Le but n'est pas de donner des articles hyper spécialisés qui n'interesseront qu'une ou deux personnes travaillant sur le sujet, mais plutot d'avoir une vision globale des avancées actuelles.

    Pour le reste ma réponse etait dans mon message #30

    YOyo

  18. #47
    gab

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Citation Envoyé par Vinc Voir le message

    Et puis le cytoplasme est plus une sorte de gel qu'un milieu liquide, or si tu représentes vraiment ce qu'il y a de dans, c'est impossible d'en faire un film car c'est beaucoup trop dense....

    Vinc
    Merci de cet aveu donc c'est forcément une vision fausse du système (propre à modèle tu me diras...) enfin...

    le lien a été effacé, il n'a aucun lien avec le message/ Yoyo

  19. #48
    gab

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Citation Envoyé par madfly Voir le message
    tu auras sans doute lu les derniers papiers sur hothead qui remettent au gout du jour l'hypothèse de la contamination de pollen dans le cas de reversion de hothead, du aux modifications de la sturcture de la paroi vegetale en contexte mutant... Point n'est forcement besoin de petits arns pour expliquer ce cas la. D'ailleurs l'equipe ayant publie hothead n'a rien ressorti depuis un moment, alors que je sais qu'ils sont justement etudie l'effet de mutants DICER ou argonautes. Et si tout cela n'etait qu'un effet d'annonce surfant un petit peu sur la mode epigenetique ?
    Tu viens de m'apprendre tout ça... d'abord merci.
    C'est pas trop une biblio sur laquelle je m'étends. Par contre je pense que tu peux avoir raison en ce qui concerne un effet d'annoce... mais il arrive parfois que les gens se déchainent sur des hypothèses aussi originales, et que quoiqu'il arrive, jusqu'à la preuve expériementale ultime (qui souvent n'existe pas) il reste des septiques (ou pseudo-sceptiques) qui surfent eux aussi sur l'effet d'annonce pour passer de piètres papier sur la paroi (dont on se tape) à science ou Nature... voire Cell....
    Voilà mon avis que je partage évidement (cf. descartes intro discours de ma méthode )

  20. #49
    madfly

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    eh bien a mon tour de diversisfier un peu les articles que vous citez. Je vous propose un peu d'immunologie aujourd'hui avec un article que je trouve tres elegant et magistral. Publié directement par le "pape" de l'immunité innée, ruslan medzhitov. Son titre : Toll-dependent selection of microbial antigens for presentation by dendritic cells. A savoir, une demonstration assez claire du lien entre l'activation de l'immunité innée et les cellules presentatrices d'antigenes, le tout au moyen de la voie toll, qui m'est chere !
    Bonne lecture a tous et voici le lien :
    http://www.ncbi.nlm.nih.gov.gate1.in...=pubmed_docsum

    a+

  21. #50
    CARO666

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Hello,
    l'idée du fil est bien, mais c'est frustrant de n'avoir accès qu'aux abstracts...

    CARO

  22. #51
    Yoyo

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Citation Envoyé par CARO666 Voir le message
    Hello,
    l'idée du fil est bien, mais c'est frustrant de n'avoir accès qu'aux abstracts...

    CARO
    oui mais on n'a pas le choix, les articles ne sont pas gratuits il faut donc payer pour les avoir. On aurait des problemes si on mettait les PDF ici...

    Yoyo

  23. #52
    synchrotron

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Bonjour,

    En fait, tous les articles ne sont pas payant, quelques-uns, selon leur importance ou leur ancienneté sont gratuits. Parfois, quand un article sort, il est directement gratuit, c'est rare, je ne sais pas sur quels critères ils se basent pour mettre un article gratuit mais ça se voit.

    Ce que je propose c'est que sur ce fil on essaye de mettre plutôt des articles gratuits car ça a aucun intérêt pour ceux qui ne sont pas en relation avec un labo de recherche. En cherchant un peu on peut arriver à trouver.

    Infos pour les novices des publis : quand vous allez sur le site majeur des publi (NCBI : Entrez PubMed), à la gauche des titres il y a un petit sigle. Quand il est vert, la publi est accessible dans son intégralité gratuitement.

    A titre d'exemple, voila une page où il y a 6 publis gratuites sur les exosomes (il y a un sigle vert à coté, je l'ai déjà dit) : exosomes Sur cette page, vous tapez "exosomes review" et vous tomberez sur la page en question.

