Bonjour à tous.
Voilà.. J'ai une structure cristallographique d'une proteine qui n'ai pas encore publiée. Il existe dans cette proteine une liaison covalente entre une ASN et une LYS. ce qui se passe en fait c'est une attaque nucléophile de l'azote de la chaine laterale de la lysine sur le carbone de l'ASN, resulant a la creation d'une vraie liaison et au départ du NH2 de l'asparagine (le c=o étant conservé). Comment faire que les logiciels de visualisation (pymol) interprete correctement cette liaison et l'affiche bien? Je ne sais pas comment modifier le fichier pdb. La fonction "Link" ne marchant pas.
Merci par avance.
Thierry. Thésard en biologie structurale
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