[Microbiologie] Isolation ARNm bacterien
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Isolation ARNm bacterien



  1. #1
    invite3c05c2cb

    Isolation ARNm bacterien


    ------

    Bonjour à tous!
    Je dois isoler l'ARNm de bacteries dans le but de faire des analyse d'expression génomique et de transcirptomique et je voudrais savoir si quelqu'un à une méthode qu'il a déjà essayé (ou un kit en particulier) et qui fonctionne bien.
    Je sais qu'il existe quelques kit mais je suis perplexe.. pour l'ARNm d'eucaryote je comprend que la selection se fait par la queue polyA de l'ARNm mais les procaryotes n'en ont pas.. Sinon les methode que j'ai vue son des methodes de précipitation de l'ARNm dans un pool d'ARN total.. mais je n'ai pas de références d'articles pour valider cette méthode qui flottait sur internet...
    alors en bref:
    1. Avez-vous une bonne suggestions de methode (ou kit) d'extraction d'ARNm bactériens que vous approuvez personnellement
    2. Quel est le principe de fonctionnement pour la sélection de l'ARNm

    Je vous remercie d'avance

    -----

  2. #2
    Flyingbike
    Modérateur*

    Re : Isolation ARNm bacterien

    tu as réellement besoin d'isoler les mRNA ? tu ne peux pas bosser sur des totaux ?

  3. #3
    invite3c05c2cb

    Re : Isolation ARNm bacterien

    ben en fait c'que jvx c'est faire un un analyse par RNA-seq pis ca prends une banque de cDNA mais pour faire la banque j'dois partir de mRNA.. Honnetement je suis pas certaine si j'px juste partir de l'ARNtotale...

    Tu es sur un forum, pas sur MSN, ni sur un tchat. Merci de prendre le temps d'écrire correctement. c'est le premier des respects. Au passage une relecture de notre charte serait utile!. merci. Yoyo
    Dernière modification par Yoyo ; 20/10/2009 à 18h57.

  4. #4
    invitee8b3f97e

    Re : Isolation ARNm bacterien

    Hello,

    je suppose que tu comptes obtenir ta banque de cDNA par RT-PCR ? Si c'est le cas il me semble que cette technique n'amplifie que les mRNA (mais je ne suis pas un grand spécialiste des ARN).

    Toutes les méthodes d'extraction d'acides nucléiques marchent pour l'extraction des ARN totaux. Je ne connais pas de méthode qui isole spécifiquement les ARNm.

  5. A voir en vidéo sur Futura

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