    PS : sur les 6 publis gratuites, il y en a 2 qui sont cote à cote et qui sont des revues : "Prospects for exosomes in immunotherapy of cancer" et "Roles of exosomes in immune regulation". Franchement c'est très intéressant et complet...mais surtout gratuit! Au fait les exosomes c'est assez récent et ça offre une nouvelle vision de la bio cell mais surtout beaucoup de thérapies en vue!!!
    les hommes veulent tout connaitre de l'univers,les XTsiens se contentent de l'observer

  24. #53
    cazeph

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Citation Envoyé par Yoyo Voir le message
    oui mais on n'a pas le choix, les articles ne sont pas gratuits il faut donc payer pour les avoir.

    Yoyo
    yoyo pourquoi tu nous sers des phrases comme ca en nov 2006?
    c'est dit 12 fois dans ce fil, dont c'est pas l'objectif premier d'accord, mais quand meme vu l'enjeu... re-voila: en 3 ans, PLOS, pour ne citer qu'elle, a fourni la preuve que la publication d'articles de grande qualite interessant une large communaute n'OBLIGE PAS A FAIRE PAYER POUR L'ACCES NI LA REDIFFUSION des articles. si la trinite cell nature science ne le permet pas encore (on les comprend, c'est naturel de resister au changement surtout pour renoncer a des entrees d'argent), ils se rangeront sans doute POURVU QUE LES LECTEURS LES Y POUSSENT (ie bannir le discours fige du 'on n'a pas le choix'). on parle sans cesse de communication d'information, il faut que ce message passe !!! et le plus vite on l'integre, le plus vite on pourra TOUS lire nature science ou cell sans ecrire aux auteurs ou embeter les potes leur demandant un pdf (je fremis a l'idee qu'il y en ait qui versent vraiment 30$ a ces maisons d'edition pour se faire envoyer un article..... )
    en attendant, et pour repondre au message de CARO, c'est clair qu'ON PEUT TOUJOURS SE LES PROCURER SANS DEBOURSER (donc je propose surtout pas d'exclure ces articles de la discussion, ce serait trop dommage) juste que ce serait rendre service a la cause que d'eviter d'ecrire ca sachant qu'en pratique ils ne sont payants qu'AUX ABONNES ET AUX FOUS, et que tous ceux qui ne se reconnaissent pas dans ceux-la en dependent pour se les procurer.
    la fois prochaine, un article, j'essaye.

  25. #54
    Yoyo

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Cazeph,

    Tu peux ne pas etre d'accord avec la maniere de diffusion de l'actualité scientifique, mais une chose est certains, les articles de science, nature ou cell ne sont pas disponible sans abonnement. nous serions donc dans l'illégalité si nous les mettions a disposition, c'est pas plus compliqué que ca.
    maintenant ce n'est pas le propos de ce topic, alors merci de ne pas continuer la dessus.

    Je suis quand meme surpris que personne n'ait fourni le moindre article ces derniers temps malgré les nouveautés qui ont été publiées?!
    Yoyo

  26. #55
    javiou

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Salut,

    Je ne sais pas si on a déjà parlé de ce site sur ce forum, si oui, ce sera une redondance utile, enfin je pense...

    http://hal.archives-ouvertes.fr/inde...75c8cb842115c1

    C'est HAL pour Hyper Article en Ligne.

  27. #56
    synchrotron

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Salut,

    Hé Yoyo tu la joue un peu fort là en disant que personne n'a proposé de publi ces derniers temps! T'as oublié mon post ou je met en lumière les publis gratuites de journaux payants.

    Et je défends encore mon idée en vous envoyant sur cette publi à accès gratuit et très intéressante, surtout très synthétique puisque c'est une revue. Le titre traduit en français (pour donner envie aux réticents de la langue anglaise de la lire) c'est : "Approches génomiques qui aident dans l'identification de gènes cibles de facteurs de transcription".

    Vous trouverez l'abstract ici. Ya plus qu'à télécharger le pdf (gratuit s'il vous plait!!) .

    Décidément j'aime bien les revues en ce moment!

