Analyse de Séquence +python

[invite5592f8d2]

Bonsoir à tous , je dois travailler sur un projet d'analyse de séquence d'ADN grace à python. Mes connaissances étant assez restreintes , apres avoir fait des recherches , je rencontre certains problèmes .
Apres avoir recueilli des séquences ,le sujet ne me donne que peu d'indications sur les démarches attendues ,ainsi il parle de calculer des frequences de nucléotide , mais je ne vois vraiment pas ce que je pourrais faire d'autres ... j'ai également pensé à faire des tests du chi 2 , mais je ne vois pas comment cela pourrait se concrétiser ...
Je vous serais reconnaissant si vous pouviez m'apporter des idées ou des liens a lire ,qui pourraient me faire avancer ,les limites du sujet étant vagues . Merci beaucoup ,bonne soirée à tous .
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[invite5592f8d2]

Ma demande porte sur: "la méthode d'analyse de contenu du génome" .
Comment procède t' on avec python pour analyser le génome d'une E.coli ,par exemple .
Merci par avance .

[invite8c0cc995]

Le python est un langage de programmation, ce n'est donc qu'un outil te permettant de faire fonctionner un algorithme.
C'est donc d'abord à toi de déterminer comment tu veux analyser le génome, puis d'écrire l'algo correspondant.
Je te suggère de regarder ici : http://noble.gs.washington.edu/~noble/genome373/
notamment en bas de page, tu as des cours de programmation en python, appliqués à la génomique

[invite17a570c1]

Très sympa ton lien, Ing

Faudra aussi faire un tour sur le site de python après avoir défini ce que tu fais : http://www.python.org/

[A voir en vidéo sur Futura]