    A+.
    les hommes veulent tout connaitre de l'univers,les XTsiens se contentent de l'observer

  28. #57
    Borh

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    L'edito du Nature de ce mois porte sur la France "French Science after Chirac". Et le moins qu'on puisse dire c'est que le ton de cet article est péjoratif. Il revient sur les coupes dans le budget de la recherche effectué durant les 2 mandats Chirac. Des futures coupes annoncées dans la recherche sur les sciences de la vie au CNRS car "researchers' performance are not up to scratch in this sector which consumes a third of the agency's budget". Il parle aussi du gros retard de la recherche Française par rapport à la recherche Britannique, de la lourdeur bureaucratique du CNRS.
    Quelques points positifs selon l'article : les réformes entrainant la compétition entre les unités afin de recevoir un financement public en fonction des publications. Egalement la future présidentielle, Sarkozy ou Royal partisans de la politique de rupture sont à même de changer les choses.
    Bon voilà, perso, je sais que certaines choses dans cet edito sont vraies, mais ça me parait quand même trop négatif. J'y reconnais une certaine influence de la pensée des chercheurs Français exilés à l'étranger qui sont souvent une vision extrêmement critique (d'où leur départ) et qui ne manquent pas de la faire partager à leurs collèguesde leur pays d'accueil.

  29. #58
    Gaïalhambra

    Wink Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Citation Envoyé par Vinc Voir le message
    Salut!
    Bon moi c'est un truc un peu particulier que je vous propose car ce n'est pas un article (et par conséquent peut-être que ce n'est pas le bon fil...)! En tout cas ce que vous allez voir (en cliquant sur le lien plus bas ) est vraiment exceptionnel, perso je trouve ça beau, point final (et avec le son on pourrait presque pleurer ):

    http://aimediaserver.com/studiodaily...640&height=520

    Vinc

    EDIT: précisons bien sûr qu'absolument tout dans ce film a une réalité biologique....
    Vraiment c'est magnifique...
    Merci beaucoup pour ce lien !
    Il y a pourtant une ou deux choses que je n'ai pas reconnues, notament la grosse prot qui se déplace comme en marchant ?!
    Et je voudrais juste proposer une review parue dans cell en 2002, ça n'est pas récent mais l'hypothèse proposée met en doute le déroulement des étapes de transcription et traduction montrées dans ce film.

    (Je ne sais pas trop si vous voulez bien des revues ?)

    http://www.sciencedirect.com/science...8b9bd369cc6d5c

  30. #59
    seminole

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    http://aimediaserver.com/studiodaily...h=640&height=5 20

    C'est super, il en faudrait encore plus

  31. #60
    kinette

    Re : Articles importants dans Nature, Science ou Cell

    Citation Envoyé par Borh Voir le message
    L'edito du Nature de ce mois porte sur la France "French Science after Chirac". Et le moins qu'on puisse dire c'est que le ton de cet article est péjoratif. Il revient sur les coupes dans le budget de la recherche effectué durant les 2 mandats Chirac. Des futures coupes annoncées dans la recherche sur les sciences de la vie au CNRS car "researchers' performance are not up to scratch in this sector which consumes a third of the agency's budget". Il parle aussi du gros retard de la recherche Française par rapport à la recherche Britannique, de la lourdeur bureaucratique du CNRS.
    Quelques points positifs selon l'article : les réformes entrainant la compétition entre les unités afin de recevoir un financement public en fonction des publications. Egalement la future présidentielle, Sarkozy ou Royal partisans de la politique de rupture sont à même de changer les choses.
    Bon voilà, perso, je sais que certaines choses dans cet edito sont vraies, mais ça me parait quand même trop négatif. J'y reconnais une certaine influence de la pensée des chercheurs Français exilés à l'étranger qui sont souvent une vision extrêmement critique (d'où leur départ) et qui ne manquent pas de la faire partager à leurs collèguesde leur pays d'accueil.
    Hello,
    J'ai lu l'article, et, peut-être parce que je suis à l'étranger (et très heureuse d'y être) mais je suis plutôt d'accord avec les points négatifs dont parle l'article.
    Par contre, ils célèbrent à mon avis un peu trop l'effet positif que pourrait avoir une augmentation de la concurrence: trop de concurrence nuit aux collaborations entre équipes, entraîne souvent de sales ambiances... bref, la concurence c'est bien quand ça n'est pas une concurrence exacerbée pour la survie (je pense qu'on peut facilement expliquer les effets positifs et négatifs de la concurrence en regardant du côté des études sur la coopération: un niveau modéré de compétition favorise la coopération, et une augmentation globale de la "productivité", tandis qu'une compétition exacerbée aura un résultat catastrophique).

    Bref, si on augmente la concurrence et on augmente aussi les budgets, le niveau global de la recherche pourra augmenter... sinon, c'est pas certain du tout!

    Enfin l'article de Nature parle aussi des zones d'ombre pouvant exister sur les critères de choix utilisés par l'ANR pour attribuer des fonds: problème de manque d'évaluation externe...

    K.
    Nomina si nescis, perit et cognito rerum.

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